91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11407 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  100 
 
 
475 aa  942    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  71.89 
 
 
430 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  71.89 
 
 
430 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  75.57 
 
 
411 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  73.58 
 
 
424 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  76.31 
 
 
377 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  76.31 
 
 
377 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  64.06 
 
 
434 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  64.06 
 
 
434 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  64.06 
 
 
434 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  61.89 
 
 
426 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5297  hypothetical protein  60.51 
 
 
430 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  0.0820458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  61.08 
 
 
430 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  57.95 
 
 
436 aa  464  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3614  hypothetical protein  58.3 
 
 
466 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456506  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  59.04 
 
 
426 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  47.75 
 
 
474 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  48.26 
 
 
547 aa  365  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  55.75 
 
 
457 aa  357  3.9999999999999996e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  53.04 
 
 
479 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2657  hypothetical protein  58.16 
 
 
340 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2758  hypothetical protein  49.08 
 
 
441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.284489  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  45.76 
 
 
405 aa  299  8e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1474  hypothetical protein  59.62 
 
 
268 aa  296  8e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  44.22 
 
 
404 aa  291  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  44.73 
 
 
405 aa  287  2.9999999999999996e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  44.73 
 
 
403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  45.43 
 
 
423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  46.19 
 
 
410 aa  280  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  45.22 
 
 
408 aa  271  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  44.5 
 
 
404 aa  266  5.999999999999999e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  45.24 
 
 
437 aa  265  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  37.31 
 
 
481 aa  227  4e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  47.33 
 
 
256 aa  187  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  35.61 
 
 
555 aa  179  9e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26830  hypothetical protein  34.22 
 
 
494 aa  159  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13330  hypothetical protein  33.33 
 
 
545 aa  154  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  30.77 
 
 
594 aa  148  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23450  HNH endonuclease  32.99 
 
 
541 aa  144  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0981004  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30380  HNH endonuclease  29.55 
 
 
589 aa  138  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  32.84 
 
 
510 aa  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  26.49 
 
 
507 aa  97.8  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  28.3 
 
 
556 aa  97.4  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  27.48 
 
 
508 aa  93.2  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  26.41 
 
 
580 aa  93.2  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  26.18 
 
 
535 aa  91.3  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  25.63 
 
 
499 aa  90.1  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  28.73 
 
 
567 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  29.36 
 
 
426 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  26.54 
 
 
566 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  24.94 
 
 
620 aa  84  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  26.52 
 
 
568 aa  80.9  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  28.65 
 
 
443 aa  80.5  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  28.86 
 
 
443 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  29.28 
 
 
516 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  27.1 
 
 
511 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  28.04 
 
 
480 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  28.04 
 
 
480 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  28.44 
 
 
488 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  27.79 
 
 
480 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  34.08 
 
 
748 aa  68.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  30.38 
 
 
310 aa  67  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  31.4 
 
 
602 aa  66.6  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  30.41 
 
 
585 aa  66.6  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  29.79 
 
 
628 aa  65.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  26.2 
 
 
512 aa  64.3  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  31.84 
 
 
584 aa  64.3  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  31.55 
 
 
530 aa  63.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  31.71 
 
 
714 aa  62  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  32.54 
 
 
551 aa  61.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  29.8 
 
 
222 aa  60.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  31.84 
 
 
558 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  30.81 
 
 
580 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  32.14 
 
 
637 aa  57.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  30.5 
 
 
603 aa  58.2  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  26.4 
 
 
484 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  28 
 
 
605 aa  54.7  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  28.87 
 
 
567 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  28.39 
 
 
523 aa  52.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  35.61 
 
 
553 aa  52  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  28.51 
 
 
519 aa  51.2  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  31.65 
 
 
539 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  40.45 
 
 
582 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5313  HNH endonuclease  28.57 
 
 
173 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1153  HNH endonuclease  28.57 
 
 
171 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  28.19 
 
 
508 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  28.19 
 
 
508 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  27.86 
 
 
498 aa  46.6  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  26.42 
 
 
521 aa  46.6  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  32.86 
 
 
519 aa  44.3  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  40.98 
 
 
164 aa  43.5  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>