70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_13330 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_13330  hypothetical protein  100 
 
 		 545 aa  1100    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23450  HNH endonuclease  64.03 
 
 		 541 aa  610  1e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0981004  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26830  hypothetical protein  45.77 
 
 		 494 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30380  HNH endonuclease  39.5 
 
 		 589 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  34.12 
 
 		 479 aa  156  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  35.44 
 
 		 430 aa  156  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  31.71 
 
 		 555 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  35.44 
 
 		 430 aa  156  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  33.64 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  33.64 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  33.64 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  33.33 
 
 		 474 aa  154  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  32.29 
 
 		 457 aa  153  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  29.58 
 
 		 594 aa  153  8.999999999999999e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  34.29 
 
 		 426 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  33.92 
 
 		 475 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  34.9 
 
 		 377 aa  148  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  34.9 
 
 		 377 aa  148  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  34.9 
 
 		 411 aa  148  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  29.86 
 
 		 547 aa  146  8.000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  32.08 
 
 		 423 aa  144  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  32.26 
 
 		 424 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  33.56 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  32.91 
 
 		 426 aa  139  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  34.55 
 
 		 437 aa  139  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5297  hypothetical protein  34.26 
 
 		 430 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  0.0820458 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2758  hypothetical protein  33.83 
 
 		 441 aa  130  9.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.284489  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  31.41 
 
 		 430 aa  127  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3614  hypothetical protein  33 
 
 		 466 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456506  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  31.63 
 
 		 410 aa  121  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  31.74 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  30.54 
 
 		 403 aa  118  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  26.21 
 
 		 481 aa  116  8.999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  30.54 
 
 		 408 aa  116  8.999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  30.54 
 
 		 405 aa  116  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  35.78 
 
 		 256 aa  114  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  28.96 
 
 		 404 aa  110  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  29.27 
 
 		 404 aa  109  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1474  hypothetical protein  35.64 
 
 		 268 aa  104  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  30.86 
 
 		 567 aa  84.7  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  31.64 
 
 		 426 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  29.41 
 
 		 510 aa  78.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  29.47 
 
 		 508 aa  76.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2657  hypothetical protein  28.41 
 
 		 340 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  25.91 
 
 		 556 aa  68.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  25.64 
 
 		 516 aa  65.1  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  27.43 
 
 		 512 aa  63.9  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  32.17 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  28.62 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  31.4 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  23.21 
 
 		 568 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  23.83 
 
 		 507 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  24.15 
 
 		 620 aa  54.3  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  22 
 
 		 566 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  31.19 
 
 		 222 aa  52  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  30.34 
 
 		 628 aa  52  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  25.35 
 
 		 511 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  34.29 
 
 		 530 aa  50.4  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  27.1 
 
 		 585 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  34.29 
 
 		 551 aa  49.7  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  28.7 
 
 		 441 aa  48.5  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5865  hypothetical protein  27.23 
 
 		 511 aa  46.6  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3231  hypothetical protein  26.29 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  24.7 
 
 		 488 aa  45.8  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  32.18 
 
 		 561 aa  45.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  30.19 
 
 		 442 aa  45.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  23.93 
 
 		 580 aa  44.7  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  32.47 
 
 		 561 aa  44.3  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  22.45 
 
 		 499 aa  43.9  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  26.67 
 
 		 558 aa  43.9  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>