120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12134 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  100 
 
 
550 aa  1100    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  77.84 
 
 
519 aa  684    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  49.39 
 
 
514 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  50.1 
 
 
508 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  50.1 
 
 
508 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  44.2 
 
 
581 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  49.59 
 
 
508 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  44.2 
 
 
581 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  49.59 
 
 
508 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  49.4 
 
 
491 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  49.4 
 
 
491 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  49.2 
 
 
491 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  50 
 
 
516 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  44.2 
 
 
578 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  46.01 
 
 
582 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3176  hypothetical protein  44.28 
 
 
601 aa  390  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436761  normal  0.0313411 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  43.86 
 
 
578 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  43.29 
 
 
571 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2144  hypothetical protein  43.35 
 
 
593 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170651  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  47.87 
 
 
532 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  46.05 
 
 
546 aa  383  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  43.12 
 
 
593 aa  382  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  43.12 
 
 
593 aa  382  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  47.47 
 
 
506 aa  381  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5188  hypothetical protein  43.64 
 
 
586 aa  378  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0262711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  48 
 
 
512 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  42.86 
 
 
601 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  42.66 
 
 
539 aa  354  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  44.07 
 
 
519 aa  347  3e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  44.05 
 
 
517 aa  344  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  43.24 
 
 
524 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  40.43 
 
 
550 aa  324  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  41.33 
 
 
511 aa  325  2e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  43.02 
 
 
488 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  42.77 
 
 
480 aa  301  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  42.77 
 
 
480 aa  301  3e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  42.34 
 
 
480 aa  299  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  39.24 
 
 
464 aa  263  6e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  38.86 
 
 
473 aa  243  7e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  43.7 
 
 
516 aa  229  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  44.66 
 
 
441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3422  hypothetical protein  47.84 
 
 
620 aa  209  7e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.023087  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  38.54 
 
 
484 aa  206  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  38.06 
 
 
567 aa  206  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  42.56 
 
 
578 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  42.56 
 
 
578 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  43.65 
 
 
535 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  29.65 
 
 
519 aa  121  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  29.76 
 
 
566 aa  120  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4350  hypothetical protein  27.95 
 
 
579 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000306151  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  45.37 
 
 
709 aa  90.5  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  43.45 
 
 
620 aa  87.4  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  48.39 
 
 
637 aa  84.3  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  46.07 
 
 
748 aa  82.4  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00460  HNH endonuclease  46.39 
 
 
565 aa  82.4  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  45.88 
 
 
743 aa  81.3  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  46.15 
 
 
434 aa  81.3  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3219  HNH endonuclease  46.15 
 
 
427 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125237  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  30.17 
 
 
535 aa  79.3  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  44.44 
 
 
535 aa  78.2  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  28.54 
 
 
566 aa  78.2  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  44.55 
 
 
628 aa  77.4  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  28.48 
 
 
530 aa  77.4  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  27.17 
 
 
426 aa  77.4  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  29.08 
 
 
499 aa  77  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10401  13E12 repeat-containing protein  52.75 
 
 
122 aa  77  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  28.09 
 
 
567 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4696  hypothetical protein  46.15 
 
 
635 aa  75.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1741  hypothetical protein  31.01 
 
 
475 aa  75.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  28.78 
 
 
585 aa  74.3  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  42.86 
 
 
602 aa  74.3  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  45.36 
 
 
198 aa  73.6  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  45.65 
 
 
443 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  29.38 
 
 
580 aa  71.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  28.68 
 
 
620 aa  71.2  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0740  hypothetical protein  33.75 
 
 
618 aa  71.2  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  42.59 
 
 
498 aa  70.9  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  42.59 
 
 
605 aa  70.9  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  44.57 
 
 
443 aa  70.5  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  29.44 
 
 
568 aa  70.1  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  42.39 
 
 
714 aa  67.4  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  34.19 
 
 
510 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3499  HNH endonuclease  43.53 
 
 
117 aa  66.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  29.87 
 
 
558 aa  66.2  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  50 
 
 
551 aa  63.9  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  25.87 
 
 
512 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  50 
 
 
580 aa  61.6  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  50 
 
 
584 aa  61.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  46.67 
 
 
603 aa  60.1  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  30.82 
 
 
556 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  39.36 
 
 
169 aa  58.9  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  37.23 
 
 
516 aa  57.8  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  26.7 
 
 
442 aa  57.4  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  27.08 
 
 
432 aa  56.6  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1476  HNH endonuclease  29.65 
 
 
586 aa  56.6  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266278  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3886  hypothetical protein  29.41 
 
 
554 aa  55.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00540166  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11717  hypothetical protein  25.44 
 
 
454 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.12455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3616  HNH endonuclease  49.09 
 
 
131 aa  53.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289369  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1354  hypothetical protein  49.02 
 
 
496 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0062  hypothetical protein  28.46 
 
 
572 aa  49.7  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>