152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4022 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  88.87 
 
 
593 aa  977    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  89.51 
 
 
581 aa  993    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  100 
 
 
578 aa  1167    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  88.87 
 
 
593 aa  977    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  89.51 
 
 
581 aa  993    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  100 
 
 
578 aa  1167    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  90.86 
 
 
578 aa  987    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  91.03 
 
 
578 aa  987    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  49.48 
 
 
519 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  48.09 
 
 
517 aa  434  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  48.53 
 
 
524 aa  429  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  43.64 
 
 
550 aa  367  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  40.14 
 
 
539 aa  350  4e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2144  hypothetical protein  38.18 
 
 
593 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170651  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  38.69 
 
 
550 aa  334  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  39.54 
 
 
582 aa  322  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5188  hypothetical protein  39.72 
 
 
586 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0262711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  37.87 
 
 
601 aa  321  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  37.84 
 
 
514 aa  320  6e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  37.48 
 
 
508 aa  316  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  37.48 
 
 
508 aa  316  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3176  hypothetical protein  37.76 
 
 
601 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436761  normal  0.0313411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  37.93 
 
 
571 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  37.41 
 
 
491 aa  300  5e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  37.41 
 
 
491 aa  300  5e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  37.83 
 
 
546 aa  297  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  37.25 
 
 
516 aa  293  7e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  37.73 
 
 
508 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  37.73 
 
 
508 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  36.09 
 
 
532 aa  291  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3422  hypothetical protein  39.29 
 
 
620 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.023087  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  54.81 
 
 
535 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  43.98 
 
 
516 aa  260  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  64.16 
 
 
480 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  31.8 
 
 
506 aa  209  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  64.16 
 
 
480 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  64.16 
 
 
480 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  56.84 
 
 
488 aa  204  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  56.84 
 
 
511 aa  204  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  49.57 
 
 
519 aa  200  7e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  56.89 
 
 
491 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  52.63 
 
 
441 aa  170  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  43.75 
 
 
464 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  54.93 
 
 
473 aa  162  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  38.1 
 
 
512 aa  159  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  45.58 
 
 
567 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  45.58 
 
 
484 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4350  hypothetical protein  27.75 
 
 
579 aa  118  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000306151  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  51.76 
 
 
620 aa  88.6  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1741  hypothetical protein  28.24 
 
 
475 aa  87.4  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10401  13E12 repeat-containing protein  53.26 
 
 
122 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0740  hypothetical protein  33.03 
 
 
618 aa  85.1  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  38.46 
 
 
628 aa  84.3  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  47.19 
 
 
709 aa  84  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  46.51 
 
 
748 aa  83.6  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  44.57 
 
 
434 aa  82  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  42.98 
 
 
602 aa  82  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  44.76 
 
 
535 aa  79.7  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3219  HNH endonuclease  44.57 
 
 
427 aa  80.1  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125237  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  44.94 
 
 
637 aa  80.1  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  43.14 
 
 
530 aa  77.8  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  33.33 
 
 
743 aa  77  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  30.74 
 
 
499 aa  76.6  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  29.92 
 
 
519 aa  76.6  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  40.54 
 
 
714 aa  76.3  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  36.36 
 
 
566 aa  75.1  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4696  hypothetical protein  44.76 
 
 
635 aa  74.3  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3499  HNH endonuclease  43.18 
 
 
117 aa  73.9  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  37.9 
 
 
443 aa  73.6  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  39.52 
 
 
605 aa  73.6  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  45.92 
 
 
498 aa  72.4  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  31.35 
 
 
551 aa  71.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  43.16 
 
 
567 aa  71.6  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  41.41 
 
 
198 aa  70.9  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00460  HNH endonuclease  42.42 
 
 
565 aa  70.9  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  33.15 
 
 
580 aa  70.5  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  41.05 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  46.43 
 
 
535 aa  69.3  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  45.88 
 
 
580 aa  68.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  37.1 
 
 
443 aa  68.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  45.88 
 
 
558 aa  68.2  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  45.88 
 
 
584 aa  68.2  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  41.94 
 
 
516 aa  68.2  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  35.04 
 
 
510 aa  67.8  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  38.89 
 
 
568 aa  67.4  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  38.89 
 
 
620 aa  67  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  55 
 
 
603 aa  67  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  37.96 
 
 
585 aa  66.6  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  40.59 
 
 
512 aa  65.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  38.89 
 
 
566 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  35.51 
 
 
556 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  35.48 
 
 
3521 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  39.18 
 
 
169 aa  63.5  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  33.02 
 
 
3471 aa  63.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  33.02 
 
 
3472 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3616  HNH endonuclease  45 
 
 
131 aa  61.2  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289369  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  44.29 
 
 
553 aa  60.8  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  31.48 
 
 
508 aa  57.4  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  36.67 
 
 
2272 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  33.33 
 
 
391 aa  57  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>