69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1015 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1015  HNH endonuclease  100 
 
 
191 aa  389  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1061  HNH endonuclease  75.26 
 
 
118 aa  156  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.255023  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4428  hypothetical protein  50.83 
 
 
160 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.580751 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2745  HNH endonuclease  46.43 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00704731  normal  0.0103404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3731  HNH endonuclease  37.5 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  35.29 
 
 
199 aa  50.8  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  50 
 
 
424 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  31.2 
 
 
166 aa  48.5  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  31.2 
 
 
166 aa  48.5  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  40.54 
 
 
177 aa  48.5  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  33.81 
 
 
177 aa  48.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  39.44 
 
 
177 aa  47.8  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0063  hypothetical protein  34.72 
 
 
363 aa  47.8  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  42.55 
 
 
146 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0313  HNH endonuclease  40.98 
 
 
354 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  39.76 
 
 
180 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5313  HNH endonuclease  36.63 
 
 
173 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  40 
 
 
204 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  28.26 
 
 
183 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1153  HNH endonuclease  35.64 
 
 
171 aa  45.1  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  47.83 
 
 
174 aa  45.1  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  40 
 
 
198 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3897  HNH endonuclease  40 
 
 
133 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  40 
 
 
198 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  27.54 
 
 
182 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  43.24 
 
 
481 aa  44.3  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  27.54 
 
 
183 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1807  HNH endonuclease  47.62 
 
 
148 aa  44.3  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.236677  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  50 
 
 
403 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  39.68 
 
 
164 aa  43.5  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  38.16 
 
 
189 aa  43.5  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  31.65 
 
 
168 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4527  HNH endonuclease  40.91 
 
 
142 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000580213  normal  0.505709 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0868  HNH endonuclease  46.34 
 
 
165 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  34.25 
 
 
194 aa  43.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  44.74 
 
 
479 aa  43.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  50 
 
 
405 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  47.37 
 
 
404 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  32.86 
 
 
196 aa  42.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  35.23 
 
 
185 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  40.91 
 
 
474 aa  42.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1080  HNH endonuclease  31.58 
 
 
228 aa  42.4  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0178518  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  47.37 
 
 
404 aa  42.4  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  47.37 
 
 
405 aa  42.4  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  37.1 
 
 
170 aa  42  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2778  HNH endonuclease  36.47 
 
 
221 aa  42  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2596  HNH endonuclease domain-containing protein  30.67 
 
 
196 aa  42.4  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.821966  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  37.5 
 
 
181 aa  42  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  39.19 
 
 
184 aa  42  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  46.67 
 
 
165 aa  41.6  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  47.62 
 
 
221 aa  41.6  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0037  HNH nuclease  48.65 
 
 
131 aa  41.6  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  32.76 
 
 
547 aa  41.6  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  30.66 
 
 
182 aa  41.6  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  47.92 
 
 
220 aa  41.6  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  50 
 
 
426 aa  41.6  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1162  HNH endonuclease  34.72 
 
 
194 aa  41.2  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00934225 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  36.92 
 
 
197 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2650  HNH endonuclease  39.02 
 
 
236 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.479892 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  35.06 
 
 
189 aa  41.6  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2411  HNH endonuclease  48.48 
 
 
315 aa  41.2  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0987  HNH nuclease  45.95 
 
 
113 aa  41.2  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.565231  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  31.03 
 
 
475 aa  41.2  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  40.32 
 
 
179 aa  41.2  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  41.67 
 
 
165 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  48.65 
 
 
113 aa  41.2  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  50 
 
 
165 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1158  HNH endonuclease  28.12 
 
 
360 aa  41.2  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.161614  normal  0.0199852 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  50 
 
 
165 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>