18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4428 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011879  Achl_4428  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  335  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.580751 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1061  HNH endonuclease  55.32 
 
 
118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.255023  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1015  HNH endonuclease  55.32 
 
 
191 aa  94.4  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2745  HNH endonuclease  45.45 
 
 
149 aa  89  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00704731  normal  0.0103404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3731  HNH endonuclease  35.61 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  38.03 
 
 
177 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  38.03 
 
 
177 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2650  HNH endonuclease  32.86 
 
 
236 aa  44.3  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.479892 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0855  HNH endonuclease  39.44 
 
 
230 aa  41.6  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000164704  hitchhiker  0.000000000578298 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  48.78 
 
 
166 aa  42  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  43.4 
 
 
166 aa  42  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  34.62 
 
 
179 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  36.21 
 
 
204 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  36.36 
 
 
198 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  36.36 
 
 
198 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  37.14 
 
 
560 aa  40.8  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  30.85 
 
 
171 aa  40.8  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  32.95 
 
 
167 aa  40.4  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>