More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4189 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
316 aa  608  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.255548  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04080  carbohydrate ABC transporter membrane protein  48.43 
 
 
294 aa  263  2e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.81 
 
 
299 aa  258  1e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062931 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.49 
 
 
295 aa  255  7e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.767086  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  47.99 
 
 
313 aa  239  4e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000718721  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.51 
 
 
314 aa  224  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.51197  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06580  carbohydrate ABC transporter membrane protein  42.63 
 
 
318 aa  225  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.61 
 
 
297 aa  220  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04010  carbohydrate ABC transporter membrane protein  46.6 
 
 
312 aa  214  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03910  carbohydrate ABC transporter membrane protein  43.65 
 
 
326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.669588 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1763  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  39.2 
 
 
323 aa  210  2e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0129756  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.61 
 
 
304 aa  206  5e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.058143  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
310 aa  204  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0186923 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.64 
 
 
314 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.5 
 
 
296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0579092  normal  0.0820796 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.58 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.07 
 
 
305 aa  193  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0929  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  39.26 
 
 
308 aa  190  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.574591  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.16 
 
 
278 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264075  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1007  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  37.25 
 
 
320 aa  183  3e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324625  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.01 
 
 
298 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0911213  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1443  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.45 
 
 
303 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0903613  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.45 
 
 
296 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.05 
 
 
295 aa  132  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727517  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.95 
 
 
298 aa  129  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.9 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.43 
 
 
306 aa  123  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.157384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 
288 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.01 
 
 
299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000030377  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
353 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.84 
 
 
327 aa  119  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0175684  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0477  ABC tranporter, permease protein  26.83 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.29 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000228392  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.702273  normal  0.0136241 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.01 
 
 
330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6585  lactose transport system (permease)  36.99 
 
 
306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.25 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.00155627 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7347  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  28.95 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.95 
 
 
311 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29440  permease component of ABC-type sugar transporter  30.61 
 
 
318 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  31.16 
 
 
287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
324 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.455385  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11610  permease component of ABC-type sugar transporter  32.04 
 
 
311 aa  113  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.117578  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  26.43 
 
 
317 aa  112  6e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.46 
 
 
308 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172129  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.27 
 
 
318 aa  112  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.92 
 
 
318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949955  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1875  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  29.49 
 
 
350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0432685  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.16 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0625824  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.78 
 
 
316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0497455  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8235  ABC transporter, permease protein  33.72 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.7 
 
 
303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000249122  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.49 
 
 
297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.93 
 
 
306 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05100  permease component of ABC-type sugar transporter  31.74 
 
 
316 aa  109  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 
322 aa  109  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.946878  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27700  permease component of ABC-type sugar transporter  29.43 
 
 
321 aa  109  7.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.479477 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.08 
 
 
328 aa  109  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.913769 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.3 
 
 
299 aa  109  8.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.175132  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.45 
 
 
295 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000506379  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.88 
 
 
338 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.786552  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21160  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.11 
 
 
314 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103465  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 
298 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06940  hypothetical protein  28.98 
 
 
329 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06280  permease component of ABC-type sugar transporter  32.27 
 
 
303 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.51 
 
 
328 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0926617  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
294 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
335 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0186858  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3250  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  30.53 
 
 
310 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
322 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.396467  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.14 
 
 
310 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.19 
 
 
311 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17058  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03080  permease component of ABC-type sugar transporter  31.58 
 
 
322 aa  107  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.48 
 
 
307 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.16 
 
 
299 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190071 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.16 
 
 
293 aa  106  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990678  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.47 
 
 
299 aa  106  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.4 
 
 
294 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
310 aa  106  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00881  ABC transporter sugar permease  29.05 
 
 
294 aa  106  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0244413  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.22 
 
 
312 aa  106  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.308461  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1900  sugar ABC transporter, permease protein, putative  27.94 
 
 
314 aa  105  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1635  sugar ABC transporter, permease  27.94 
 
 
314 aa  105  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.68 
 
 
322 aa  106  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 
328 aa  105  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.152171  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.24 
 
 
293 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.56 
 
 
317 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02940  carbohydrate ABC transporter membrane protein  28.85 
 
 
318 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1182  sugar ABC transporter, permease protein, putative  31.52 
 
 
319 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547049  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.57 
 
 
309 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
318 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.152531  normal  0.26367 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1085  putative sugar ABC transporter, permease protein  31.52 
 
 
319 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0935  multiple sugar transport system permease protein  29.14 
 
 
328 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36894  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11550  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.55 
 
 
354 aa  103  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.0144146 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.09 
 
 
316 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.2607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3307  sugar transport system (permease)  30.39 
 
 
325 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1606  ABC transporter sugar permease  27.24 
 
 
293 aa  103  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.38 
 
 
309 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>