More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_04010 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_04010  carbohydrate ABC transporter membrane protein  100 
 
 
312 aa  614  1e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03910  carbohydrate ABC transporter membrane protein  62.3 
 
 
326 aa  350  2e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.669588 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.57 
 
 
304 aa  342  5.999999999999999e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.058143  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  54.13 
 
 
313 aa  292  5e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000718721  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.03 
 
 
296 aa  258  6e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0579092  normal  0.0820796 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.91 
 
 
299 aa  223  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062931 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.6 
 
 
316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.255548  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.05 
 
 
295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.767086  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.1 
 
 
297 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04080  carbohydrate ABC transporter membrane protein  41.06 
 
 
294 aa  202  5e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.15 
 
 
314 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06580  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.7 
 
 
318 aa  192  8e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.08 
 
 
314 aa  189  4e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.51197  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 
298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0911213  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0929  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  38.11 
 
 
308 aa  179  4e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.574591  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
310 aa  179  7e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0186923 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1007  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  38.11 
 
 
320 aa  176  4e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324625  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.91 
 
 
287 aa  176  6e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.79 
 
 
305 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.5 
 
 
278 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264075  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1763  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  35.27 
 
 
323 aa  154  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0129756  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29440  permease component of ABC-type sugar transporter  34.36 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1443  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
303 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0903613  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
296 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03080  permease component of ABC-type sugar transporter  33.21 
 
 
322 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.34 
 
 
295 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000506379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0477  ABC tranporter, permease protein  29.87 
 
 
315 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.08 
 
 
308 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172129  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
307 aa  119  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.02 
 
 
302 aa  119  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.68 
 
 
315 aa  119  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000228392  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.03 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727517  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.76 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.08 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.157384  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1900  sugar ABC transporter, permease protein, putative  28.08 
 
 
314 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1635  sugar ABC transporter, permease  28.08 
 
 
314 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0964  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.11 
 
 
313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194798  decreased coverage  0.00518822 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.49 
 
 
314 aa  116  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
299 aa  116  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.175132  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.36 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.01 
 
 
293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990678  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.48 
 
 
305 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1606  ABC transporter sugar permease  29.17 
 
 
293 aa  112  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00881  ABC transporter sugar permease  28.19 
 
 
294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0244413  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.36 
 
 
301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.51 
 
 
293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.24 
 
 
309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02940  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.13 
 
 
318 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.83 
 
 
299 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000030377  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.46 
 
 
311 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0277  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.85 
 
 
322 aa  109  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110446  hitchhiker  0.00135239 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.94 
 
 
314 aa  109  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000200699  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0604  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  27.85 
 
 
310 aa  109  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.46 
 
 
299 aa  109  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0480  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  27.87 
 
 
310 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4735  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  28.22 
 
 
310 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0623  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  27.87 
 
 
310 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.16 
 
 
320 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.495335  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.8 
 
 
310 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0630  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein, putative  27.53 
 
 
310 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0478  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  27.87 
 
 
310 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  27.3 
 
 
317 aa  108  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0698  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  27.53 
 
 
310 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.87 
 
 
318 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2863  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
356 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0536  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease  27.53 
 
 
310 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0567  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease protein  27.53 
 
 
310 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7347  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  28.43 
 
 
320 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.65 
 
 
294 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
316 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000245953 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.98 
 
 
310 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.33 
 
 
318 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0625824  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.43 
 
 
317 aa  105  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.39 
 
 
289 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29330  permease component of ABC-type sugar transporter  28.57 
 
 
321 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.06 
 
 
309 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.114297  normal  0.0929805 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.12 
 
 
305 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0388505  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7905  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.73 
 
 
336 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.79 
 
 
299 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.426381  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
297 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185813 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0461  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.9 
 
 
301 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.97 
 
 
291 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.216687  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.96 
 
 
316 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00640866  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.05 
 
 
297 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.03 
 
 
309 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325465  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.56 
 
 
318 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949955  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.05 
 
 
324 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.455385  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.89 
 
 
338 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.786552  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.29 
 
 
298 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.91 
 
 
308 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05100  permease component of ABC-type sugar transporter  29.08 
 
 
316 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7694  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  30.59 
 
 
312 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.51 
 
 
316 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0497455  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.97 
 
 
292 aa  103  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0526  ABC-type sugar transport systems permease components-like  30.03 
 
 
293 aa  103  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.92 
 
 
417 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.636087 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.02 
 
 
294 aa  102  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2544  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.97 
 
 
313 aa  102  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.54 
 
 
318 aa  102  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.18 
 
 
303 aa  102  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000249122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>