More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4613 on replicon NC_011881
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011881  Achl_4613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
301 aa  590  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01490  carbohydrate ABC transporter membrane protein  57.93 
 
 
324 aa  342  5e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.659857  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.08 
 
 
315 aa  315  6e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.22 
 
 
305 aa  293  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.18 
 
 
306 aa  291  7e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390449  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2414  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  52.49 
 
 
294 aa  291  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.34 
 
 
305 aa  287  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0388505  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.07 
 
 
297 aa  281  9e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
307 aa  186  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  36.36 
 
 
307 aa  186  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  38.74 
 
 
305 aa  174  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.64 
 
 
299 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.64 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.456499 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.67 
 
 
309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.35 
 
 
297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
318 aa  166  4e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000473727  hitchhiker  0.00124128 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1361  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.24 
 
 
315 aa  166  5e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193472  normal  0.165724 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.96 
 
 
297 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29330  permease component of ABC-type sugar transporter  34.22 
 
 
321 aa  165  8e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00850  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.01 
 
 
320 aa  165  9e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.57 
 
 
291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0196347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0295  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  32.97 
 
 
300 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
316 aa  163  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
299 aa  163  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
326 aa  163  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 
329 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.811614  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
319 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0377  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.27 
 
 
294 aa  160  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.68 
 
 
314 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.59424  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
319 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
293 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00259426  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.49 
 
 
316 aa  156  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
311 aa  157  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17058  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.63 
 
 
315 aa  156  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
320 aa  155  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230008  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
316 aa  155  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.264329 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2103  ABC transporter, permease protein  37.36 
 
 
296 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.512676  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 
305 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00457854  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1493  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  33.21 
 
 
319 aa  155  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.67 
 
 
313 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8235  ABC transporter, permease protein  32.09 
 
 
306 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
317 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.53 
 
 
290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
315 aa  153  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0308401  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.97 
 
 
308 aa  153  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.21 
 
 
308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.283214  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.61 
 
 
305 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2545  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
316 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.637107  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
312 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.04 
 
 
313 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00226923  hitchhiker  0.00373728 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
318 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
300 aa  150  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0038089  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
314 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27710  permease component of ABC-type sugar transporter  31.58 
 
 
294 aa  150  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.32 
 
 
306 aa  149  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29020  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.74 
 
 
275 aa  149  6e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 
296 aa  149  7e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
307 aa  148  9e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949955  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.48209 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1315  ABC transporter, permease protein  36.56 
 
 
301 aa  147  3e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
283 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2010  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  31.08 
 
 
318 aa  147  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.360583  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 
294 aa  147  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000558297  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.57 
 
 
310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.155614  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.59 
 
 
308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000379306  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.93 
 
 
300 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.71 
 
 
294 aa  146  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
314 aa  145  6e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.09 
 
 
299 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655631 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
295 aa  145  6e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6903  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
324 aa  145  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156181  normal  0.0141251 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.46 
 
 
296 aa  145  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000283647  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.3 
 
 
325 aa  145  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295531  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
317 aa  145  9e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.9 
 
 
296 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0543799999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
309 aa  144  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.179346  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.68 
 
 
292 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.824779  normal  0.0156091 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29410  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.1 
 
 
322 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.899558  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
318 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.670475  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
318 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11610  permease component of ABC-type sugar transporter  32.76 
 
 
311 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.117578  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.8 
 
 
296 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
328 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.00155627 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
295 aa  144  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6585  lactose transport system (permease)  34.86 
 
 
306 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.32 
 
 
292 aa  144  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
285 aa  143  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.168129  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.03 
 
 
309 aa  143  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.114297  normal  0.0929805 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2715  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  27.38 
 
 
350 aa  143  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392142  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.93 
 
 
316 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal  0.915782 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
286 aa  143  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000108841  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
353 aa  142  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.95 
 
 
307 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  32.68 
 
 
317 aa  142  7e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>