More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_27710 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_27710  permease component of ABC-type sugar transporter  100 
 
 
294 aa  586  1e-166  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0295  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  51.39 
 
 
300 aa  295  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3650  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  49.31 
 
 
315 aa  278  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0685768 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3942  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  48.4 
 
 
321 aa  275  5e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.108149  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1361  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193472  normal  0.165724 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.85 
 
 
296 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.01 
 
 
303 aa  169  6e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0695484  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
307 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000296099  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.51 
 
 
306 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0472746 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1304  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  31.83 
 
 
334 aa  166  5e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00913134  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.130846  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 
328 aa  163  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.00155627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8235  ABC transporter, permease protein  33.56 
 
 
306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.34 
 
 
319 aa  162  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  36.52 
 
 
287 aa  161  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
319 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12077  sugar ABC transporter membrane protein  35.34 
 
 
300 aa  161  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
295 aa  161  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
311 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155715  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
305 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0388505  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.57 
 
 
311 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.25 
 
 
309 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
312 aa  158  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.74 
 
 
290 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0557  ABC transporter, permease protein  33.58 
 
 
308 aa  156  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0541  ABC transporter, permease protein  33.58 
 
 
308 aa  156  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
307 aa  155  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  32.86 
 
 
307 aa  155  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
293 aa  154  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2103  ABC transporter, permease protein  30.38 
 
 
296 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.512676  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
314 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.59424  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27700  permease component of ABC-type sugar transporter  33.45 
 
 
321 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.479477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.93 
 
 
300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.454536  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.849073  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
309 aa  152  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.179346  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
307 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.701562  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1900  sugar ABC transporter, permease protein, putative  32.16 
 
 
314 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1635  sugar ABC transporter, permease  32.16 
 
 
314 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
316 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
318 aa  150  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000473727  hitchhiker  0.00124128 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 
294 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.17 
 
 
312 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
313 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00850  carbohydrate ABC transporter membrane protein  38.27 
 
 
320 aa  150  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
317 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0740262  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
309 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
302 aa  149  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.75 
 
 
294 aa  150  4e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000558297  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
332 aa  149  5e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1493  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  33.83 
 
 
319 aa  149  6e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
299 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.05 
 
 
313 aa  149  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.737632 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 
287 aa  149  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.484603  normal  0.727796 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
315 aa  148  9e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000228392  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.38 
 
 
307 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.12 
 
 
301 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01490  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.62 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.659857  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.36 
 
 
300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 
295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.36 
 
 
300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2496  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17058  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28370  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.83 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.096742  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.305055  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
309 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
306 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390449  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07100  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.45 
 
 
318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.790586  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.811614  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
320 aa  145  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230008  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.63 
 
 
308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.48209 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.99 
 
 
315 aa  145  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
309 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.43514  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
298 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.2 
 
 
322 aa  143  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0828  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.07 
 
 
316 aa  143  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.72 
 
 
311 aa  143  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.24 
 
 
310 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181942  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4983  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  28.47 
 
 
310 aa  143  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1114  sugar ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 
301 aa  142  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212611  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29410  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.63 
 
 
322 aa  142  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.899558  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.89 
 
 
294 aa  142  5e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.18 
 
 
320 aa  142  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.253823  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03080  permease component of ABC-type sugar transporter  32.51 
 
 
322 aa  142  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
320 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
306 aa  142  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.692762  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.9 
 
 
289 aa  142  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.6 
 
 
309 aa  142  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800905  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.58 
 
 
299 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.456499 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655631 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.79 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.72 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.980812  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0477  ABC tranporter, permease protein  30.36 
 
 
315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2010  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  33.81 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.360583  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01820  permease component of ABC-type sugar transporter  30.56 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>