More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0295 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0295  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 
300 aa  597  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3650  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  60.54 
 
 
315 aa  353  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0685768 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3942  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  60.5 
 
 
321 aa  348  6e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.108149  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27710  permease component of ABC-type sugar transporter  51.39 
 
 
294 aa  279  4e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  39.86 
 
 
287 aa  180  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
319 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.69 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 
320 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230008  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
299 aa  169  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
303 aa  169  6e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0695484  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.14 
 
 
309 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.849073  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.06 
 
 
295 aa  167  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
312 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
309 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
299 aa  165  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4983  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  31.74 
 
 
310 aa  165  9e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  32.78 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.52 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.498676  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.00155627 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.78 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
309 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.43514  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
299 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655631 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.39 
 
 
299 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.456499 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1304  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  32.38 
 
 
334 aa  161  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00913134  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
290 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
307 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
313 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.737632 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.02 
 
 
316 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
309 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
310 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 
309 aa  160  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.179346  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12077  sugar ABC transporter membrane protein  36.84 
 
 
300 aa  159  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
309 aa  159  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.114297  normal  0.0929805 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0905  transmembrane permease MsmF  32.99 
 
 
289 aa  159  6e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0122469  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11550  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.67 
 
 
354 aa  159  7e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.0144146 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
305 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.980812  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15070  permease component of ABC-type sugar transporter  32.72 
 
 
311 aa  158  8e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0771026  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6550  putative transmembrane binding-protein-dependent transporter  34.48 
 
 
303 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015909 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
306 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 
330 aa  157  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0526  ABC-type sugar transport systems permease components-like  34.56 
 
 
293 aa  156  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.02 
 
 
294 aa  157  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.21 
 
 
307 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
316 aa  156  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4638  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.33 
 
 
308 aa  155  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000461706  normal  0.23331 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
301 aa  155  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.45 
 
 
310 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181942  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.55 
 
 
316 aa  155  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  31.6 
 
 
317 aa  155  8e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
315 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  34.16 
 
 
305 aa  154  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  35.36 
 
 
288 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
307 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000296099  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.93 
 
 
315 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.511569  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.63 
 
 
293 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3909  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.38 
 
 
305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
320 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.253823  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.91 
 
 
305 aa  153  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
294 aa  152  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.159905  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1606  ABC transporter sugar permease  31.63 
 
 
293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
306 aa  152  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.692762  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
294 aa  152  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
326 aa  152  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1290  ABC transporter, permease protein  28.85 
 
 
311 aa  151  1e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0557  ABC transporter, permease protein  30.71 
 
 
308 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0541  ABC transporter, permease protein  30.71 
 
 
308 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29020  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.82 
 
 
275 aa  151  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
287 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.484603  normal  0.727796 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.21 
 
 
293 aa  151  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990678  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 
329 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.811614  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.88 
 
 
302 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
296 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0461  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.33 
 
 
301 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6585  lactose transport system (permease)  38.8 
 
 
306 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
315 aa  149  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000228392  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27700  permease component of ABC-type sugar transporter  33.69 
 
 
321 aa  150  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.479477 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0828  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.25 
 
 
316 aa  149  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
309 aa  149  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325465  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
306 aa  149  8e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.29 
 
 
300 aa  149  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.454536  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.63 
 
 
316 aa  149  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.130846  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11610  permease component of ABC-type sugar transporter  35.19 
 
 
311 aa  149  8e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.117578  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 
324 aa  148  9e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000204062  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7706  sugar ABC transporter permease protein  33.8 
 
 
303 aa  148  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 
322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2103  ABC transporter, permease protein  31.08 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.512676  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3250  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  33.69 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.283214  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.35 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390449  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.71 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.45 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2978  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.27 
 
 
289 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.25 
 
 
300 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2071  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 
345 aa  146  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000672298  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.25 
 
 
300 aa  147  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
314 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.59424  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2496  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31256  normal  0.442716 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.63 
 
 
318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.575298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>