More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2496 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2496  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
311 aa  615  1e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3909  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.42 
 
 
305 aa  272  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.92 
 
 
305 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.980812  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.47 
 
 
362 aa  265  8.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.62 
 
 
307 aa  258  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0292278 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4160  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.26 
 
 
305 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.255761  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3841  sugar ABC transporter  46.85 
 
 
310 aa  235  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0268075  normal  0.0361307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.26 
 
 
291 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.367922  normal  0.0195903 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2833  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.26 
 
 
315 aa  220  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.94 
 
 
306 aa  204  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
317 aa  185  7e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
309 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  37.02 
 
 
288 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2847  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.6 
 
 
318 aa  175  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
305 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.19 
 
 
307 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 
309 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325465  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 
300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  36.93 
 
 
317 aa  166  5e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.78 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.575298  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03080  permease component of ABC-type sugar transporter  39.22 
 
 
322 aa  164  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3284  maltose-binding periplasmic protein  35.69 
 
 
293 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0588261  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.96 
 
 
297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
285 aa  162  7e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.195932  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2587  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
314 aa  162  9e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000137508  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
329 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.811614  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 
316 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.14 
 
 
307 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
306 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
292 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
296 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0543799999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.25 
 
 
318 aa  160  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000473727  hitchhiker  0.00124128 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
310 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181942  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
293 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0477  ABC tranporter, permease protein  31.27 
 
 
315 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
316 aa  159  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
287 aa  159  7e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3289  ABC glycerol-3-phosphate transporter, inner membrane subunit UgpA  34.98 
 
 
293 aa  158  9e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  33 
 
 
307 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33 
 
 
307 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.15 
 
 
310 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.498676  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
311 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
300 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.15 
 
 
310 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
293 aa  156  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.199959 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 
299 aa  156  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.426381  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
312 aa  156  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.633875  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 
308 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
314 aa  155  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.59424  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00850  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.14 
 
 
320 aa  155  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
319 aa  155  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7347  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.46 
 
 
320 aa  155  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.07 
 
 
317 aa  155  8e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0604  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  32.3 
 
 
310 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0480  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  32.3 
 
 
310 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0526  ABC-type sugar transport systems permease components-like  34.4 
 
 
293 aa  154  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4735  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  32.3 
 
 
310 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4983  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  33.69 
 
 
310 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0647  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.74 
 
 
325 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.46 
 
 
304 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2715  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  28.61 
 
 
350 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392142  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3105  ABC transporter, permease component  34.97 
 
 
294 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.79 
 
 
320 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230008  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0623  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  32.3 
 
 
310 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0478  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  32.3 
 
 
310 aa  153  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.51 
 
 
279 aa  153  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.983189  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0630  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein, putative  30.67 
 
 
310 aa  152  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12339  sugar-transport integral membrane protein ABC transporter uspA  34.15 
 
 
290 aa  152  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0698  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  31.27 
 
 
310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0536  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease  31.96 
 
 
310 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0567  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease protein  31.96 
 
 
310 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.62 
 
 
306 aa  152  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0924232  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.96 
 
 
310 aa  152  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3250  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  35.21 
 
 
310 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
283 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0905  transmembrane permease MsmF  31.38 
 
 
289 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0122469  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
309 aa  150  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.179346  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
310 aa  150  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.155614  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.1 
 
 
290 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
353 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
310 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.46 
 
 
298 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1182  sugar ABC transporter, permease protein, putative  32.64 
 
 
319 aa  149  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547049  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29020  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.08 
 
 
275 aa  150  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0068  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
315 aa  149  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1085  putative sugar ABC transporter, permease protein  32.64 
 
 
319 aa  149  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
312 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
330 aa  149  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
318 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0625824  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.04 
 
 
313 aa  149  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
296 aa  149  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.603266  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.3 
 
 
313 aa  149  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000239391  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
318 aa  149  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
310 aa  149  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.92 
 
 
291 aa  149  9e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.199241  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
305 aa  148  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00457854  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>