More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0615 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
296 aa  596  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.56 
 
 
300 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.454536  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.19 
 
 
309 aa  291  6e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.179346  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.99 
 
 
300 aa  286  4e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0038089  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.62 
 
 
309 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
328 aa  211  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.00155627 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11550  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.05 
 
 
354 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.0144146 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.64 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1304  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  37.88 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00913134  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.04 
 
 
293 aa  195  8.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
289 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.52 
 
 
319 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.18 
 
 
309 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.43514  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
299 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01540  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.25 
 
 
329 aa  191  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23420  carbohydrate ABC transporter membrane protein  40.71 
 
 
310 aa  190  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.93855  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.82 
 
 
294 aa  187  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000558297  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
294 aa  186  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 
309 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.2 
 
 
312 aa  185  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.746865  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.456499 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
307 aa  183  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  31.65 
 
 
307 aa  183  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2010  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  34.6 
 
 
318 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.360583  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0068  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  38.89 
 
 
308 aa  182  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.37 
 
 
305 aa  182  7e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0279283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3250  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.94 
 
 
294 aa  181  9.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0540669  normal  0.0518644 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4587  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3250  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  35.56 
 
 
310 aa  179  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
319 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80176  hitchhiker  0.000205378 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
314 aa  178  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
312 aa  178  8e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
313 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.32687 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
309 aa  178  9e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 
317 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4576  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
314 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00748515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
305 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0388505  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
312 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
313 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0295  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.69 
 
 
300 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 
291 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2103  ABC transporter, permease protein  37.31 
 
 
296 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.512676  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1618  binding-protein-dependent transport protein  34.07 
 
 
296 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.14282  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
312 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.142654 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0695484  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2949  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.51 
 
 
302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.61 
 
 
320 aa  172  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.253823  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
275 aa  172  7.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3942  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.52 
 
 
321 aa  171  9e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.108149  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2071  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
345 aa  171  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000672298  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1183  ABC transporter, permease protein  35.32 
 
 
307 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27710  permease component of ABC-type sugar transporter  30.85 
 
 
294 aa  170  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2817  putative carbohydrate ABC transporter, permease protein  35.32 
 
 
307 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.86 
 
 
299 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1247  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
308 aa  170  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.732084 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.71 
 
 
306 aa  169  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8235  ABC transporter, permease protein  32.74 
 
 
306 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
299 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655631 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.67 
 
 
295 aa  170  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3650  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  30.74 
 
 
315 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0685768 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.99 
 
 
332 aa  169  5e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
297 aa  169  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0557  ABC transporter, permease protein  34.23 
 
 
308 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0541  ABC transporter, permease protein  34.23 
 
 
308 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
309 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325465  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
309 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800905  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3986  putative ABC transporter (permease protein)  33.88 
 
 
313 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
300 aa  168  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
300 aa  168  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5738  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.25 
 
 
302 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 
298 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
315 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.85 
 
 
309 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
291 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0196347  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  33.21 
 
 
305 aa  166  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
306 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390449  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
296 aa  166  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
294 aa  165  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000181172  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
294 aa  165  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180469  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.98 
 
 
296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.648492  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0278828  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.53 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488692  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00850  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.88 
 
 
320 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
305 aa  162  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
315 aa  162  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.18 
 
 
296 aa  162  6e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
305 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6025  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.16 
 
 
305 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584937  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
315 aa  162  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
306 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0563  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.25 
 
 
294 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22835  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0526  ABC-type sugar transport systems permease components-like  30.21 
 
 
293 aa  161  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
307 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.701562  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.58 
 
 
296 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0543799999999999e-20 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2651  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
294 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493427  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.02 
 
 
293 aa  161  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00259426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>