More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2591 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
322 aa  616  1e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00850  carbohydrate ABC transporter membrane protein  61.99 
 
 
320 aa  335  5.999999999999999e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.93 
 
 
329 aa  299  3e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.811614  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.5 
 
 
319 aa  285  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1361  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.95 
 
 
315 aa  248  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193472  normal  0.165724 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1493  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  44.4 
 
 
319 aa  237  2e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.8 
 
 
321 aa  210  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0969949  hitchhiker  0.00558819 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.54 
 
 
297 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.3 
 
 
319 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.44 
 
 
297 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.84 
 
 
330 aa  192  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
315 aa  192  6e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
297 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.06 
 
 
305 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0388505  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.29 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.00155627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.16 
 
 
306 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390449  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
307 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
309 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  35.74 
 
 
307 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3074  sugar ABC transporter permease protein  36.68 
 
 
307 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
294 aa  169  5e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000558297  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.59 
 
 
319 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.255158 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1304  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  36.93 
 
 
334 aa  167  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00913134  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
299 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.456499 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.95 
 
 
297 aa  166  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11550  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.55 
 
 
354 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.0144146 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.47 
 
 
299 aa  162  8.000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2414  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  38.23 
 
 
294 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
309 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
316 aa  161  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01490  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.83 
 
 
324 aa  161  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.659857  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
306 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.692762  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12077  sugar ABC transporter membrane protein  39.64 
 
 
300 aa  160  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.79 
 
 
309 aa  159  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.849073  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 
296 aa  159  7e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0295  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  35.07 
 
 
300 aa  159  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.76 
 
 
296 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515819  normal  0.562108 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27710  permease component of ABC-type sugar transporter  36.2 
 
 
294 aa  157  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.67 
 
 
309 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 
313 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.32687 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.08 
 
 
312 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.633875  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2103  ABC transporter, permease protein  33.58 
 
 
296 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.512676  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27700  permease component of ABC-type sugar transporter  36.36 
 
 
321 aa  158  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.479477 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.88 
 
 
295 aa  157  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2071  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
345 aa  156  4e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000672298  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.59 
 
 
313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
295 aa  155  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.9 
 
 
313 aa  155  7e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.737632 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2010  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  31.97 
 
 
318 aa  155  8e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.360583  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
314 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.61 
 
 
332 aa  155  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8235  ABC transporter, permease protein  34.47 
 
 
306 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4576  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
314 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00748515 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.2 
 
 
305 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
290 aa  153  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
309 aa  153  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325465  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 
326 aa  153  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
317 aa  152  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.86 
 
 
296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0526  ABC-type sugar transport systems permease components-like  34.75 
 
 
293 aa  152  8e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11610  permease component of ABC-type sugar transporter  34.08 
 
 
311 aa  152  8e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.117578  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  33.92 
 
 
288 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.21 
 
 
319 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80176  hitchhiker  0.000205378 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
296 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000283647  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
321 aa  152  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0563  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.43 
 
 
294 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22835  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.8 
 
 
290 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.03 
 
 
293 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.87 
 
 
309 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800905  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
306 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0472746 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03080  permease component of ABC-type sugar transporter  35.79 
 
 
322 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
316 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.130846  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.76 
 
 
301 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
312 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
321 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
318 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949955  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4587  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
325 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
309 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.43514  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.59 
 
 
305 aa  149  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.91 
 
 
296 aa  149  7e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.227806  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2496  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.05 
 
 
311 aa  149  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
299 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655631 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
303 aa  149  9e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.693678  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5738  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  33.33 
 
 
302 aa  149  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.52 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.77 
 
 
283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0625824  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1261  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.89 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196832  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4983  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  30.23 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.1 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.63 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000245953 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.89 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00640866  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.92 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0828  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.17 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>