More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4146 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
306 aa  604  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3909  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.5 
 
 
305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.8 
 
 
305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.980812  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2496  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.94 
 
 
311 aa  227  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.29 
 
 
307 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0292278 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4160  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
305 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.255761  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.99 
 
 
362 aa  199  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3841  sugar ABC transporter  40.36 
 
 
310 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0268075  normal  0.0361307 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.48 
 
 
307 aa  183  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.06 
 
 
316 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2833  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.72 
 
 
315 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
312 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
305 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
291 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.367922  normal  0.0195903 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.59 
 
 
321 aa  176  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
306 aa  175  8e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.83 
 
 
317 aa  175  9e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0828  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.13 
 
 
316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03080  permease component of ABC-type sugar transporter  40.07 
 
 
322 aa  170  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0204  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
299 aa  166  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.169553 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.93 
 
 
328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.00155627 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.811614  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29410  carbohydrate ABC transporter membrane protein  39.34 
 
 
322 aa  163  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.899558  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.09 
 
 
328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.913769 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.48 
 
 
307 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000296099  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27700  permease component of ABC-type sugar transporter  37.63 
 
 
321 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.479477 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2080  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.12 
 
 
308 aa  161  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.136718  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
299 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
330 aa  160  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
415 aa  159  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.33288  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.32 
 
 
316 aa  159  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.74 
 
 
328 aa  159  8e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0926617  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.69 
 
 
312 aa  158  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
313 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.394829 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
308 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.283214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
299 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.426381  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
310 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114113  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06940  hypothetical protein  32.92 
 
 
329 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00850  carbohydrate ABC transporter membrane protein  38.49 
 
 
320 aa  156  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15070  permease component of ABC-type sugar transporter  38.43 
 
 
311 aa  156  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0771026  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.308461  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
321 aa  155  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  33.77 
 
 
307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
309 aa  155  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
312 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0867066 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  35.62 
 
 
317 aa  155  6e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.4 
 
 
319 aa  155  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1493  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  33.66 
 
 
319 aa  155  7e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.18 
 
 
320 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230008  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
305 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00457854  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
305 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99861  hitchhiker  0.000381845 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29330  permease component of ABC-type sugar transporter  34.67 
 
 
321 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.02 
 
 
417 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.636087 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1290  ABC transporter, permease protein  32.35 
 
 
311 aa  154  2e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.89 
 
 
309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325465  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.3 
 
 
308 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.48209 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3250  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  34.87 
 
 
310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.54 
 
 
335 aa  152  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0186858  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11550  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.4 
 
 
354 aa  152  7e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.0144146 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
295 aa  152  8e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.01 
 
 
317 aa  152  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000449996 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
317 aa  152  8e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0461  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.45 
 
 
301 aa  152  8.999999999999999e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0295  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  33.45 
 
 
300 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
300 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1182  sugar ABC transporter, permease protein, putative  33.45 
 
 
319 aa  151  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547049  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
310 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181942  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1085  putative sugar ABC transporter, permease protein  33.45 
 
 
319 aa  151  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3105  ABC transporter, permease component  36.07 
 
 
294 aa  151  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
305 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.028536  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2863  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
356 aa  151  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
332 aa  150  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  33.55 
 
 
305 aa  150  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
310 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369054 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.78 
 
 
310 aa  150  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
298 aa  149  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1067  sugar ABC transporter permease  31.12 
 
 
293 aa  149  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.224825 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0964  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
313 aa  149  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194798  decreased coverage  0.00518822 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
313 aa  149  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7347  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  33.58 
 
 
320 aa  149  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
297 aa  149  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12077  sugar ABC transporter membrane protein  34.3 
 
 
300 aa  149  7e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.28 
 
 
292 aa  149  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0529  sugar ABC transporter, permease protein  31.12 
 
 
293 aa  149  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.12 
 
 
293 aa  149  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2273  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.51 
 
 
302 aa  149  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
296 aa  149  8e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
309 aa  148  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.849073  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 
310 aa  148  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.498676  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0647  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.7 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0698  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 
310 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01240  permease component of ABC-type sugar transporter  35.36 
 
 
334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>