More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2715 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2715  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  100 
 
 
350 aa  696    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392142  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3957  sugar transport system (permease)  76.83 
 
 
365 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225692  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.46 
 
 
372 aa  393  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.888329  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1954  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.28 
 
 
359 aa  389  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299224 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06330  carbohydrate ABC transporter membrane protein  59.64 
 
 
368 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6731  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.03 
 
 
337 aa  325  6e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0579092  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 
299 aa  208  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.426381  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0461  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.89 
 
 
301 aa  193  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.92 
 
 
310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.53 
 
 
295 aa  187  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000506379  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
299 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.97 
 
 
295 aa  182  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.82 
 
 
305 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 
296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000392628 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  36.45 
 
 
307 aa  179  4.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
307 aa  179  4.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
302 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
316 aa  172  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.2 
 
 
292 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  37.42 
 
 
287 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
382 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.74 
 
 
309 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7347  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.78 
 
 
320 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  33.64 
 
 
288 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
297 aa  170  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.76 
 
 
353 aa  170  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  33.33 
 
 
317 aa  170  4e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
308 aa  169  7e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.1 
 
 
318 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949955  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 
310 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
293 aa  167  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.74 
 
 
299 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1606  ABC transporter sugar permease  31.64 
 
 
293 aa  167  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.12 
 
 
295 aa  166  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.03 
 
 
317 aa  165  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
306 aa  165  9e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3147  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 
319 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00382098  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.51 
 
 
402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.77 
 
 
307 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21160  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.52 
 
 
314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103465  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.64 
 
 
318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0625824  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.43 
 
 
309 aa  162  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00881  ABC transporter sugar permease  34.06 
 
 
294 aa  162  7e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0244413  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
294 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
293 aa  162  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990678  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 
316 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.264329 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
320 aa  159  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230008  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8235  ABC transporter, permease protein  30.98 
 
 
306 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.08 
 
 
298 aa  159  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27700  permease component of ABC-type sugar transporter  31.76 
 
 
321 aa  159  7e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.479477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.72 
 
 
305 aa  159  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.2 
 
 
311 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2080  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
308 aa  158  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.136718  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
415 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.33288  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.16 
 
 
318 aa  156  4e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000473727  hitchhiker  0.00124128 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.69 
 
 
291 aa  156  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0196347  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3250  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  31.38 
 
 
310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 
279 aa  156  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.983189  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
300 aa  155  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0526  ABC-type sugar transport systems permease components-like  30.58 
 
 
293 aa  155  7e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0828  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.87 
 
 
316 aa  155  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29020  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.08 
 
 
275 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 
309 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325465  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.09 
 
 
314 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0166533  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2496  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.61 
 
 
311 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 
321 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.53 
 
 
313 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00226923  hitchhiker  0.00373728 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.29 
 
 
310 aa  153  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.155614  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0631  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.43 
 
 
363 aa  153  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 
304 aa  153  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
318 aa  153  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal  0.0165665 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
314 aa  153  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.59424  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.99 
 
 
298 aa  153  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.75 
 
 
317 aa  151  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000449996 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
417 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.636087 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1100  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
300 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.4 
 
 
314 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000200699  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.36 
 
 
330 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0698  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
293 aa  151  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.15 
 
 
305 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00457854  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
319 aa  151  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14469  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 
296 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.243021 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
293 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
290 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  33.43 
 
 
305 aa  151  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5581  ABC transporter membrane spanning protein (galacturonic acid)  33.84 
 
 
314 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.35 
 
 
316 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
309 aa  150  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
307 aa  150  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1315  ABC transporter, permease protein  30.84 
 
 
301 aa  150  4e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.26 
 
 
305 aa  150  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.028536  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0563  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.74 
 
 
294 aa  150  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22835  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
307 aa  149  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45981  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.27 
 
 
308 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.48209 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.79 
 
 
316 aa  149  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29330  permease component of ABC-type sugar transporter  29.62 
 
 
321 aa  149  6e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.08 
 
 
290 aa  149  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.04 
 
 
313 aa  149  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>