More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03910 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_03910  carbohydrate ABC transporter membrane protein  100 
 
 
326 aa  636    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.669588 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75 
 
 
304 aa  389  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.058143  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04010  carbohydrate ABC transporter membrane protein  62.3 
 
 
312 aa  333  2e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  56.91 
 
 
313 aa  308  5.9999999999999995e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000718721  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.87 
 
 
296 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0579092  normal  0.0820796 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.08 
 
 
297 aa  219  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.07 
 
 
299 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062931 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04080  carbohydrate ABC transporter membrane protein  43.64 
 
 
294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.99 
 
 
316 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.255548  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06580  carbohydrate ABC transporter membrane protein  39.81 
 
 
318 aa  208  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.77 
 
 
295 aa  207  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.767086  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.86 
 
 
310 aa  203  4e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0186923 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.63 
 
 
314 aa  189  4e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0929  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  37.06 
 
 
308 aa  176  7e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.574591  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 
305 aa  172  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.17 
 
 
287 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.86 
 
 
314 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.51197  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1007  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  37.16 
 
 
320 aa  170  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324625  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.92 
 
 
298 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0911213  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1763  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  36.56 
 
 
323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0129756  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.68 
 
 
278 aa  162  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264075  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03080  permease component of ABC-type sugar transporter  32.35 
 
 
322 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.76 
 
 
295 aa  123  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727517  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.77 
 
 
309 aa  122  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
308 aa  122  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172129  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1443  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.78 
 
 
303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0903613  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.64 
 
 
302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 
296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29410  carbohydrate ABC transporter membrane protein  29.17 
 
 
322 aa  120  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.899558  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  31.14 
 
 
287 aa  120  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0477  ABC tranporter, permease protein  28.76 
 
 
315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.12 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000506379  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.43 
 
 
305 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0388505  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.42 
 
 
311 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0769  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.72 
 
 
313 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1606  ABC transporter sugar permease  30.61 
 
 
293 aa  116  5e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  31.72 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1900  sugar ABC transporter, permease protein, putative  29.62 
 
 
314 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1635  sugar ABC transporter, permease  29.62 
 
 
314 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5466  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.49 
 
 
293 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0543502  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29440  permease component of ABC-type sugar transporter  30.19 
 
 
318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990678  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.34 
 
 
293 aa  112  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.45 
 
 
328 aa  112  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.913769 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.34 
 
 
293 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0698  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  28.48 
 
 
310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00881  ABC transporter sugar permease  31.16 
 
 
294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0244413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4735  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  27.83 
 
 
310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0480  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  28.16 
 
 
310 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2587  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
314 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000137508  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0623  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  28.16 
 
 
310 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.76 
 
 
310 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.49 
 
 
317 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0630  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein, putative  28.24 
 
 
310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.61 
 
 
293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.548655  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0478  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  28.16 
 
 
310 aa  109  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0604  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  28.42 
 
 
310 aa  109  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
297 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185813 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.79 
 
 
299 aa  109  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000030377  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.35 
 
 
328 aa  109  8.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0926617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0536  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease  27.83 
 
 
310 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0567  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease protein  27.83 
 
 
310 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 
307 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3651  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.21 
 
 
301 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.86 
 
 
309 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0964  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.07 
 
 
313 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194798  decreased coverage  0.00518822 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2496  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.27 
 
 
311 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.12 
 
 
307 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.99 
 
 
292 aa  107  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.83 
 
 
315 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000228392  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.25 
 
 
313 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000239391  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.49 
 
 
310 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0656  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  31.25 
 
 
293 aa  106  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552753  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02940  carbohydrate ABC transporter membrane protein  29.78 
 
 
318 aa  106  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0618  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  31.25 
 
 
293 aa  106  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.07 
 
 
307 aa  106  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.34 
 
 
335 aa  105  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0186858  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
292 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.55 
 
 
317 aa  105  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.65 
 
 
299 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.175132  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.97 
 
 
316 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000245953 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.5 
 
 
318 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.575298  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.27 
 
 
306 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.157384  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.28 
 
 
314 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1182  sugar ABC transporter, permease protein, putative  30.34 
 
 
319 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547049  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.03 
 
 
293 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.565462 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3284  maltose-binding periplasmic protein  28.47 
 
 
293 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0588261  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.33 
 
 
318 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.53 
 
 
299 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.426381  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.14 
 
 
311 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17058  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.62 
 
 
320 aa  103  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.495335  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3551  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.5 
 
 
301 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.963791  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1085  putative sugar ABC transporter, permease protein  30.34 
 
 
319 aa  104  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6260  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.94 
 
 
322 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.518821 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2847  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.23 
 
 
318 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.42 
 
 
293 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0527607  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.3 
 
 
300 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.52 
 
 
291 aa  103  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4017  carbohydrate ABC transporter permease  29.11 
 
 
294 aa  103  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>