More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_04080 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_04080  carbohydrate ABC transporter membrane protein  100 
 
 
294 aa  579  1e-164  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68 
 
 
299 aa  360  2e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.38 
 
 
297 aa  259  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.6 
 
 
316 aa  247  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.255548  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.02 
 
 
295 aa  235  6e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.767086  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1763  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  46.64 
 
 
323 aa  223  2e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0129756  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03910  carbohydrate ABC transporter membrane protein  43.64 
 
 
326 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.669588 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0929  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  46.22 
 
 
308 aa  204  1e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.574591  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06580  carbohydrate ABC transporter membrane protein  41.36 
 
 
318 aa  202  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.49 
 
 
304 aa  199  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.058143  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
314 aa  196  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.51197  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.45 
 
 
296 aa  192  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0579092  normal  0.0820796 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  39.31 
 
 
313 aa  192  7e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000718721  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1007  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  45.33 
 
 
320 aa  189  5.999999999999999e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324625  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.96 
 
 
287 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
310 aa  186  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0186923 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.21 
 
 
298 aa  186  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0911213  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.98 
 
 
278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264075  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
305 aa  181  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04010  carbohydrate ABC transporter membrane protein  39.15 
 
 
312 aa  181  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
314 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.03 
 
 
296 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1443  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.03 
 
 
303 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0903613  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.79 
 
 
295 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727517  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 
315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000228392  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.61 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 
316 aa  125  9e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000245953 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 
299 aa  125  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000030377  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.3 
 
 
293 aa  123  4e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8235  ABC transporter, permease protein  32.09 
 
 
306 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6585  lactose transport system (permease)  37.13 
 
 
306 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1606  ABC transporter sugar permease  32.3 
 
 
293 aa  122  6e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.96 
 
 
316 aa  122  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00640866  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
298 aa  122  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29440  permease component of ABC-type sugar transporter  30.31 
 
 
318 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  31.39 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.49 
 
 
306 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.157384  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.51 
 
 
308 aa  119  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172129  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.396467  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5702  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.175132  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.495335  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  32.4 
 
 
288 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  31.3 
 
 
317 aa  116  5e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.47 
 
 
294 aa  115  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.3 
 
 
328 aa  115  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.913769 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.61 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.71 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990678  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.88 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254991 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1875  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  34.84 
 
 
350 aa  113  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0432685  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 
295 aa  112  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000506379  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00850  carbohydrate ABC transporter membrane protein  28.81 
 
 
320 aa  113  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.88 
 
 
332 aa  112  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0935  multiple sugar transport system permease protein  31.58 
 
 
328 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36894  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
324 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.455385  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.87 
 
 
294 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.12 
 
 
328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.00155627 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0477  ABC tranporter, permease protein  31.78 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.01 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2273  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.61 
 
 
302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3250  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  30.99 
 
 
310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.54 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.548655  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06940  hypothetical protein  29.97 
 
 
329 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.82 
 
 
328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0926617  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.79 
 
 
309 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.62 
 
 
327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0175684  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.45 
 
 
297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
338 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.786552  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.35 
 
 
312 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1755  ABC transporter permease  30.6 
 
 
312 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.576454  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00881  ABC transporter sugar permease  30.9 
 
 
294 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0244413  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3307  sugar transport system (permease)  30.47 
 
 
325 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.63 
 
 
279 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.232459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.58 
 
 
335 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0186858  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
312 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.49 
 
 
295 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1100  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.79 
 
 
311 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0016702  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5709  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  28.95 
 
 
316 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.673224  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08410  carbohydrate ABC transporter membrane protein  29.54 
 
 
379 aa  107  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.166742 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.75 
 
 
323 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000203032 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2496  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
311 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3841  sugar ABC transporter  34.47 
 
 
310 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0268075  normal  0.0361307 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.96 
 
 
415 aa  106  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.33288  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
303 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000249122  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.76 
 
 
353 aa  106  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.18 
 
 
286 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453278  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.27 
 
 
330 aa  106  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
322 aa  105  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.946878  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.96 
 
 
311 aa  105  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17058  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.37 
 
 
302 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.12 
 
 
300 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0114019  normal  0.0892858 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.92 
 
 
291 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0196347  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.24 
 
 
291 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
317 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.07 
 
 
316 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.702273  normal  0.0136241 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.55 
 
 
297 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.82 
 
 
286 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728774  normal  0.302995 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.96 
 
 
313 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.394829 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.99 
 
 
311 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>