More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0379 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
295 aa  579  1e-164  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.767086  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.51 
 
 
299 aa  265  8e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062931 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.49 
 
 
316 aa  239  5e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.255548  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04080  carbohydrate ABC transporter membrane protein  47.02 
 
 
294 aa  231  9e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  48.59 
 
 
313 aa  219  5e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000718721  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.26 
 
 
297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.7 
 
 
287 aa  202  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06580  carbohydrate ABC transporter membrane protein  40.07 
 
 
318 aa  202  7e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.61 
 
 
310 aa  201  8e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0186923 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.36 
 
 
296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0579092  normal  0.0820796 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.49 
 
 
314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.51197  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04010  carbohydrate ABC transporter membrane protein  42.38 
 
 
312 aa  194  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03910  carbohydrate ABC transporter membrane protein  45.77 
 
 
326 aa  192  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.669588 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0929  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  44.02 
 
 
308 aa  192  5e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.574591  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.55 
 
 
305 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1763  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  40.32 
 
 
323 aa  189  5e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0129756  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.33 
 
 
304 aa  186  4e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.058143  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 
314 aa  180  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
278 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264075  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.82 
 
 
298 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0911213  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1007  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  41.88 
 
 
320 aa  170  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324625  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.38 
 
 
306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.157384  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.175132  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
315 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000228392  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
279 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.232459 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
286 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728774  normal  0.302995 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.91 
 
 
286 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453278  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
327 aa  121  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.128939 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 
298 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0935  multiple sugar transport system permease protein  31.14 
 
 
328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36894  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.1 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.43 
 
 
302 aa  119  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36 
 
 
328 aa  119  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0926617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6585  lactose transport system (permease)  37.46 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.95 
 
 
316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0497455  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 
308 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172129  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1443  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.58 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0903613  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
299 aa  112  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000030377  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.14 
 
 
316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.2607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5460  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
334 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
328 aa  109  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0536  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease  29.05 
 
 
310 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0567  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease protein  29.05 
 
 
310 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1875  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  28.28 
 
 
350 aa  108  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0432685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0477  ABC tranporter, permease protein  27.38 
 
 
315 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0630  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein, putative  28.72 
 
 
310 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
295 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727517  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.7 
 
 
328 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.913769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3307  sugar transport system (permease)  32.89 
 
 
325 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0698  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  28.72 
 
 
310 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.94 
 
 
293 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0480  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  28.72 
 
 
310 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0623  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  28.72 
 
 
310 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0604  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  28.28 
 
 
310 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.38 
 
 
310 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
297 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185813 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0737  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 
293 aa  106  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
323 aa  106  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000203032 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.21 
 
 
318 aa  105  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.04 
 
 
322 aa  105  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.946878  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4735  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  28.38 
 
 
310 aa  105  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06940  hypothetical protein  33.33 
 
 
329 aa  105  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3250  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  27.93 
 
 
310 aa  105  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.87 
 
 
324 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.455385  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0478  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  28.38 
 
 
310 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.89 
 
 
299 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.67 
 
 
300 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 
311 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.5 
 
 
353 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7172  sugar transport system (permease)  29.06 
 
 
323 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0377247 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0068  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.79 
 
 
315 aa  103  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.09 
 
 
330 aa  102  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21160  carbohydrate ABC transporter membrane protein  29.12 
 
 
314 aa  102  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103465  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3725  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  31.77 
 
 
322 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8235  ABC transporter, permease protein  31.56 
 
 
306 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.58 
 
 
335 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0186858  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  30.04 
 
 
287 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
294 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00013616  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3020  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  31.41 
 
 
319 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3210  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  31.77 
 
 
294 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0692597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1761  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  31.77 
 
 
294 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3696  sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpA  31.77 
 
 
322 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3754  sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpA  31.77 
 
 
294 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2793  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  31.77 
 
 
294 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1290  ABC transporter, permease protein  30.04 
 
 
311 aa  101  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.18 
 
 
315 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.62 
 
 
338 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254991 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29440  permease component of ABC-type sugar transporter  27.05 
 
 
318 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.51 
 
 
294 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3147  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
319 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00382098  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.16 
 
 
314 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
296 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.648492  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.4 
 
 
316 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08410  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.6 
 
 
379 aa  99.8  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.166742 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2710  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.62 
 
 
294 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0572034  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.54 
 
 
317 aa  99.4  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 
322 aa  99.4  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.34 
 
 
295 aa  99.4  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000506379  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.19 
 
 
310 aa  99.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181942  normal  0.51159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>