More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0513 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
314 aa  615  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3147  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.18 
 
 
319 aa  464  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00382098  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21160  carbohydrate ABC transporter membrane protein  73.16 
 
 
314 aa  441  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103465  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.25 
 
 
353 aa  360  2e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.45 
 
 
293 aa  243  3e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1606  ABC transporter sugar permease  42.76 
 
 
293 aa  238  9e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
291 aa  232  5e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0196347  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00881  ABC transporter sugar permease  43.1 
 
 
294 aa  226  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0244413  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.1 
 
 
293 aa  223  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990678  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.37 
 
 
317 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.14 
 
 
299 aa  218  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.426381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  46.62 
 
 
287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.83 
 
 
298 aa  212  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
299 aa  204  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.31 
 
 
294 aa  204  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.62 
 
 
309 aa  203  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325465  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.92 
 
 
295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.08 
 
 
313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.83 
 
 
308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172129  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230008  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.65 
 
 
311 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
295 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000506379  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
308 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.48209 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.63 
 
 
309 aa  194  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.82 
 
 
315 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0308401  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.07 
 
 
297 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  39.45 
 
 
288 aa  192  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.05 
 
 
310 aa  192  8e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2545  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.7 
 
 
316 aa  189  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.637107  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.22 
 
 
315 aa  188  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000228392  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.04 
 
 
316 aa  188  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.07 
 
 
309 aa  187  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6585  lactose transport system (permease)  41.03 
 
 
306 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.59 
 
 
306 aa  186  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.81 
 
 
320 aa  186  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.253823  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2715  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  34.62 
 
 
350 aa  186  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392142  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
279 aa  185  9e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.983189  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27700  permease component of ABC-type sugar transporter  37.59 
 
 
321 aa  185  9e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.479477 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00457854  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
300 aa  183  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.76 
 
 
294 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.83 
 
 
305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.88 
 
 
317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.10809  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1290  ABC transporter, permease protein  36.07 
 
 
311 aa  179  4.999999999999999e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.52 
 
 
309 aa  179  8e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
307 aa  178  9e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
292 aa  178  9e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  36.84 
 
 
307 aa  178  9e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.13 
 
 
307 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.22 
 
 
316 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.264329 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.63 
 
 
290 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2587  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.65 
 
 
314 aa  177  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000137508  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
316 aa  176  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 
293 aa  176  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.23 
 
 
305 aa  176  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.028536  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15070  permease component of ABC-type sugar transporter  40.82 
 
 
311 aa  175  7e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0771026  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.91 
 
 
317 aa  175  8e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.84 
 
 
429 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.225919  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.175132  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.27 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.168129  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.58 
 
 
313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00226923  hitchhiker  0.00373728 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0737  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 
308 aa  172  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.283214  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
318 aa  172  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.575298  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 
299 aa  172  5.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000030377  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06330  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.35 
 
 
368 aa  172  5.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
313 aa  172  9e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000239391  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
283 aa  172  9e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 
300 aa  172  9e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
372 aa  172  9e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.888329  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.98 
 
 
321 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11610  permease component of ABC-type sugar transporter  37.7 
 
 
311 aa  171  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.117578  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  37.41 
 
 
305 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2160  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 
292 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.07173  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0563  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.79 
 
 
294 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22835  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 
286 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453278  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
293 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.47 
 
 
326 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29330  permease component of ABC-type sugar transporter  36.57 
 
 
321 aa  171  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.39 
 
 
324 aa  170  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1449  lactose transport system permease protein  36.97 
 
 
290 aa  170  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0650773 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.79 
 
 
318 aa  170  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
303 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000249122  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.06 
 
 
291 aa  170  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.199241  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1954  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
359 aa  170  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299224 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1100  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.76 
 
 
300 aa  170  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.28 
 
 
307 aa  170  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  33.66 
 
 
317 aa  169  6e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
292 aa  169  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.65 
 
 
286 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728774  normal  0.302995 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 
298 aa  169  8e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2863  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.77 
 
 
356 aa  167  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1051  lactose transport system permease protein  36.33 
 
 
306 aa  168  1e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.390377  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0828  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
316 aa  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.83 
 
 
307 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
302 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000597022  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8235  ABC transporter, permease protein  35.53 
 
 
306 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.06 
 
 
314 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.59424  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.63 
 
 
310 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>