More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0309 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
304 aa  598  1e-170  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.058143  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03910  carbohydrate ABC transporter membrane protein  75 
 
 
326 aa  408  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.669588 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04010  carbohydrate ABC transporter membrane protein  63.57 
 
 
312 aa  335  3.9999999999999995e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  57 
 
 
313 aa  302  4.0000000000000003e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000718721  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.14 
 
 
296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0579092  normal  0.0820796 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04080  carbohydrate ABC transporter membrane protein  42.55 
 
 
294 aa  225  6e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.09 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062931 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.18 
 
 
316 aa  212  7.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.255548  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.42 
 
 
297 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.92 
 
 
295 aa  207  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.767086  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06580  carbohydrate ABC transporter membrane protein  39.08 
 
 
318 aa  191  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.95 
 
 
310 aa  190  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0186923 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.81 
 
 
298 aa  175  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0911213  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
314 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.51197  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.26 
 
 
287 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.09 
 
 
314 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0929  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  39.23 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.574591  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.71 
 
 
278 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264075  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
305 aa  155  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1007  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  38.46 
 
 
320 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324625  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1763  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  35.91 
 
 
323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0129756  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1443  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.6 
 
 
303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0903613  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03080  permease component of ABC-type sugar transporter  33.1 
 
 
322 aa  132  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 
295 aa  123  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727517  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172129  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.55 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.03 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.93 
 
 
305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0388505  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1900  sugar ABC transporter, permease protein, putative  31.54 
 
 
314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1635  sugar ABC transporter, permease  31.54 
 
 
314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000228392  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.88 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000506379  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.99 
 
 
279 aa  112  9e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.232459 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0477  ABC tranporter, permease protein  28.38 
 
 
315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  29.67 
 
 
287 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.58 
 
 
299 aa  109  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
299 aa  109  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000030377  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.68 
 
 
291 aa  109  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.216687  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29440  permease component of ABC-type sugar transporter  28.98 
 
 
318 aa  109  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0526  ABC-type sugar transport systems permease components-like  29.87 
 
 
293 aa  108  8.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.9 
 
 
326 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0380307  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02940  carbohydrate ABC transporter membrane protein  29.64 
 
 
318 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0698  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  28.77 
 
 
310 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0630  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein, putative  28.77 
 
 
310 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.34 
 
 
306 aa  106  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.157384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.72 
 
 
324 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.455385  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0480  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  28.42 
 
 
310 aa  105  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0623  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  28.42 
 
 
310 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0656  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  28.23 
 
 
293 aa  105  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552753  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0618  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  28.23 
 
 
293 aa  105  9e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0478  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  28.42 
 
 
310 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
320 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.495335  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0604  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  28.07 
 
 
310 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.35 
 
 
307 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4017  carbohydrate ABC transporter permease  26.78 
 
 
294 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0964  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.79 
 
 
313 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194798  decreased coverage  0.00518822 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4735  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  28.07 
 
 
310 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0536  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease  28.07 
 
 
310 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0567  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease protein  28.07 
 
 
310 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3574  carbohydrate ABC transporter permease  26.78 
 
 
294 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.78 
 
 
294 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.48 
 
 
327 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0175684  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00881  ABC transporter sugar permease  29.43 
 
 
294 aa  103  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0244413  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.13 
 
 
312 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.308461  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.64 
 
 
289 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.74 
 
 
335 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0186858  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3307  sugar transport system (permease)  29.33 
 
 
325 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.33 
 
 
318 aa  102  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0935  multiple sugar transport system permease protein  29.28 
 
 
328 aa  102  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36894  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
311 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.62 
 
 
318 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.69 
 
 
297 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.45 
 
 
297 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.43 
 
 
293 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990678  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3250  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  28.87 
 
 
310 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0068  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.8 
 
 
315 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.14 
 
 
292 aa  101  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.44 
 
 
310 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
317 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0740262  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  26.37 
 
 
317 aa  100  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.86 
 
 
328 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.00155627 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1606  ABC transporter sugar permease  27.42 
 
 
293 aa  100  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
350 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252536  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.76 
 
 
288 aa  100  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.02 
 
 
311 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 
318 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.575298  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.48 
 
 
290 aa  100  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000136101  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.42 
 
 
312 aa  99.8  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2711  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.33 
 
 
294 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.691644  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.33 
 
 
294 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3551  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
301 aa  99.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.963791  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2496  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
311 aa  99.4  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.76 
 
 
293 aa  99  8e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.64 
 
 
293 aa  99  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.548655  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.19 
 
 
322 aa  99  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.946878  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0769  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.76 
 
 
313 aa  99  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.33 
 
 
313 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115668  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.45 
 
 
303 aa  98.2  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.693678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>