More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_17030 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_17030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  100 
 
 
313 aa  608  1e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000718721  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03910  carbohydrate ABC transporter membrane protein  56.91 
 
 
326 aa  296  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.669588 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.66 
 
 
304 aa  287  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.058143  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04010  carbohydrate ABC transporter membrane protein  53.8 
 
 
312 aa  276  4e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.75 
 
 
296 aa  249  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0579092  normal  0.0820796 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.99 
 
 
316 aa  225  9e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.255548  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.59 
 
 
295 aa  223  4e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.767086  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.29 
 
 
299 aa  209  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062931 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04080  carbohydrate ABC transporter membrane protein  39.31 
 
 
294 aa  189  8e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.8 
 
 
297 aa  189  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06580  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.81 
 
 
318 aa  183  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0186923 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.49 
 
 
314 aa  167  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.51197  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
314 aa  166  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.49 
 
 
287 aa  163  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1763  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  36.03 
 
 
323 aa  160  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0129756  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0929  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  35.52 
 
 
308 aa  159  5e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.574591  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 
278 aa  159  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264075  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
298 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0911213  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1007  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  33.67 
 
 
320 aa  152  8e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324625  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
305 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
309 aa  136  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727517  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.157384  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.97 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1443  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.58 
 
 
303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0903613  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
296 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5466  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.1 
 
 
293 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0543502  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
309 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325465  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.74 
 
 
295 aa  123  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000506379  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0068  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 
315 aa  123  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.58 
 
 
315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000228392  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.644081  normal  0.138738 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.43 
 
 
293 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.565462 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.48 
 
 
293 aa  120  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.48 
 
 
293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33 
 
 
306 aa  119  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0924232  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.96 
 
 
293 aa  119  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990678  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03080  permease component of ABC-type sugar transporter  33.21 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.55 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
298 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
299 aa  118  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.175132  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
299 aa  117  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000030377  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0477  ABC tranporter, permease protein  27.57 
 
 
315 aa  116  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.13 
 
 
307 aa  116  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 
316 aa  116  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000245953 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  28.9 
 
 
317 aa  116  6e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2587  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.51 
 
 
314 aa  115  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000137508  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.21 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.63 
 
 
324 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.455385  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00881  ABC transporter sugar permease  28.33 
 
 
294 aa  113  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0244413  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.53 
 
 
326 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.37 
 
 
293 aa  112  6e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.03 
 
 
288 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
318 aa  112  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.575298  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.81 
 
 
328 aa  112  8.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.00155627 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 
300 aa  112  9e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27700  permease component of ABC-type sugar transporter  32.25 
 
 
321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.479477 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.43 
 
 
293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.38 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.199959 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.87 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1900  sugar ABC transporter, permease protein, putative  28.68 
 
 
314 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1635  sugar ABC transporter, permease  28.68 
 
 
314 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3651  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.43 
 
 
301 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 
292 aa  110  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3289  ABC glycerol-3-phosphate transporter, inner membrane subunit UgpA  30.72 
 
 
293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
283 aa  109  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1606  ABC transporter sugar permease  28.71 
 
 
293 aa  109  6e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
306 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 
307 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.83 
 
 
317 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
316 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00640866  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.71 
 
 
316 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0497455  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0125  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.38 
 
 
302 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
309 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.83 
 
 
308 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  30.8 
 
 
287 aa  106  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2496  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.6 
 
 
311 aa  106  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.23 
 
 
305 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0388505  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1875  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  35.43 
 
 
350 aa  105  7e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0432685  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1186  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.09 
 
 
293 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0963268  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3307  sugar transport system (permease)  28.72 
 
 
325 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.76 
 
 
303 aa  105  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0695484  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0935  multiple sugar transport system permease protein  29.37 
 
 
328 aa  105  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36894  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02940  carbohydrate ABC transporter membrane protein  29.07 
 
 
318 aa  105  9e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3020  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  29.51 
 
 
319 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.21 
 
 
313 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.05 
 
 
313 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.87 
 
 
311 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.01 
 
 
316 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.2607 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.31 
 
 
314 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000200699  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.32 
 
 
308 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.76 
 
 
293 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  32.4 
 
 
288 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.76 
 
 
293 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0106698  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4017  carbohydrate ABC transporter permease  29.35 
 
 
294 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.21 
 
 
294 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.576949 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0647  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.08 
 
 
325 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3105  ABC transporter, permease component  34.73 
 
 
294 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>