More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1389 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
300 aa  593  1e-168  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0114019  normal  0.0892858 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.56 
 
 
291 aa  222  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 
309 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282921  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  38.28 
 
 
318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2171  carbohydrate ABC transporter permease  37.99 
 
 
280 aa  195  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0580768  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2279  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
286 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2083  carbohydrate ABC transporter permease  38.24 
 
 
286 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0183943 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.19 
 
 
294 aa  192  8e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
308 aa  187  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.92 
 
 
313 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
313 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.394829 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0867066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
286 aa  176  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.771132  normal  0.363599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
287 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1755  ABC transporter permease  36.74 
 
 
312 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.576454  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 
294 aa  170  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.75 
 
 
307 aa  169  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  36.75 
 
 
307 aa  169  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 
291 aa  166  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
322 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535373  normal  0.626108 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
280 aa  165  9e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.12 
 
 
292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.568052  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.257134 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0543799999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
314 aa  162  7e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0144983  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
286 aa  162  9e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000108841  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
310 aa  162  9e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.56 
 
 
318 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  34.97 
 
 
305 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0940  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.49 
 
 
289 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0257  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
291 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.958787  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.13 
 
 
289 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205446  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2900  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.13 
 
 
295 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4988  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
301 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.85 
 
 
295 aa  159  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.16 
 
 
306 aa  158  9e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.13 
 
 
289 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.13 
 
 
289 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.13 
 
 
289 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
302 aa  158  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
307 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.701562  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
305 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2698  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
295 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0832027  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20460  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.78 
 
 
321 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000522199  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.85 
 
 
311 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.704951 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.79 
 
 
299 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
289 aa  156  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0888929 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.1 
 
 
292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.67 
 
 
293 aa  155  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.22 
 
 
427 aa  155  7e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000129291  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
318 aa  155  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4157  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
289 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
293 aa  155  9e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
286 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235933  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
286 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.80505  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
286 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.524108  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
306 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0924232  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
435 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0949  permease protein of sugar ABC transporter  34.4 
 
 
292 aa  153  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688345  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1261  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.23 
 
 
298 aa  152  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196832  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3241  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 
290 aa  152  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 
305 aa  152  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
308 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
308 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.853442  normal  0.685254 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.19 
 
 
299 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.456499 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3725  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  32.43 
 
 
322 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119738  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
309 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
308 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.172958  normal  0.378531 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3493  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.11 
 
 
294 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12077  sugar ABC transporter membrane protein  31.08 
 
 
300 aa  150  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3210  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  32.43 
 
 
294 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0692597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1761  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  32.43 
 
 
294 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3696  sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpA  32.43 
 
 
322 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3754  sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpA  32.43 
 
 
294 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2793  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  32.43 
 
 
294 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.51 
 
 
365 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482665  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3020  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  32.77 
 
 
319 aa  149  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2711  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
294 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.691644  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
294 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.4 
 
 
330 aa  148  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0817185  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
307 aa  148  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3778  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.42 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0630  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein, putative  32.43 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.66 
 
 
372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.452199  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0698  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  32.43 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.93 
 
 
321 aa  146  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4978  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.54 
 
 
298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692905  normal  0.0538219 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.788363  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.88 
 
 
310 aa  146  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5702  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 
300 aa  145  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.53 
 
 
296 aa  145  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0480  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  32.09 
 
 
310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.9 
 
 
262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.772214  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0623  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  32.09 
 
 
310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>