More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3593 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
289 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
289 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
289 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0940  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  98.27 
 
 
289 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  96.89 
 
 
289 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205446  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4157  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  96.89 
 
 
289 aa  527  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3241  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.23 
 
 
290 aa  282  6.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.58 
 
 
290 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.73 
 
 
313 aa  199  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.25 
 
 
314 aa  183  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0144983  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.3 
 
 
296 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0543799999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.64 
 
 
330 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0584633  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.16 
 
 
309 aa  178  8e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282921  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.16 
 
 
294 aa  178  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1755  ABC transporter permease  39.02 
 
 
312 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.576454  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  37.12 
 
 
318 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.09 
 
 
309 aa  176  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800905  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.37 
 
 
312 aa  175  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0867066 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.37 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.394829 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.23 
 
 
292 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.568052  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.23 
 
 
330 aa  169  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.5 
 
 
304 aa  169  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44429  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
312 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
291 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
328 aa  166  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.00155627 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3574  carbohydrate ABC transporter permease  35.13 
 
 
294 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.13 
 
 
294 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4017  carbohydrate ABC transporter permease  35.13 
 
 
294 aa  165  5.9999999999999996e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
296 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515819  normal  0.562108 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.98 
 
 
307 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.701562  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2171  carbohydrate ABC transporter permease  40.87 
 
 
280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0580768  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2279  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.87 
 
 
286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 
293 aa  162  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2083  carbohydrate ABC transporter permease  40.43 
 
 
286 aa  160  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0183943 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
285 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00879782  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8235  ABC transporter, permease protein  38.52 
 
 
306 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
300 aa  158  9e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0114019  normal  0.0892858 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11550  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.02 
 
 
354 aa  158  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.0144146 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.88 
 
 
295 aa  158  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.25 
 
 
305 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2900  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.35 
 
 
295 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.46 
 
 
291 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.216687  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.23 
 
 
301 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.06 
 
 
291 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
299 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 
286 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.771132  normal  0.363599 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
318 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
291 aa  155  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.31 
 
 
293 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.555685 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
318 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1742  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 
292 aa  155  8e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
291 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.257134 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0419  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.15 
 
 
296 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
295 aa  153  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.982578  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
296 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.467118  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
306 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.17 
 
 
300 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000378352  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.33 
 
 
295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.53 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1691  oligogalacturonide ABC tansporter, permease protein  33.95 
 
 
296 aa  153  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.041328  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.95 
 
 
296 aa  153  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.780468  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
293 aa  152  5e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0994152  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
293 aa  152  5e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
296 aa  152  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.57 
 
 
294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
322 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535373  normal  0.626108 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0949  permease protein of sugar ABC transporter  34.97 
 
 
292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688345  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.15 
 
 
296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
299 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.456499 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.74 
 
 
295 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02940  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.92 
 
 
318 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.78 
 
 
336 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.788363  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2645  oligogalacturonide ABC tansporter, permease  33.58 
 
 
296 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.952468  normal  0.0439933 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.95 
 
 
332 aa  150  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
309 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.04 
 
 
330 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0817185  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.39 
 
 
311 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17058  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
309 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.43514  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1969  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.41 
 
 
296 aa  149  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
307 aa  149  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
307 aa  149  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  36.33 
 
 
307 aa  149  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6903  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.28 
 
 
324 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156181  normal  0.0141251 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3250  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  33.33 
 
 
310 aa  149  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
286 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235933  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
286 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.80505  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
286 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.524108  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
296 aa  149  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.243021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  38.24 
 
 
288 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
435 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.69 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270687  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0548  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpA  38.08 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7824  putative ABC transporter permease protein  35 
 
 
295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.78 
 
 
315 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0566553  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
307 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000296099  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.26 
 
 
320 aa  146  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28370  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.55 
 
 
287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.096742  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.06 
 
 
305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155715  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>