More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2464 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
286 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235933  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
286 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.80505  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
286 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.524108  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.99 
 
 
286 aa  422  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.771132  normal  0.363599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.44 
 
 
287 aa  401  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.77 
 
 
283 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.37 
 
 
313 aa  182  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.58 
 
 
308 aa  179  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2279  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.26 
 
 
286 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2171  carbohydrate ABC transporter permease  37.26 
 
 
280 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0580768  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2083  carbohydrate ABC transporter permease  37.26 
 
 
286 aa  178  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0183943 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
292 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2698  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0832027  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.01 
 
 
316 aa  172  7.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.6 
 
 
312 aa  169  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
291 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.257134 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1261  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.88 
 
 
298 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196832  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.82 
 
 
312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0867066 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.568052  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.82 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.394829 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
319 aa  163  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32149  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
330 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0584633  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.4 
 
 
318 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.4 
 
 
318 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.4 
 
 
318 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177004  normal  0.445691 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03710  carbohydrate ABC transporter membrane protein  38.04 
 
 
332 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
300 aa  159  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0114019  normal  0.0892858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  31.62 
 
 
318 aa  158  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
293 aa  157  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.215175  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
305 aa  155  5.0000000000000005e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.6 
 
 
299 aa  155  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270687  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
309 aa  155  7e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282921  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.41 
 
 
317 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.140823  normal  0.731226 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
294 aa  154  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
296 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.34 
 
 
289 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.34 
 
 
289 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.34 
 
 
289 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1755  ABC transporter permease  31.05 
 
 
312 aa  152  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.576454  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 
307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.701562  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0548  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpA  37.05 
 
 
288 aa  151  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
322 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535373  normal  0.626108 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.02 
 
 
289 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205446  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 
314 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0144983  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.24 
 
 
330 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0817185  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
315 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0566553  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.62 
 
 
427 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000129291  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.22 
 
 
301 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4157  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.6 
 
 
289 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0940  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.55 
 
 
289 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7824  putative ABC transporter permease protein  34.98 
 
 
295 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4988  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 
301 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 
280 aa  149  8e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0176  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.02 
 
 
314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.158412  hitchhiker  0.000108715 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4978  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692905  normal  0.0538219 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0164712  normal  0.951999 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.292649  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
318 aa  146  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 
310 aa  145  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.17 
 
 
293 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0994152  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.17 
 
 
293 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
320 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.227719  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.54 
 
 
310 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
306 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.306567  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
309 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800905  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.13 
 
 
324 aa  143  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20480  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.94 
 
 
318 aa  143  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0521728  normal  0.389193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
311 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.704951 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.21 
 
 
295 aa  142  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 
328 aa  142  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0236  sugar ABC transporter, permease protein  34.06 
 
 
307 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2279  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
435 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0280  sugar ABC transporter, permease protein  32.3 
 
 
325 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2900  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
295 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0305  sugar ABC transporter, permease protein  32.3 
 
 
325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474821  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0281  ABC transporter, inner membrane subunit  33.82 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4442  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0640685 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3568  ABC transporter membrane spanning protein (sorbitol/mannitol)  31.94 
 
 
290 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.54 
 
 
296 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0543799999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0229  sugar ABC transporter, permease protein  34.06 
 
 
307 aa  140  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.49 
 
 
320 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.95 
 
 
305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.371496  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3852  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
310 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0634568 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
286 aa  139  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262739  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.89 
 
 
299 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.456499 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.89 
 
 
299 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 
317 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.42447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1114  sugar ABC transporter, permease protein  29.3 
 
 
301 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212611  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
315 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.64 
 
 
312 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.11 
 
 
319 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128042  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
312 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.36 
 
 
291 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0157  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.07 
 
 
305 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.29092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3226  putative sugar ABC transporter, permease protein  32.6 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.498538 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>