More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2279 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_2279  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
286 aa  564  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2083  carbohydrate ABC transporter permease  99.65 
 
 
286 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0183943 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2171  carbohydrate ABC transporter permease  98.53 
 
 
280 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0580768  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.25 
 
 
312 aa  212  5.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.52 
 
 
313 aa  209  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.64 
 
 
292 aa  205  7e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.568052  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1755  ABC transporter permease  38.52 
 
 
312 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.576454  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.4 
 
 
312 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0867066 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.81 
 
 
313 aa  201  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.394829 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.51 
 
 
308 aa  198  9e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.78 
 
 
305 aa  196  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.13 
 
 
286 aa  196  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.771132  normal  0.363599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  37.5 
 
 
318 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
300 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0114019  normal  0.0892858 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.97 
 
 
294 aa  187  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.42 
 
 
291 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.05 
 
 
309 aa  185  9e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282921  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.257134 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.98 
 
 
287 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
294 aa  177  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 
435 aa  175  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.65 
 
 
307 aa  175  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.701562  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 
316 aa  174  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1261  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.04 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196832  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235933  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.80505  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.524108  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3241  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
290 aa  172  5e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 
306 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.03 
 
 
296 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0543799999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.35 
 
 
309 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800905  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
292 aa  170  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
316 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
325 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4442  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
325 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0640685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3713  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
297 aa  168  9e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.77 
 
 
280 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.46 
 
 
309 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03710  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.31 
 
 
332 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.3 
 
 
289 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205446  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
290 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01820  permease component of ABC-type sugar transporter  35.19 
 
 
312 aa  165  6.9999999999999995e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2698  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
295 aa  165  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0832027  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.62 
 
 
290 aa  165  8e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
286 aa  165  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000108841  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 
330 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0584633  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.87 
 
 
289 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0940  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.43 
 
 
289 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.87 
 
 
289 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.87 
 
 
289 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4157  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 
289 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0949  permease protein of sugar ABC transporter  38.43 
 
 
292 aa  160  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688345  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  33.96 
 
 
307 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
307 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
325 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3226  putative sugar ABC transporter, permease protein  40 
 
 
310 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1074  putative sugar ABC transporter, permease protein  35.95 
 
 
292 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0231  sugar ABC transporter, permease protein  35.95 
 
 
292 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
322 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535373  normal  0.626108 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
283 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0066  putative sugar ABC transporter, permease protein  35.95 
 
 
292 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0353  putative sugar ABC transporter, permease protein  35.95 
 
 
292 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.422375  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.95 
 
 
292 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1651  putative sugar ABC transporter, permease protein  35.95 
 
 
292 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278367  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1233  putative sugar ABC transporter, permease protein  35.95 
 
 
292 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
314 aa  159  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0144983  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1742  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.4 
 
 
292 aa  159  7e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
262 aa  159  7e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.772214  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0281  ABC transporter, inner membrane subunit  38.87 
 
 
292 aa  158  8e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.36 
 
 
307 aa  158  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.66 
 
 
300 aa  157  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000378352  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7366  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.79 
 
 
278 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0828384  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1178  sugar ABC transporter, permease protein, putative  35.54 
 
 
292 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0204998  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
311 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.704951 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.42 
 
 
331 aa  156  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
319 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.555984  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5799  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
319 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.534863  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7824  putative ABC transporter permease protein  36.11 
 
 
295 aa  155  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
299 aa  155  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270687  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
319 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
308 aa  155  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.04 
 
 
311 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.19 
 
 
308 aa  154  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.38 
 
 
299 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
286 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262739  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.48 
 
 
302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.579976 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.33 
 
 
310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.944367  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.16 
 
 
427 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000129291  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3852  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.6 
 
 
310 aa  152  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0634568 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4988  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
301 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
306 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  33.46 
 
 
305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
309 aa  152  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.43514  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
290 aa  152  8e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3066  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.88 
 
 
322 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.44514  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>