More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_7366 on replicon NC_007488
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007488  RSP_7366  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
278 aa  535  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0828384  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.76 
 
 
299 aa  293  3e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270687  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.91 
 
 
312 aa  202  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.8 
 
 
305 aa  201  8e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1755  ABC transporter permease  41.41 
 
 
312 aa  191  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.576454  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
312 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0867066 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.63 
 
 
313 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.394829 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
286 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.771132  normal  0.363599 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 
291 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.257134 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2083  carbohydrate ABC transporter permease  40.08 
 
 
286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0183943 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2171  carbohydrate ABC transporter permease  40.08 
 
 
280 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0580768  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2279  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
286 aa  178  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  38.99 
 
 
318 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.56 
 
 
316 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
309 aa  176  5e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282921  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.38 
 
 
294 aa  176  5e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.93 
 
 
316 aa  175  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.2 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.568052  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.72 
 
 
308 aa  169  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.03 
 
 
290 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.8 
 
 
287 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.14 
 
 
296 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0543799999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03710  carbohydrate ABC transporter membrane protein  39.93 
 
 
332 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.96 
 
 
310 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0949  permease protein of sugar ABC transporter  38.35 
 
 
292 aa  166  5e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688345  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.701562  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.7 
 
 
313 aa  163  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7824  putative ABC transporter permease protein  35.61 
 
 
295 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3250  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  38.17 
 
 
310 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
318 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.7 
 
 
283 aa  159  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.6 
 
 
280 aa  159  6e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.74 
 
 
294 aa  159  6e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 
303 aa  159  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0695484  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
316 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.130846  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 
311 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.704951 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 
310 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 
336 aa  153  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.788363  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 
286 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235933  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 
286 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.80505  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
318 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 
286 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.524108  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
330 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0584633  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
311 aa  152  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
307 aa  152  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
322 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535373  normal  0.626108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6585  lactose transport system (permease)  35.5 
 
 
306 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.76 
 
 
320 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1742  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
292 aa  150  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.05 
 
 
435 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  35.38 
 
 
307 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 
314 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0144983  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.24 
 
 
290 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
307 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2698  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
295 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0832027  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3226  putative sugar ABC transporter, permease protein  34.5 
 
 
310 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.57 
 
 
328 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.76 
 
 
328 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511246  normal  0.17987 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.1 
 
 
301 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.28 
 
 
323 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.05 
 
 
307 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 
289 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.215175  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262739  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.52 
 
 
293 aa  146  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0994152  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0305  sugar ABC transporter, permease protein  38.43 
 
 
325 aa  146  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474821  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.52 
 
 
293 aa  146  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
320 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.253823  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 
292 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1529  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
318 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.165529  normal  0.149292 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2163  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
307 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631921  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.08 
 
 
289 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205446  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.08 
 
 
289 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 
372 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.452199  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.08 
 
 
289 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
309 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800905  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.08 
 
 
289 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3241  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.34 
 
 
290 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  34.8 
 
 
305 aa  143  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0940  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.08 
 
 
289 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.46 
 
 
318 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949955  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0280  sugar ABC transporter, permease protein  37.28 
 
 
325 aa  143  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
311 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0563  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.36 
 
 
294 aa  143  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22835  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4157  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 
289 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
325 aa  142  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295531  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.77 
 
 
308 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166359  normal  0.855546 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
315 aa  142  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000228392  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3673  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.77 
 
 
308 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.246744  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.11 
 
 
324 aa  142  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
427 aa  142  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000129291  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.12 
 
 
317 aa  142  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.140823  normal  0.731226 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 
301 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657903  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.46 
 
 
318 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0625824  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
301 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>