More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2091 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
292 aa  580  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.08 
 
 
318 aa  454  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.08 
 
 
318 aa  454  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.08 
 
 
318 aa  454  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177004  normal  0.445691 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.77 
 
 
317 aa  306  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.140823  normal  0.731226 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.96 
 
 
310 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03300  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.14 
 
 
308 aa  223  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2163  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.72 
 
 
307 aa  209  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631921  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.61 
 
 
308 aa  203  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3226  putative sugar ABC transporter, permease protein  40.97 
 
 
310 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.06 
 
 
317 aa  199  6e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.42447  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.46 
 
 
316 aa  196  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.74 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.771132  normal  0.363599 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.06 
 
 
313 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
287 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.48 
 
 
286 aa  175  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235933  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.48 
 
 
286 aa  175  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.80505  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.48 
 
 
286 aa  175  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.524108  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2698  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0832027  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
427 aa  171  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000129291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39 
 
 
307 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.701562  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2171  carbohydrate ABC transporter permease  35.66 
 
 
280 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0580768  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2279  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 
286 aa  168  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2083  carbohydrate ABC transporter permease  36.23 
 
 
286 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0183943 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4988  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.16 
 
 
292 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.568052  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.12 
 
 
312 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
301 aa  159  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.07 
 
 
294 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
318 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
283 aa  156  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
296 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0543799999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
291 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
330 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0584633  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
322 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535373  normal  0.626108 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.55 
 
 
312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0867066 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0114019  normal  0.0892858 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.55 
 
 
313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.394829 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1261  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.17 
 
 
298 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196832  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.53 
 
 
318 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.22 
 
 
308 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1755  ABC transporter permease  34.41 
 
 
312 aa  149  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.576454  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
309 aa  149  7e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282921  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  32.98 
 
 
318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.788363  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 
435 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 
328 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.00155627 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 
310 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 
291 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.17 
 
 
316 aa  143  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.39 
 
 
319 aa  142  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32149  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
299 aa  142  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270687  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.52 
 
 
328 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511246  normal  0.17987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
309 aa  142  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800905  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
330 aa  142  9e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
305 aa  142  9e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
306 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0949  permease protein of sugar ABC transporter  31.72 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688345  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
291 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.257134 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.9 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.236219 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0305  sugar ABC transporter, permease protein  32.14 
 
 
325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474821  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20480  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.79 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0521728  normal  0.389193 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0280  sugar ABC transporter, permease protein  32.14 
 
 
325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07470  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.54 
 
 
304 aa  139  7e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.59 
 
 
320 aa  139  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.292649  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0548  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpA  40 
 
 
288 aa  138  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7824  putative ABC transporter permease protein  34.17 
 
 
295 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.78 
 
 
328 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
289 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205446  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.42 
 
 
320 aa  136  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03710  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.45 
 
 
332 aa  136  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0257  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.59 
 
 
291 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.958787  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
315 aa  135  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273483  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4441  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.68 
 
 
320 aa  135  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0272526  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 
309 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
301 aa  135  8e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
294 aa  135  9e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.59 
 
 
299 aa  135  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06500  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.52 
 
 
321 aa  135  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
331 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0940  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.45 
 
 
289 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.18 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.227719  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.87 
 
 
289 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.07 
 
 
312 aa  133  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.87 
 
 
289 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1114  sugar ABC transporter, permease protein  30.69 
 
 
301 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212611  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.87 
 
 
289 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.76 
 
 
293 aa  133  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.215175  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.98 
 
 
330 aa  132  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0817185  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
315 aa  132  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0281  ABC transporter, inner membrane subunit  32.63 
 
 
292 aa  132  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 
307 aa  132  7.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  37.09 
 
 
307 aa  132  7.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.29 
 
 
314 aa  132  9e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0144983  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4157  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.87 
 
 
289 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1088  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  35.59 
 
 
288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  hitchhiker  0.00755847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>