More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_06280 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_06280  permease component of ABC-type sugar transporter  100 
 
 
303 aa  600  1e-170  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05100  permease component of ABC-type sugar transporter  52.53 
 
 
316 aa  328  5.0000000000000004e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7905  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.08 
 
 
336 aa  287  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4689  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.51 
 
 
298 aa  272  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.664924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.37 
 
 
292 aa  272  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0477  ABC tranporter, permease protein  43 
 
 
315 aa  264  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.81 
 
 
318 aa  260  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.152531  normal  0.26367 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1900  sugar ABC transporter, permease protein, putative  42.01 
 
 
314 aa  238  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1635  sugar ABC transporter, permease  42.01 
 
 
314 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2165  sugar ABC transporter  58.92 
 
 
216 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
313 aa  196  6e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000239391  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.62 
 
 
305 aa  187  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00457854  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  37.79 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000200699  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.63 
 
 
312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.76 
 
 
292 aa  179  7e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.23 
 
 
318 aa  178  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949955  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7347  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  40.14 
 
 
320 aa  176  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.31 
 
 
313 aa  176  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
318 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0625824  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
298 aa  176  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
291 aa  175  7e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0196347  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
316 aa  175  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.21 
 
 
309 aa  175  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325465  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.41 
 
 
314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0166533  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
318 aa  173  3.9999999999999995e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000473727  hitchhiker  0.00124128 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 
317 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 
296 aa  171  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
308 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
295 aa  170  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000506379  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.41 
 
 
314 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00699527 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12077  sugar ABC transporter membrane protein  36.46 
 
 
300 aa  169  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  36.67 
 
 
305 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7694  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  37.75 
 
 
312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0828  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
316 aa  166  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 
320 aa  166  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.253823  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.27 
 
 
318 aa  165  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal  0.0165665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
317 aa  165  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.33 
 
 
308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172129  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 
297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29330  permease component of ABC-type sugar transporter  31.27 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.66 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.48209 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27700  permease component of ABC-type sugar transporter  36.39 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.479477 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.264329 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 
283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
306 aa  162  9e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1704  putative transport system permease ABC transporter protein  35.25 
 
 
324 aa  161  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.58 
 
 
315 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0308401  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
321 aa  161  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05250  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.43 
 
 
309 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 
317 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.10809  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.09 
 
 
309 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2545  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.25 
 
 
316 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.637107  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.79 
 
 
324 aa  159  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.21 
 
 
309 aa  160  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
318 aa  159  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.2 
 
 
319 aa  159  7e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14469  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.33 
 
 
305 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.87 
 
 
300 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2034  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
323 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.059557  normal  0.598754 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.1 
 
 
317 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000449996 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  38.32 
 
 
287 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0125  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
302 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2459  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.31 
 
 
331 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.216304  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.29 
 
 
315 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1606  ABC transporter sugar permease  35.54 
 
 
293 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.95 
 
 
306 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000185658  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29020  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.13 
 
 
275 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
417 aa  155  8e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.636087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
297 aa  155  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185813 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
294 aa  155  9e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
307 aa  155  9e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.88 
 
 
306 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.74 
 
 
328 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0926617  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.89 
 
 
325 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.406302  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
352 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.16 
 
 
292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3307  sugar transport system (permease)  33.8 
 
 
325 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29720  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.33 
 
 
312 aa  152  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.39 
 
 
319 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
321 aa  152  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
305 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
318 aa  152  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.670475  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
319 aa  152  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.55 
 
 
322 aa  152  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.946878  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.17 
 
 
309 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0377  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
294 aa  151  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.27 
 
 
314 aa  150  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
319 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000915897 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11610  permease component of ABC-type sugar transporter  33.92 
 
 
311 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.117578  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
316 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0497455  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
299 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28370  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.45 
 
 
287 aa  149  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.096742  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 
306 aa  149  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.692762  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.88 
 
 
320 aa  149  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00615148 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
328 aa  149  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.913769 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
299 aa  149  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.426381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>