77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2387 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2387  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  100 
 
 		 344 aa  691    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.246061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2325  putative periplasmic binding protein  57.39 
 
 		 348 aa  401  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000777269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4502  ABC polyamine transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.04 
 
 		 360 aa  325  9e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0815  ABC polyamine transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.52 
 
 		 348 aa  309  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2141  ABC polyamine transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.52 
 
 		 348 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.315963  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3076  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574821 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3673  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  24.79 
 
 		 348 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1957  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0869  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein PotD  24.13 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8146  spermidine/putrescine binding protein of ABC transporter  25.38 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00458388  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3862  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 		 348 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1540  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  20 
 
 		 353 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.713242  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2162  extracellular solute-binding protein  20.44 
 
 		 374 aa  53.9  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8157  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  24.65 
 
 		 345 aa  53.5  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1184  extracellular solute-binding protein  20.42 
 
 		 357 aa  53.1  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000549625  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1162  extracellular solute-binding protein  20.42 
 
 		 357 aa  53.1  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227001  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1048  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  23.58 
 
 		 345 aa  52.8  0.000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00610599  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1160  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  25.11 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000302553  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2867  extracellular solute-binding protein  22.66 
 
 		 345 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1064  extracellular solute-binding protein  22.52 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000691325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1846  extracellular solute-binding protein family 1  22.48 
 
 		 342 aa  50.8  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0748296  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6278  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  29.17 
 
 		 429 aa  49.7  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188634  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1636  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  20.76 
 
 		 348 aa  49.3  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6156  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2202  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  20.57 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5285  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  24.71 
 
 		 360 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2913  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 		 363 aa  47.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6575  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2003  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  20.57 
 
 		 348 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.59191 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2045  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 367 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.76929  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01121  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  20.57 
 
 		 348 aa  47  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1243  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  20.57 
 
 		 348 aa  47  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0566185  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2480  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  20.57 
 
 		 348 aa  47  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1501  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  20.57 
 
 		 348 aa  47  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00187951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01129  hypothetical protein  20.57 
 
 		 348 aa  47  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2524  extracellular solute-binding protein family 1  20.57 
 
 		 348 aa  47  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00059946  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1246  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  20.57 
 
 		 348 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4447  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 348 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415415  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3919  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 348 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3608  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 348 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0659  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  22.92 
 
 		 348 aa  46.2  0.0008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.717028  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1367  transcription factor jumonji, jmjC  24.42 
 
 		 365 aa  46.2  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0910  extracellular solute-binding protein  22.64 
 
 		 360 aa  46.2  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0903  extracellular solute-binding protein  21.43 
 
 		 359 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.551806  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0425  extracellular solute-binding protein family 1  26 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2918  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000482793  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3097  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218628  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3719  periplasmic polyamine-binding protein, putative  22.59 
 
 		 367 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0307875  normal  0.343759 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3813  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1061  extracellular solute-binding protein  22.57 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02285  hypothetical protein  21.71 
 
 		 345 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3000  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00190221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2372  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 367 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.984752  normal  0.0187734 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3534  twin-arginine translocation pathway signal  28.19 
 
 		 422 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0997  putative substrate-binding component of ABC transporter  26.01 
 
 		 406 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.88303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2893  putative ABC transporter substrate-binding protein  27.75 
 
 		 429 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0883861 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3943  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  27.57 
 
 		 420 aa  43.9  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.627454  normal  0.644555 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2169  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  22.77 
 
 		 348 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00563875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0185  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 		 379 aa  43.5  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3297  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 348 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5836  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  23.28 
 
 		 392 aa  43.5  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4739  ABC transporter substrate-binding protein  26.04 
 
 		 426 aa  43.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.640775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1337  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  19.62 
 
 		 348 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0644011 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003485  ABC transporter periplasmic spermidine putrescine-binding protein PotD  21.32 
 
 		 345 aa  43.1  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00749522  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2658  putative spermidine/putrescine ABC transporter, substrate-binding protein  28.72 
 
 		 432 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1584  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor (SPBP)  20.16 
 
 		 347 aa  43.1  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00366918  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2146  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  19.62 
 
 		 348 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543395 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1962  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  19.62 
 
 		 348 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1299  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  19.62 
 
 		 348 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1322  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  19.62 
 
 		 348 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0110419 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1503  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  25.26 
 
 		 352 aa  42.7  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541175  normal  0.0238338 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5902  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  27.87 
 
 		 433 aa  42.7  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.950335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4390  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 374 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243685  normal  0.0624884 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1869  extracellular solute-binding protein family 1  25.1 
 
 		 343 aa  42.7  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5429  extracellular solute-binding protein  21.64 
 
 		 370 aa  42.7  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  0.485743 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2144  spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  19.57 
 
 		 347 aa  42.4  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1094  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 366 aa  42.7  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.799805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>