More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4170 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4170  tRNA synthetase class II (D K and N)  100 
 
 		 416 aa  807    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.90101 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3854  tRNA synthetase class II (D K and N)  47.69 
 
 		 390 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.64996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2162  tRNA synthetase class II (D K and N)  42.86 
 
 		 305 aa  235  9e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3783  tRNA synthetase class II (D K and N)  47.23 
 
 		 339 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3867  tRNA synthetase class II (D K and N)  46.58 
 
 		 339 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2054  tRNA synthetase class II (D K and N)  42.55 
 
 		 302 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1914  tRNA synthetase class II (D K and N)  41.51 
 
 		 302 aa  231  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000371414  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2490  hypothetical protein  42.06 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1078  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  45.62 
 
 		 358 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3726  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  48.21 
 
 		 340 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3164  tRNA synthetase class II (D K and N)  42.5 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0465087  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1839  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  42.38 
 
 		 307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000593972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 		 494 aa  219  8.999999999999998e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 490 aa  218  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1753  lysyl-tRNA synthetase-related protein  41.8 
 
 		 307 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2375  lysine--tRNA ligase  43.83 
 
 		 329 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0787  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  37.43 
 
 		 309 aa  215  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2148  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  37.58 
 
 		 307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000938384  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2505  lysine--tRNA ligase  43.48 
 
 		 351 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.418111  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2793  tRNA synthetase class II (D K and N)  44.34 
 
 		 351 aa  213  7e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0477928  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4013  putative lysyl-tRNA synthetase (lysine--tRNA ligase)  41.45 
 
 		 351 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0869  lysyl-tRNA synthetase-related protein  36.89 
 
 		 309 aa  211  2e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.584702  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3004  tRNA synthetase class II (D K and N)  44 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0405088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2955  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  44.04 
 
 		 351 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3229  tRNA synthetase class II (D K and N)  44 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.504113 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 484 aa  211  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0378  lysine--tRNA ligase  45.59 
 
 		 350 aa  210  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.682721 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 		 510 aa  211  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 		 489 aa  210  4e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3193  tRNA synthetase class II (D K and N)  43.69 
 
 		 352 aa  209  7e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 523 aa  208  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2739  lysine--tRNA ligase  44.72 
 
 		 351 aa  208  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.525407 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_772  lysyl-tRNA synthetase, truncated  35.82 
 
 		 309 aa  206  7e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_517  lysyl-tRNA synthetase (class II)  35.2 
 
 		 498 aa  206  7e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 		 499 aa  205  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 		 499 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 		 497 aa  205  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2800  lysyl-tRNA synthetase  34.06 
 
 		 498 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.366635  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0551  lysyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 498 aa  204  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4127  Lysine--tRNA ligase  41.54 
 
 		 353 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.271818 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3477  lysine--tRNA ligase  44.07 
 
 		 350 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 		 494 aa  203  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 561 aa  203  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3798  Lysine--tRNA ligase  41.64 
 
 		 353 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00227981  normal  0.497071 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 489 aa  202  8e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2808  lysine--tRNA ligase  41.09 
 
 		 350 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0578  lysyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 		 498 aa  202  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.873191  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1642  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  41.52 
 
 		 347 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.576369  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1885  tRNA synthetase class II (D K and N)  42.86 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.70209  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0076  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  40.92 
 
 		 308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211286 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3224  lysine--tRNA ligase  41.16 
 
 		 361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.428603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3742  lysyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 		 496 aa  201  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 		 491 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2301  lysine--tRNA ligase  42.07 
 
 		 345 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275563  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1498  tRNA synthetase class II (D K and N)  43.91 
 
 		 340 aa  199  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.205908  normal  0.591538 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  33.75 
 
 		 494 aa  200  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6025  lysyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 357 aa  199  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.858577  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2229  lysyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 349 aa  199  7.999999999999999e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.188508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  33.65 
 
 		 488 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 501 aa  198  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3428  lysyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 509 aa  199  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904218 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2781  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  40.18 
 
 		 322 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 		 503 aa  197  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  32.91 
 
 		 515 aa  197  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  32.91 
 
 		 515 aa  197  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  34.59 
 
 		 503 aa  196  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2207  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  38.82 
 
 		 330 aa  196  7e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04027  lysyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 		 325 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3835  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  36.45 
 
 		 325 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1496  lysyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 		 500 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  0.804947 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4626  lysyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 		 325 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0839984 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03989  hypothetical protein  36.45 
 
 		 325 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4714  lysyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 		 325 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.791182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4399  lysyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 		 325 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5673  lysyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 		 325 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.17046 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4687  lysyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 		 325 aa  196  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.981409  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  35.53 
 
 		 492 aa  195  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3855  lysyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 		 325 aa  195  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00133285 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4226  lysyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 		 500 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.366371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4741  lysyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 325 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4762  lysyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.827317 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  32.28 
 
 		 495 aa  194  2e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  35.33 
 
 		 583 aa  195  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1311  lysyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 		 500 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484413 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  35.94 
 
 		 504 aa  194  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0762  lysine--tRNA ligase  44.68 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756358  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4622  lysyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4705  lysyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4614  lysyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.594866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2625  lysyl-tRNA synthetase-related protein  40.06 
 
 		 356 aa  194  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1060  lysyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 		 499 aa  194  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.175669  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1101  lysyl-tRNA synthetase  33.54 
 
 		 500 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  33.13 
 
 		 501 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1276  lysyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 323 aa  194  3e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 		 501 aa  193  4e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 		 509 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1501  lysyl-tRNA synthetase  32.81 
 
 		 500 aa  193  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 		 573 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0478  putative lysyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 345 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181681  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4121  lysyl-tRNA synthetase  33.23 
 
 		 500 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>