More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0787 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0787  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  100 
 
 		 309 aa  645    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_772  lysyl-tRNA synthetase, truncated  84.79 
 
 		 309 aa  556  1e-157  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0869  lysyl-tRNA synthetase-related protein  81.23 
 
 		 309 aa  545  1e-154  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.584702  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1839  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  46.64 
 
 		 307 aa  271  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000593972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2162  tRNA synthetase class II (D K and N)  45.82 
 
 		 305 aa  264  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2054  tRNA synthetase class II (D K and N)  46.15 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0076  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  46.56 
 
 		 308 aa  261  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211286 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2148  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  44.67 
 
 		 307 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000938384  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1753  lysyl-tRNA synthetase-related protein  45.15 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2490  hypothetical protein  43.14 
 
 		 304 aa  250  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1764  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  44.11 
 
 		 301 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.076019  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3164  tRNA synthetase class II (D K and N)  40.89 
 
 		 301 aa  227  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0465087  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1914  tRNA synthetase class II (D K and N)  41.1 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000371414  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3854  tRNA synthetase class II (D K and N)  38.75 
 
 		 390 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.64996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  35.94 
 
 		 497 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 		 491 aa  195  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2781  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  37.65 
 
 		 322 aa  192  9e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 		 499 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 		 494 aa  189  5.999999999999999e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 		 489 aa  188  9e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 499 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3783  tRNA synthetase class II (D K and N)  36.45 
 
 		 339 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3867  tRNA synthetase class II (D K and N)  36.45 
 
 		 339 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1741  hypothetical protein  34.67 
 
 		 496 aa  186  5e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  35 
 
 		 499 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3277  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  34.42 
 
 		 326 aa  185  7e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.680936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0159  lysyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 502 aa  184  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 		 562 aa  184  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  35.35 
 
 		 489 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2354  lysyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 496 aa  183  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0808673  decreased coverage  0.00196891 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  34.08 
 
 		 502 aa  183  3e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4170  tRNA synthetase class II (D K and N)  37.17 
 
 		 416 aa  183  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.90101 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 		 494 aa  183  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1741  hypothetical protein  35.09 
 
 		 496 aa  183  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 		 497 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2375  lysine--tRNA ligase  36.31 
 
 		 329 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3726  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  36.11 
 
 		 340 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  34.58 
 
 		 505 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  34.93 
 
 		 505 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  34.58 
 
 		 505 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 		 505 aa  181  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 505 aa  181  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 		 505 aa  181  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  34.93 
 
 		 505 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 		 505 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 		 505 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 505 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 		 505 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 505 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 		 505 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 505 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 505 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 505 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 		 505 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4741  lysyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 		 325 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  34.19 
 
 		 510 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  33.55 
 
 		 502 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0344  lysyl-tRNA synthetase  35.44 
 
 		 325 aa  179  5.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000187091 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0685  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  35.95 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.572683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  33.55 
 
 		 502 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4614  lysyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 		 325 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.594866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4762  lysyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 		 325 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.827317 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4622  lysyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 		 325 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4705  lysyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 		 325 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1498  tRNA synthetase class II (D K and N)  35.39 
 
 		 340 aa  179  7e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.205908  normal  0.591538 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1642  lysyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 		 498 aa  179  8e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.573049  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0538  lysyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 		 498 aa  179  8e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000249001  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1370  lysyl-tRNA synthetase  33.64 
 
 		 578 aa  177  1e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.394303 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 		 505 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 		 505 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2997  lysyl-tRNA synthetase  34.18 
 
 		 502 aa  178  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 		 505 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 		 505 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 		 505 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1242  lysyl-tRNA synthetase  33.65 
 
 		 502 aa  177  2e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2848  lysyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 		 501 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  33.44 
 
 		 489 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0649  lysyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 		 505 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  32.27 
 
 		 523 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0924  lysyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 		 505 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3851  lysyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 		 505 aa  177  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0982146 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0883  lysyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 		 505 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3757  lysyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 		 325 aa  176  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2625  lysyl-tRNA synthetase-related protein  37.22 
 
 		 356 aa  176  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  32.6 
 
 		 511 aa  176  4e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  34.18 
 
 		 505 aa  176  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0442  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  34.91 
 
 		 327 aa  176  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  32.15 
 
 		 509 aa  176  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  31.95 
 
 		 494 aa  176  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0578  lysyl-tRNA synthetase  33.65 
 
 		 498 aa  175  7e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.873191  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0503  lysyl-tRNA synthetase  33.44 
 
 		 504 aa  175  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  32.91 
 
 		 494 aa  175  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  33.65 
 
 		 509 aa  175  8e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2793  tRNA synthetase class II (D K and N)  36.76 
 
 		 351 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0477928  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 		 503 aa  175  9e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1233  tRNA synthetase class II (D K and N)  37.22 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.685644  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  32.72 
 
 		 532 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00737  tRNA synthetases class II (D, K and N) subfamily  35.81 
 
 		 320 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.885463  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05510  lysyl-tRNA synthetase  32.59 
 
 		 563 aa  174  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  31.79 
 
 		 501 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>