More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2148 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2148  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  100 
 
 		 307 aa  629  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000938384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1839  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  65.8 
 
 		 307 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000593972  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1753  lysyl-tRNA synthetase-related protein  66.45 
 
 		 307 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2162  tRNA synthetase class II (D K and N)  63.16 
 
 		 305 aa  395  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2054  tRNA synthetase class II (D K and N)  63.49 
 
 		 302 aa  394  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2490  hypothetical protein  57.65 
 
 		 304 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3164  tRNA synthetase class II (D K and N)  54.24 
 
 		 301 aa  329  3e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0465087  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1914  tRNA synthetase class II (D K and N)  53.24 
 
 		 302 aa  318  7e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000371414  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1764  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  54.7 
 
 		 301 aa  318  9e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.076019  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0076  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  49.01 
 
 		 308 aa  282  4.0000000000000003e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211286 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0787  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  44.67 
 
 		 309 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0869  lysyl-tRNA synthetase-related protein  43.1 
 
 		 309 aa  252  5.000000000000001e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.584702  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_772  lysyl-tRNA synthetase, truncated  43.81 
 
 		 309 aa  248  6e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3867  tRNA synthetase class II (D K and N)  42.45 
 
 		 339 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3783  tRNA synthetase class II (D K and N)  42.22 
 
 		 339 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3726  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  42.09 
 
 		 340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2375  lysine--tRNA ligase  41.8 
 
 		 329 aa  222  8e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3854  tRNA synthetase class II (D K and N)  37.93 
 
 		 390 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.64996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2793  tRNA synthetase class II (D K and N)  38.6 
 
 		 351 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0477928  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1498  tRNA synthetase class II (D K and N)  40.78 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.205908  normal  0.591538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4013  putative lysyl-tRNA synthetase (lysine--tRNA ligase)  38.15 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2403  lysine--tRNA ligase  39.14 
 
 		 380 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.550576 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2505  lysine--tRNA ligase  39.82 
 
 		 351 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.418111  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1078  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  39.35 
 
 		 358 aa  208  7e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1642  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  39.02 
 
 		 347 aa  208  9e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.576369  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3798  Lysine--tRNA ligase  38.84 
 
 		 353 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00227981  normal  0.497071 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0046  hypothetical protein  35.67 
 
 		 343 aa  208  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2016  lysyl-tRNA synthetase homolog GenX  35.67 
 
 		 321 aa  208  1e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6025  lysyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 		 357 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.858577  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4127  Lysine--tRNA ligase  38.23 
 
 		 353 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.271818 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0762  lysine--tRNA ligase  38.37 
 
 		 349 aa  206  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756358  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0478  putative lysyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 345 aa  205  7e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181681  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2130  lysine--tRNA ligase  39.76 
 
 		 375 aa  205  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4763  hypothetical protein  38.79 
 
 		 325 aa  205  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0442  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  38.61 
 
 		 327 aa  203  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00737  tRNA synthetases class II (D, K and N) subfamily  40.06 
 
 		 320 aa  202  4e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.885463  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3004  tRNA synthetase class II (D K and N)  39.58 
 
 		 352 aa  202  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0405088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3229  tRNA synthetase class II (D K and N)  39.58 
 
 		 352 aa  202  7e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.504113 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0472  lysyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 325 aa  202  7e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3757  lysyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 325 aa  202  8e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4614  lysyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.594866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4762  lysyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.827317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2955  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  38.3 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3193  tRNA synthetase class II (D K and N)  39.27 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4705  lysyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4622  lysyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2997  lysyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 502 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3935  lysyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 		 325 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4741  lysyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2301  lysine--tRNA ligase  37.08 
 
 		 345 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275563  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3277  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  37.46 
 
 		 326 aa  198  7.999999999999999e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.680936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0383  lysyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 		 325 aa  198  9e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0344  lysyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 		 325 aa  198  9e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000187091 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03677  lysyl-tRNA synthetase  36.12 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0547578  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1885  tRNA synthetase class II (D K and N)  39.88 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.70209  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2045  tRNA synthetase class II (D K and N)  40 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2808  lysine--tRNA ligase  37.05 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0454  Lysine--tRNA ligase  38.18 
 
 		 351 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.444787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2739  lysine--tRNA ligase  35.95 
 
 		 351 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.525407 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 		 494 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  35.11 
 
 		 497 aa  195  7e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3477  lysine--tRNA ligase  39.14 
 
 		 350 aa  195  8.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0893  lysyl-tRNA synthetase, class-2  36.99 
 
 		 501 aa  194  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3855  lysyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00133285 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39390  lysyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 500 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1233  tRNA synthetase class II (D K and N)  40.66 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.685644  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1276  lysyl-tRNA synthetase  35.8 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 501 aa  194  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1654  lysine--tRNA ligase  38.48 
 
 		 348 aa  193  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.693299 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4226  lysyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 		 500 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.366371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1496  lysyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 		 500 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  0.804947 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2530  lysine--tRNA ligase  38.41 
 
 		 363 aa  192  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.83  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2126  lysine--tRNA ligase  39.35 
 
 		 316 aa  192  5e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.840396  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1101  lysyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 		 500 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04027  lysyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 325 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3835  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  37.93 
 
 		 325 aa  192  7e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4687  lysyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 325 aa  192  7e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.981409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4714  lysyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 325 aa  192  7e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.791182  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4626  lysyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 325 aa  192  7e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0839984 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4399  lysyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 325 aa  192  7e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5673  lysyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 325 aa  192  7e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.17046 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03989  hypothetical protein  37.93 
 
 		 325 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4121  lysyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 		 500 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 		 491 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3224  lysine--tRNA ligase  38.07 
 
 		 361 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.428603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1054  lysyl-tRNA synthetase  35.11 
 
 		 514 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 511 aa  189  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1741  hypothetical protein  34.91 
 
 		 496 aa  189  5e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1501  lysyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 		 500 aa  188  8e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1311  lysyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 		 500 aa  188  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484413 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0420  lysyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 325 aa  188  8e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643447 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2530  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  38.46 
 
 		 324 aa  188  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115251  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1409  lysyl-tRNA synthetase  33.95 
 
 		 514 aa  188  8e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1741  hypothetical protein  34.91 
 
 		 496 aa  188  9e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1132  lysyl-tRNA synthetase  34.28 
 
 		 500 aa  188  9e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2625  lysyl-tRNA synthetase-related protein  37.07 
 
 		 356 aa  187  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  35.22 
 
 		 491 aa  188  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002238  lysyl-tRNA synthetase  35 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3370  lysyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 505 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0726  lysyl-tRNA synthetase  34.59 
 
 		 504 aa  187  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000447446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>