More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0869 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0869  lysyl-tRNA synthetase-related protein  100 
 
 		 309 aa  640    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.584702  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0787  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  81.23 
 
 		 309 aa  545  1e-154  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_772  lysyl-tRNA synthetase, truncated  79.94 
 
 		 309 aa  529  1e-149  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1839  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  45.97 
 
 		 307 aa  267  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000593972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0076  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  44.84 
 
 		 308 aa  261  6.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211286 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2162  tRNA synthetase class II (D K and N)  45.33 
 
 		 305 aa  259  6e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2490  hypothetical protein  44.48 
 
 		 304 aa  257  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2054  tRNA synthetase class II (D K and N)  44.82 
 
 		 302 aa  256  4e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2148  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  43.1 
 
 		 307 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000938384  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1753  lysyl-tRNA synthetase-related protein  44.82 
 
 		 307 aa  248  7e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1764  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  44.22 
 
 		 301 aa  240  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.076019  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1914  tRNA synthetase class II (D K and N)  42.81 
 
 		 302 aa  236  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000371414  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3164  tRNA synthetase class II (D K and N)  40.34 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0465087  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3854  tRNA synthetase class II (D K and N)  37.93 
 
 		 390 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.64996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2781  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  37.65 
 
 		 322 aa  198  7.999999999999999e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3277  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  36.45 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.680936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 489 aa  194  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 		 494 aa  193  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 		 499 aa  192  9e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 		 499 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  34.08 
 
 		 499 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  35 
 
 		 497 aa  189  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2625  lysyl-tRNA synthetase-related protein  38.68 
 
 		 356 aa  188  8e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 		 497 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  34.67 
 
 		 501 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  34.67 
 
 		 501 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 		 491 aa  186  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 		 510 aa  185  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1741  hypothetical protein  35.46 
 
 		 496 aa  185  9e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4170  tRNA synthetase class II (D K and N)  37.5 
 
 		 416 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.90101 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0503  lysyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 		 504 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1008  lysyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 		 496 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2354  lysyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 		 496 aa  183  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0808673  decreased coverage  0.00196891 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1741  hypothetical protein  35.46 
 
 		 496 aa  183  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 		 499 aa  183  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3867  tRNA synthetase class II (D K and N)  35.83 
 
 		 339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 		 631 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3783  tRNA synthetase class II (D K and N)  35.83 
 
 		 339 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  32.8 
 
 		 499 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  33.54 
 
 		 532 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2375  lysine--tRNA ligase  35.44 
 
 		 329 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  33.64 
 
 		 494 aa  182  6e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 		 489 aa  182  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1477  lysyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 		 502 aa  182  6e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0701287  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 		 502 aa  182  6e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  32.8 
 
 		 499 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  32.8 
 
 		 499 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  32.8 
 
 		 499 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  32.8 
 
 		 499 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  32.8 
 
 		 499 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 		 489 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  32.8 
 
 		 499 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  32.8 
 
 		 499 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0159  lysyl-tRNA synthetase  35.44 
 
 		 502 aa  181  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0225  lysyl-tRNA synthetase  33.64 
 
 		 503 aa  181  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  32.8 
 
 		 499 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4741  lysyl-tRNA synthetase  35.06 
 
 		 325 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 		 511 aa  181  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1456  lysyl-tRNA synthetase  33.65 
 
 		 510 aa  181  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.370095  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1054  lysyl-tRNA synthetase  32.2 
 
 		 514 aa  181  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  33.65 
 
 		 583 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3757  lysyl-tRNA synthetase  34.45 
 
 		 325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4762  lysyl-tRNA synthetase  34.76 
 
 		 325 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.827317 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4705  lysyl-tRNA synthetase  34.76 
 
 		 325 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4622  lysyl-tRNA synthetase  34.76 
 
 		 325 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1409  lysyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 		 514 aa  179  4e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4614  lysyl-tRNA synthetase  34.76 
 
 		 325 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.594866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 		 503 aa  179  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05510  lysyl-tRNA synthetase  32.5 
 
 		 563 aa  179  4.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  34.57 
 
 		 504 aa  179  4.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 		 501 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2045  tRNA synthetase class II (D K and N)  35.05 
 
 		 316 aa  178  8e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  32.82 
 
 		 508 aa  178  9e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0420  lysyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643447 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0078  lysyl-tRNA synthetase  31.46 
 
 		 489 aa  177  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518607  normal  0.367083 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2275  lysyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 		 507 aa  178  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 		 509 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3726  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  35.19 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1349  lysyl-tRNA synthetase  32.3 
 
 		 503 aa  178  1e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000670094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 		 502 aa  177  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0578  lysyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 		 498 aa  177  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.873191  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1370  lysyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 		 578 aa  177  2e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.394303 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0649  lysyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 		 505 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0893  lysyl-tRNA synthetase, class-2  34.08 
 
 		 501 aa  177  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 		 502 aa  177  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  34.82 
 
 		 503 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3935  lysyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  32.82 
 
 		 502 aa  177  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  32.7 
 
 		 501 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 		 562 aa  177  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  32.69 
 
 		 509 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 		 505 aa  176  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0301  lysyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 496 aa  177  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1034  lysyl-tRNA synthetase  31.35 
 
 		 496 aa  177  3e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 		 505 aa  176  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 		 505 aa  176  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 		 505 aa  177  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  34.17 
 
 		 505 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  31.15 
 
 		 489 aa  176  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3742  lysyl-tRNA synthetase  33.54 
 
 		 496 aa  177  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>