More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3867 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3867  tRNA synthetase class II (D K and N)  100 
 
 		 339 aa  665    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3783  tRNA synthetase class II (D K and N)  97.93 
 
 		 339 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3726  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  94.15 
 
 		 340 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3854  tRNA synthetase class II (D K and N)  77.81 
 
 		 390 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.64996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2375  lysine--tRNA ligase  53.42 
 
 		 329 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1078  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  46.3 
 
 		 358 aa  247  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2148  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  42.55 
 
 		 307 aa  247  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000938384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1839  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  43.64 
 
 		 307 aa  245  6e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000593972  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1753  lysyl-tRNA synthetase-related protein  46.2 
 
 		 307 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2955  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  47.72 
 
 		 351 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3193  tRNA synthetase class II (D K and N)  47.46 
 
 		 352 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6025  lysyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 357 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.858577  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3004  tRNA synthetase class II (D K and N)  47.02 
 
 		 352 aa  238  9e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0405088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1498  tRNA synthetase class II (D K and N)  47.81 
 
 		 340 aa  237  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.205908  normal  0.591538 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3229  tRNA synthetase class II (D K and N)  47.01 
 
 		 352 aa  235  7e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.504113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2739  lysine--tRNA ligase  46.55 
 
 		 351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.525407 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2505  lysine--tRNA ligase  46.99 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.418111  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2490  hypothetical protein  42.55 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3224  lysine--tRNA ligase  44.81 
 
 		 361 aa  233  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.428603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0454  Lysine--tRNA ligase  45.35 
 
 		 351 aa  233  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.444787 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2162  tRNA synthetase class II (D K and N)  41.34 
 
 		 305 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2054  tRNA synthetase class II (D K and N)  41.03 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1654  lysine--tRNA ligase  44.54 
 
 		 348 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.693299 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1642  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  44.51 
 
 		 347 aa  229  4e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.576369  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3798  Lysine--tRNA ligase  43.81 
 
 		 353 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00227981  normal  0.497071 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2530  lysine--tRNA ligase  47.46 
 
 		 363 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.83  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2808  lysine--tRNA ligase  43.37 
 
 		 350 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2793  tRNA synthetase class II (D K and N)  46.36 
 
 		 351 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0477928  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4127  Lysine--tRNA ligase  43.73 
 
 		 353 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.271818 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0378  lysine--tRNA ligase  46.11 
 
 		 350 aa  227  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.682721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4013  putative lysyl-tRNA synthetase (lysine--tRNA ligase)  45.59 
 
 		 351 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0478  putative lysyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 345 aa  225  7e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181681  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2130  lysine--tRNA ligase  45.67 
 
 		 375 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2403  lysine--tRNA ligase  44.67 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.550576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0762  lysine--tRNA ligase  44.05 
 
 		 349 aa  219  6e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756358  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2301  lysine--tRNA ligase  43.98 
 
 		 345 aa  219  7e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275563  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1885  tRNA synthetase class II (D K and N)  45.51 
 
 		 350 aa  216  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.70209  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4705  lysyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4614  lysyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.594866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4741  lysyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4762  lysyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.827317 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00737  tRNA synthetases class II (D, K and N) subfamily  41.54 
 
 		 320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.885463  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4622  lysyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1276  lysyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 		 323 aa  212  7.999999999999999e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03677  lysyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0547578  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2625  lysyl-tRNA synthetase-related protein  40.48 
 
 		 356 aa  211  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2045  tRNA synthetase class II (D K and N)  39.57 
 
 		 316 aa  210  3e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0344  lysyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 		 325 aa  208  9e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000187091 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3477  lysine--tRNA ligase  44.25 
 
 		 350 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04027  lysyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3835  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  38.27 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4687  lysyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.981409  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4626  lysyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0839984 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  35.44 
 
 		 497 aa  207  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03989  hypothetical protein  38.27 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4399  lysyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5673  lysyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.17046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0420  lysyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643447 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4714  lysyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.791182  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 503 aa  206  4e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2126  lysine--tRNA ligase  39.26 
 
 		 316 aa  206  4e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.840396  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3855  lysyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 325 aa  206  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00133285 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0076  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  41.69 
 
 		 308 aa  206  6e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211286 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0046  hypothetical protein  35.06 
 
 		 343 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2016  lysyl-tRNA synthetase homolog GenX  35.06 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0442  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  37.23 
 
 		 327 aa  203  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4170  tRNA synthetase class II (D K and N)  46.58 
 
 		 416 aa  202  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.90101 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0472  lysyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 		 325 aa  202  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0383  lysyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3164  tRNA synthetase class II (D K and N)  39.08 
 
 		 301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0465087  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3935  lysyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 499 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3665  lysyl-tRNA synthetase  36.92 
 
 		 325 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3757  lysyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 325 aa  194  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0503  lysyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 		 504 aa  194  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0712  lysyl-tRNA synthetase  36.92 
 
 		 325 aa  195  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.292044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3812  lysyl-tRNA synthetase  36.92 
 
 		 325 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 		 631 aa  193  3e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3277  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  35.71 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.680936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2229  lysyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 		 349 aa  193  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.188508  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2781  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  40.48 
 
 		 322 aa  194  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1914  tRNA synthetase class II (D K and N)  38.53 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000371414  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002238  lysyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1233  tRNA synthetase class II (D K and N)  40.37 
 
 		 299 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.685644  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 489 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0600  lysyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 508 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.834751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 		 491 aa  192  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4763  hypothetical protein  34.13 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 		 508 aa  191  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2848  lysyl-tRNA synthetase  36.12 
 
 		 501 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 		 495 aa  189  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0787  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  35.42 
 
 		 309 aa  189  5e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0288  lysyl-tRNA synthetase  37.54 
 
 		 514 aa  189  7e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 489 aa  189  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2581  Lysine--tRNA ligase  40.66 
 
 		 318 aa  189  8e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 		 508 aa  189  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2155  lysyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 		 508 aa  189  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351617  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1117  lysyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 		 520 aa  188  9e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.462738  normal  0.0378562 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1070  lysyl-tRNA synthetase  35.91 
 
 		 516 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2496  lysyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 		 505 aa  188  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>