More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1498 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1498  tRNA synthetase class II (D K and N)  100 
 
 		 340 aa  669    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.205908  normal  0.591538 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2375  lysine--tRNA ligase  61.45 
 
 		 329 aa  381  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2793  tRNA synthetase class II (D K and N)  48.12 
 
 		 351 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0477928  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3004  tRNA synthetase class II (D K and N)  48.4 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0405088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2301  lysine--tRNA ligase  46.49 
 
 		 345 aa  256  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275563  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3229  tRNA synthetase class II (D K and N)  48.1 
 
 		 352 aa  256  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.504113 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0762  lysine--tRNA ligase  46.65 
 
 		 349 aa  253  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756358  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2403  lysine--tRNA ligase  47.28 
 
 		 380 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.550576 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3193  tRNA synthetase class II (D K and N)  46.18 
 
 		 352 aa  250  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6025  lysyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 357 aa  249  6e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.858577  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2739  lysine--tRNA ligase  47.42 
 
 		 351 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.525407 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1654  lysine--tRNA ligase  46.94 
 
 		 348 aa  247  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.693299 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0478  putative lysyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 		 345 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181681  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1078  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  46.52 
 
 		 358 aa  246  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3783  tRNA synthetase class II (D K and N)  47.81 
 
 		 339 aa  245  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3867  tRNA synthetase class II (D K and N)  47.81 
 
 		 339 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2130  lysine--tRNA ligase  46.61 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1642  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  44.51 
 
 		 347 aa  243  3e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.576369  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2808  lysine--tRNA ligase  42.98 
 
 		 350 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3798  Lysine--tRNA ligase  44.19 
 
 		 353 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00227981  normal  0.497071 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0378  lysine--tRNA ligase  46.13 
 
 		 350 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.682721 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4127  Lysine--tRNA ligase  43.6 
 
 		 353 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.271818 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4013  putative lysyl-tRNA synthetase (lysine--tRNA ligase)  45.35 
 
 		 351 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3726  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  48.12 
 
 		 340 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3477  lysine--tRNA ligase  45.66 
 
 		 350 aa  235  9e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2505  lysine--tRNA ligase  45.22 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.418111  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2530  lysine--tRNA ligase  47.18 
 
 		 363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.83  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0454  Lysine--tRNA ligase  42.25 
 
 		 351 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.444787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1885  tRNA synthetase class II (D K and N)  44.02 
 
 		 350 aa  229  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.70209  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3854  tRNA synthetase class II (D K and N)  45.37 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.64996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2955  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  43.99 
 
 		 351 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2054  tRNA synthetase class II (D K and N)  43.83 
 
 		 302 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2162  tRNA synthetase class II (D K and N)  43.79 
 
 		 305 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0383  lysyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 325 aa  225  7e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4741  lysyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 325 aa  225  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4705  lysyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4622  lysyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4762  lysyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.827317 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4614  lysyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.594866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0472  lysyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 325 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3224  lysine--tRNA ligase  42.21 
 
 		 361 aa  222  6e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.428603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0344  lysyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000187091 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2016  lysyl-tRNA synthetase homolog GenX  39.32 
 
 		 321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0046  hypothetical protein  39.32 
 
 		 343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3757  lysyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2148  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  40.68 
 
 		 307 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000938384  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3935  lysyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2490  hypothetical protein  43.25 
 
 		 304 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1839  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  42.17 
 
 		 307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000593972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0442  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  41.52 
 
 		 327 aa  215  8e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04027  lysyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3835  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  42.99 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03989  hypothetical protein  42.99 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4687  lysyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.981409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4714  lysyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.791182  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5673  lysyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.17046 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3855  lysyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00133285 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4626  lysyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0839984 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4399  lysyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2229  lysyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 349 aa  213  4.9999999999999996e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.188508  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3665  lysyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 325 aa  212  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0712  lysyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 325 aa  212  7.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.292044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3812  lysyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 325 aa  212  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0420  lysyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643447 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1753  lysyl-tRNA synthetase-related protein  42.54 
 
 		 307 aa  209  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002238  lysyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3277  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  39.82 
 
 		 326 aa  205  7e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.680936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00130  lysyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 323 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0913  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  40.67 
 
 		 320 aa  199  7e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2625  lysyl-tRNA synthetase-related protein  41.39 
 
 		 356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03677  lysyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0547578  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2787  lysyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.638173  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0076  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  42.86 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211286 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0685  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  44.13 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.572683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 		 503 aa  189  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1276  lysyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 		 323 aa  189  5e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4763  hypothetical protein  37.92 
 
 		 325 aa  189  9e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00737  tRNA synthetases class II (D, K and N) subfamily  40.62 
 
 		 320 aa  188  9e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.885463  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1319  hypothetical protein  42.24 
 
 		 329 aa  187  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1233  tRNA synthetase class II (D K and N)  44.27 
 
 		 299 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.685644  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 		 510 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0642  hypothetical protein  39.1 
 
 		 317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0765  lysyl-tRNA synthetase  32.47 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000080763  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3164  tRNA synthetase class II (D K and N)  38.56 
 
 		 301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0465087  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4170  tRNA synthetase class II (D K and N)  44.66 
 
 		 416 aa  182  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.90101 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2045  tRNA synthetase class II (D K and N)  40.68 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0588  lysyl-tRNA synthetase-like GenX  37.1 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  decreased coverage  0.00871089  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0787  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  34.64 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 497 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0658  hypothetical protein  38.51 
 
 		 317 aa  179  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2126  lysine--tRNA ligase  39.75 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.840396  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1764  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  38.41 
 
 		 301 aa  176  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.076019  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 		 489 aa  176  7e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0869  lysyl-tRNA synthetase-related protein  34.59 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.584702  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 		 494 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2781  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  40.64 
 
 		 322 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1137  lysyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 513 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 		 492 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2207  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  37.31 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1206  lysyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 513 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>