More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3782 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3782  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 798 aa  1556    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117418  normal  0.256533 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.34 
 
 		 1069 aa  257  5e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  52.23 
 
 		 852 aa  253  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.36 
 
 		 1369 aa  250  8e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  52.87 
 
 		 1135 aa  248  4.9999999999999997e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.04 
 
 		 1310 aa  247  6e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  51.84 
 
 		 929 aa  246  9e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.82 
 
 		 916 aa  243  7.999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0082  Hpt sensor hybrid histidine kinase  51.23 
 
 		 866 aa  243  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0375698  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.9 
 
 		 1363 aa  240  9e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.86 
 
 		 1398 aa  238  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  51.63 
 
 		 982 aa  238  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.07 
 
 		 816 aa  237  5.0000000000000005e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.7 
 
 		 1313 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.78 
 
 		 765 aa  236  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  54.81 
 
 		 636 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.04 
 
 		 1768 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  44.93 
 
 		 1407 aa  235  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.33 
 
 		 1784 aa  235  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.08 
 
 		 1303 aa  234  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.45 
 
 		 946 aa  235  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.33 
 
 		 1792 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.33 
 
 		 1786 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.78 
 
 		 1271 aa  234  5e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.33 
 
 		 1782 aa  234  5e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.88 
 
 		 874 aa  233  7.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  48.8 
 
 		 661 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.62 
 
 		 918 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.62 
 
 		 918 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.62 
 
 		 918 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.62 
 
 		 918 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.62 
 
 		 918 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.42 
 
 		 1765 aa  233  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  43.26 
 
 		 918 aa  231  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.26 
 
 		 918 aa  231  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.26 
 
 		 918 aa  231  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.26 
 
 		 918 aa  231  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  46.3 
 
 		 620 aa  231  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.26 
 
 		 918 aa  231  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.26 
 
 		 918 aa  231  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.26 
 
 		 918 aa  231  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.26 
 
 		 918 aa  231  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  43.26 
 
 		 918 aa  231  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.33 
 
 		 1767 aa  231  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.33 
 
 		 1767 aa  231  4e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.55 
 
 		 918 aa  231  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.27 
 
 		 1127 aa  231  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.74 
 
 		 2213 aa  230  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00069  two component sensor-regulator hybrid protein RpfC  51.64 
 
 		 718 aa  230  6e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.397596  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.33 
 
 		 1767 aa  230  9e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  42.61 
 
 		 544 aa  229  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  45.17 
 
 		 853 aa  229  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  48.22 
 
 		 882 aa  229  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  47.64 
 
 		 1763 aa  228  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.86 
 
 		 929 aa  228  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.92 
 
 		 1433 aa  228  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04479  Histidine kinase J7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ24]  48.79 
 
 		 1297 aa  228  5.0000000000000005e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930158  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.88 
 
 		 1548 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.4 
 
 		 932 aa  227  6e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.28 
 
 		 764 aa  227  6e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03340  protein-histidine kinase, putative  44.88 
 
 		 1390 aa  227  7e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.205996  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  43.4 
 
 		 932 aa  227  7e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  45.8 
 
 		 1014 aa  227  8e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.94 
 
 		 902 aa  226  9e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  45.87 
 
 		 1765 aa  226  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.24 
 
 		 833 aa  226  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.68 
 
 		 1771 aa  226  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.83 
 
 		 791 aa  226  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0559  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.86 
 
 		 704 aa  225  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  46.36 
 
 		 914 aa  226  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  44.68 
 
 		 793 aa  225  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  46.4 
 
 		 758 aa  225  3e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1360  GAF sensor hybrid histidine kinase  47.98 
 
 		 974 aa  224  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  49.2 
 
 		 606 aa  224  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.9 
 
 		 1397 aa  224  4e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.28 
 
 		 977 aa  224  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.54 
 
 		 785 aa  224  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.16 
 
 		 818 aa  224  4.9999999999999996e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.94 
 
 		 1245 aa  224  6e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.69 
 
 		 738 aa  224  6e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2940  PAS  48.22 
 
 		 1353 aa  224  7e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1760  histidine kinase  44.1 
 
 		 671 aa  224  7e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.36 
 
 		 927 aa  223  8e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  48.73 
 
 		 777 aa  223  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  51.08 
 
 		 559 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.12 
 
 		 1260 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2282  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.48 
 
 		 685 aa  223  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1879  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.33 
 
 		 604 aa  223  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.65 
 
 		 1284 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  44.79 
 
 		 1287 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.46 
 
 		 1350 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.67 
 
 		 752 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.31 
 
 		 969 aa  222  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.35 
 
 		 920 aa  222  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.54 
 
 		 1820 aa  221  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2769  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.01 
 
 		 773 aa  221  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1277  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.8 
 
 		 969 aa  222  3e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.1 
 
 		 995 aa  222  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.75 
 
 		 1128 aa  221  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.56 
 
 		 927 aa  221  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>