More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3732 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3732  elongation factor Ts  100 
 
 		 216 aa  437  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000229011  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2755  elongation factor Ts  86.98 
 
 		 216 aa  388  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0741161  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1486  elongation factor Ts  86.98 
 
 		 216 aa  388  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00196181 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1251  elongation factor Ts  87.5 
 
 		 216 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345397  hitchhiker  0.0000644664 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1920  elongation factor Ts  84.72 
 
 		 216 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1420  translation elongation factor Ts  66.67 
 
 		 218 aa  299  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0106114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3212  translation elongation factor Ts  64.45 
 
 		 216 aa  289  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000140585  hitchhiker  0.0000000047581 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0283  elongation factor Ts  63.55 
 
 		 219 aa  279  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.975706  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0272  elongation factor Ts  63.55 
 
 		 219 aa  278  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0294  elongation factor Ts  63.08 
 
 		 219 aa  278  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1977  elongation factor Ts  64.93 
 
 		 217 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032588  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0579  translation elongation factor Ts  61.42 
 
 		 202 aa  263  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0607  translation elongation factor Ts  61.62 
 
 		 201 aa  263  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928696  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3708  elongation factor Ts  57.89 
 
 		 217 aa  262  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0003434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0443  elongation factor Ts  60.1 
 
 		 215 aa  261  4.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000208997  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5314  translation elongation factor Ts  56.28 
 
 		 218 aa  261  6.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1428  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  56.67 
 
 		 216 aa  261  8e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000020519  normal  0.0754659 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1815  elongation factor Ts  59.9 
 
 		 204 aa  260  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299653  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2923  translation elongation factor Ts  59.18 
 
 		 200 aa  260  1e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.464491 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1779  translation elongation factor Ts  61.22 
 
 		 210 aa  258  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1033  elongation factor Ts  59.7 
 
 		 203 aa  258  5.0000000000000005e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000048083  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1005  elongation factor Ts  63.46 
 
 		 215 aa  256  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000692768  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0883  elongation factor Ts  60.95 
 
 		 214 aa  254  6e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0565  elongation factor Ts  58.38 
 
 		 219 aa  251  6e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4235  elongation factor Ts  55.45 
 
 		 263 aa  250  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023006 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1660  elongation factor Ts  61.42 
 
 		 204 aa  248  5e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000188674  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0475  translation elongation factor Ts  57.65 
 
 		 198 aa  247  9e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000567359  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1132  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  56.92 
 
 		 198 aa  247  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0743  translation elongation factor Ts  59.39 
 
 		 197 aa  244  6e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000548814  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2579  elongation factor Ts  52.8 
 
 		 249 aa  241  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1152  translation elongation factor Ts  53.74 
 
 		 286 aa  241  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3527  elongation factor Ts  52.8 
 
 		 250 aa  241  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.84693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0294  elongation factor Ts  60.75 
 
 		 219 aa  241  6e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0828484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1160  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  52.8 
 
 		 219 aa  239  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000237926 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08301  elongation factor Ts  53.77 
 
 		 218 aa  238  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1202  elongation factor Ts  53.81 
 
 		 198 aa  237  9e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000235333  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08151  elongation factor Ts  52.83 
 
 		 218 aa  235  4e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0762  elongation factor Ts  52.36 
 
 		 218 aa  235  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.670282  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1246  elongation factor Ts  50.94 
 
 		 219 aa  234  6e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.794499  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1223  elongation factor Ts  51.89 
 
 		 220 aa  234  6e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0786  elongation factor Ts  55.9 
 
 		 196 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08141  elongation factor Ts  52.36 
 
 		 218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.119849  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2531  elongation factor Ts  53.17 
 
 		 221 aa  232  3e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.339571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10091  elongation factor Ts  51.66 
 
 		 218 aa  231  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.136802 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16651  elongation factor Ts  49.76 
 
 		 218 aa  226  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.521218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4960  translation elongation factor Ts  54.59 
 
 		 198 aa  225  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1187  elongation factor Ts  51.52 
 
 		 199 aa  221  7e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000118419  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0956  translation elongation factor Ts  50.68 
 
 		 221 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0158  elongation factor Ts  49.29 
 
 		 218 aa  219  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.496244  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07901  elongation factor Ts  49.29 
 
 		 218 aa  219  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.987366 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1268  elongation factor Ts  51.52 
 
 		 199 aa  218  5e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.890354  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0199  elongation factor Ts  56.35 
 
 		 197 aa  216  2e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000300429  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  68.35 
 
 		 311 aa  210  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1781  translation elongation factor Ts  54.21 
 
 		 196 aa  210  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000010649  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1965  translation elongation factor Ts  53.16 
 
 		 196 aa  209  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4502  translation elongation factor Ts  55.03 
 
 		 189 aa  206  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.231763  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0576  elongation factor Ts  54.31 
 
 		 197 aa  206  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000429292  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49408  predicted protein  46.76 
 
 		 440 aa  205  3e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1162  translation elongation factor Ts  47.47 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  64.2 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3580  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  46.46 
 
 		 204 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1399  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  47.09 
 
 		 207 aa  188  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253635  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1720  translation elongation factor Ts  45.69 
 
 		 197 aa  181  6e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3516  translation elongation factor Ts  48.5 
 
 		 200 aa  180  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  44.56 
 
 		 313 aa  161  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  49.03 
 
 		 303 aa  157  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_320  translation elongation factor Ts  41.33 
 
 		 167 aa  156  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00206685  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0376  elongation factor Ts  40.82 
 
 		 167 aa  156  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0834304  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0358  elongation factor Ts  40.82 
 
 		 167 aa  156  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000023974  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2018  translation elongation factor Ts  41.75 
 
 		 176 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.666479  hitchhiker  0.00383006 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  49.68 
 
 		 303 aa  153  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3926  translation elongation factor Ts  41.03 
 
 		 176 aa  151  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0719169 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  49.01 
 
 		 287 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  41.85 
 
 		 303 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  39.39 
 
 		 314 aa  149  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  41.85 
 
 		 303 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0526  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerisation  38.62 
 
 		 177 aa  148  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00005849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_7588  predicted protein  45.67 
 
 		 202 aa  142  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.673567  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  45.07 
 
 		 286 aa  142  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1519  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerization  39.09 
 
 		 152 aa  141  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  46.1 
 
 		 305 aa  139  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  46.1 
 
 		 305 aa  139  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  47.4 
 
 		 310 aa  138  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  45.06 
 
 		 308 aa  138  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  38.04 
 
 		 299 aa  135  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3195  translation elongation factor Ts  43.87 
 
 		 308 aa  134  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  40.2 
 
 		 310 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  40.24 
 
 		 300 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  43.48 
 
 		 308 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  41.56 
 
 		 307 aa  131  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  44.94 
 
 		 294 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  44.1 
 
 		 308 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  46.2 
 
 		 292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  42.95 
 
 		 294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  55.66 
 
 		 294 aa  128  6e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  43.75 
 
 		 309 aa  128  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  41.41 
 
 		 307 aa  128  6e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  67.01 
 
 		 296 aa  128  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  44.85 
 
 		 286 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  45.16 
 
 		 302 aa  128  8.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>