More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2679 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  100 
 
 		 310 aa  627  1e-178  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  55.37 
 
 		 303 aa  300  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  55.05 
 
 		 303 aa  299  4e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  50 
 
 		 311 aa  299  5e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  50.65 
 
 		 303 aa  296  4e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  47.3 
 
 		 313 aa  282  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  48.57 
 
 		 312 aa  278  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  45.08 
 
 		 314 aa  271  1e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  50 
 
 		 299 aa  271  1e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  48.69 
 
 		 303 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  48.21 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  47.88 
 
 		 294 aa  263  3e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  50.49 
 
 		 294 aa  263  4e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  51.3 
 
 		 293 aa  262  6e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  48.86 
 
 		 292 aa  259  3e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  48.87 
 
 		 294 aa  258  6e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  49.35 
 
 		 292 aa  256  2e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  49.19 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  49.51 
 
 		 295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  48.97 
 
 		 288 aa  253  2.0000000000000002e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  49.51 
 
 		 295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  49.19 
 
 		 295 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  49.19 
 
 		 295 aa  253  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  49.19 
 
 		 295 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  49.19 
 
 		 295 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  49.19 
 
 		 295 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  49.19 
 
 		 295 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  49.19 
 
 		 295 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  49.19 
 
 		 295 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  47.06 
 
 		 307 aa  252  6e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  48.21 
 
 		 293 aa  249  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  48.21 
 
 		 293 aa  249  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  49.19 
 
 		 295 aa  249  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  45.45 
 
 		 294 aa  249  3e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  47.27 
 
 		 309 aa  249  4e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  48 
 
 		 290 aa  249  5e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  47.91 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  46.77 
 
 		 292 aa  243  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  43.51 
 
 		 291 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  45.25 
 
 		 307 aa  242  6e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  43.37 
 
 		 292 aa  239  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  43.37 
 
 		 292 aa  239  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  46.33 
 
 		 301 aa  239  5e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  43.51 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  43.13 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  44.48 
 
 		 308 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  45.6 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  47.7 
 
 		 294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  44.48 
 
 		 308 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  43 
 
 		 291 aa  233  3e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446628  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  43.65 
 
 		 289 aa  233  5e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 288 aa  231  9e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  44.92 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  45.19 
 
 		 291 aa  231  1e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1093  elongation factor Ts  39.55 
 
 		 358 aa  230  2e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.569286  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  44.48 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  45.13 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1441  elongation factor Ts  41.29 
 
 		 354 aa  230  2e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  46.13 
 
 		 290 aa  230  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  47.1 
 
 		 292 aa  229  4e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  42.07 
 
 		 308 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  43.58 
 
 		 287 aa  229  6e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  41.85 
 
 		 308 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  46.18 
 
 		 296 aa  228  7e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl560  elongation factor Ts  42.58 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  43.46 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  43.46 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0839  elongation factor Ts  37.75 
 
 		 352 aa  227  2e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0656173  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  46.62 
 
 		 291 aa  227  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1196  elongation factor Ts  38.1 
 
 		 357 aa  227  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2065  elongation factor Ts  46.77 
 
 		 292 aa  227  2e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1261  elongation factor Ts  38.66 
 
 		 354 aa  226  3e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00427037  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1315  elongation factor Ts  38.1 
 
 		 357 aa  226  3e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  46.33 
 
 		 291 aa  226  3e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  43.93 
 
 		 305 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  43.93 
 
 		 305 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0548  elongation factor Ts  38.38 
 
 		 357 aa  225  8e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1695  elongation factor Ts  47.19 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  41.31 
 
 		 307 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  42.5 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0407  translation elongation factor Ts  39.83 
 
 		 355 aa  223  4e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  42.96 
 
 		 276 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  41.56 
 
 		 300 aa  220  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1959  elongation factor Ts  45.21 
 
 		 308 aa  220  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0550  elongation factor Ts  37.39 
 
 		 348 aa  219  3.9999999999999997e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00242368  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1265  elongation factor Ts  45.13 
 
 		 291 aa  219  6e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12260  translation elongation factor Ts  47.12 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000728312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  42.95 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  39.74 
 
 		 310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0976  elongation factor Ts  43 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120791  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  42.16 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  40.74 
 
 		 288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  41.83 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  40.34 
 
 		 288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  44.74 
 
 		 285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  42.57 
 
 		 285 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  43.67 
 
 		 290 aa  212  7e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1104  translation elongation factor Ts  45.05 
 
 		 286 aa  212  7.999999999999999e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000532403  unclonable  0.00000000000000104314 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  40.89 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  43.61 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>