More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1720 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1720  translation elongation factor Ts  100 
 
 
197 aa  396  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0786  elongation factor Ts  58.97 
 
 
196 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1202  elongation factor Ts  59.39 
 
 
198 aa  244  4.9999999999999997e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000235333  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1268  elongation factor Ts  58.38 
 
 
199 aa  239  1e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.890354  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1187  elongation factor Ts  57.87 
 
 
199 aa  237  9e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000118419  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0199  elongation factor Ts  59.9 
 
 
197 aa  235  3e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000300429  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1815  elongation factor Ts  55.38 
 
 
204 aa  224  6e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299653  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0743  translation elongation factor Ts  54.82 
 
 
197 aa  221  4e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000548814  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1660  elongation factor Ts  54.36 
 
 
204 aa  218  5e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000188674  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1033  elongation factor Ts  51.58 
 
 
203 aa  217  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000048083  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0283  elongation factor Ts  51.53 
 
 
219 aa  214  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.975706  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0294  elongation factor Ts  51.02 
 
 
219 aa  214  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0272  elongation factor Ts  51.53 
 
 
219 aa  214  9e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0579  translation elongation factor Ts  50 
 
 
202 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0475  translation elongation factor Ts  49.23 
 
 
198 aa  211  3.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000567359  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0565  elongation factor Ts  51.27 
 
 
219 aa  210  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0607  translation elongation factor Ts  47.21 
 
 
201 aa  208  4e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928696  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1420  translation elongation factor Ts  47.45 
 
 
218 aa  208  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0106114  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1965  translation elongation factor Ts  50.52 
 
 
196 aa  207  8e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1920  elongation factor Ts  46.7 
 
 
216 aa  206  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1251  elongation factor Ts  47.21 
 
 
216 aa  206  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345397  hitchhiker  0.0000644664 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1781  translation elongation factor Ts  52.58 
 
 
196 aa  205  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000010649  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2923  translation elongation factor Ts  48.98 
 
 
200 aa  203  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.464491 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5314  translation elongation factor Ts  47.18 
 
 
218 aa  200  9e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0443  elongation factor Ts  47.69 
 
 
215 aa  200  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000208997  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3212  translation elongation factor Ts  46.7 
 
 
216 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000140585  hitchhiker  0.0000000047581 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0576  elongation factor Ts  55.33 
 
 
197 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000429292  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2755  elongation factor Ts  46.19 
 
 
216 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0741161  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1132  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  50 
 
 
198 aa  198  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1779  translation elongation factor Ts  43.88 
 
 
210 aa  197  9e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1486  elongation factor Ts  46.19 
 
 
216 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00196181 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3732  elongation factor Ts  45.69 
 
 
216 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000229011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3708  elongation factor Ts  47.45 
 
 
217 aa  195  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0003434  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0883  elongation factor Ts  51.79 
 
 
214 aa  195  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1428  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  47.69 
 
 
216 aa  194  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000020519  normal  0.0754659 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2579  elongation factor Ts  47.21 
 
 
249 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3527  elongation factor Ts  47.21 
 
 
250 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.84693  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4960  translation elongation factor Ts  45.92 
 
 
198 aa  191  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1152  translation elongation factor Ts  46.7 
 
 
286 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0762  elongation factor Ts  45.69 
 
 
218 aa  184  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.670282  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08141  elongation factor Ts  46.19 
 
 
218 aa  184  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.119849  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0294  elongation factor Ts  49.49 
 
 
219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0828484  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08301  elongation factor Ts  46.19 
 
 
218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08151  elongation factor Ts  45.69 
 
 
218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1399  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  44.1 
 
 
207 aa  182  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253635  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1977  elongation factor Ts  49.49 
 
 
217 aa  181  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032588  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4235  elongation factor Ts  44.16 
 
 
263 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023006 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1160  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  44.67 
 
 
219 aa  180  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000237926 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2531  elongation factor Ts  46.19 
 
 
221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.339571  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16651  elongation factor Ts  44.16 
 
 
218 aa  177  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.521218 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1005  elongation factor Ts  48.72 
 
 
215 aa  176  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000692768  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3516  translation elongation factor Ts  46.46 
 
 
200 aa  175  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10091  elongation factor Ts  44.16 
 
 
218 aa  174  9e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.136802 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1223  elongation factor Ts  42.35 
 
 
220 aa  170  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4502  translation elongation factor Ts  49.21 
 
 
189 aa  170  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.231763  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07901  elongation factor Ts  43.65 
 
 
218 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.987366 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0158  elongation factor Ts  43.65 
 
 
218 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.496244  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1246  elongation factor Ts  41.84 
 
 
219 aa  168  4e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.794499  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0956  translation elongation factor Ts  42.16 
 
 
221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49408  predicted protein  40.84 
 
 
440 aa  160  8.000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0358  elongation factor Ts  42.86 
 
 
167 aa  154  9e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000023974  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_320  translation elongation factor Ts  42.35 
 
 
167 aa  153  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00206685  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0376  elongation factor Ts  42.35 
 
 
167 aa  152  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0834304  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3926  translation elongation factor Ts  39.49 
 
 
176 aa  150  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0719169 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3580  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  38.69 
 
 
204 aa  149  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2018  translation elongation factor Ts  40 
 
 
176 aa  149  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.666479  hitchhiker  0.00383006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1162  translation elongation factor Ts  38.19 
 
 
259 aa  145  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0526  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerisation  39.69 
 
 
177 aa  143  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00005849  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1519  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerization  38.58 
 
 
152 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  41.73 
 
 
286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  38.13 
 
 
311 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  37.76 
 
 
287 aa  111  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  33.16 
 
 
314 aa  109  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  32.47 
 
 
313 aa  108  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  36.5 
 
 
288 aa  107  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  41.73 
 
 
273 aa  107  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12260  translation elongation factor Ts  36.69 
 
 
288 aa  107  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000728312  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  32.62 
 
 
303 aa  105  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0049  translation elongation factor Ts  48.76 
 
 
277 aa  105  6e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  47.17 
 
 
276 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  37.79 
 
 
303 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  37.79 
 
 
303 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  53.12 
 
 
288 aa  103  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  52.58 
 
 
294 aa  102  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  36.88 
 
 
267 aa  102  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  39.57 
 
 
299 aa  102  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1441  elongation factor Ts  47.57 
 
 
354 aa  102  5e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  52.04 
 
 
310 aa  101  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  50 
 
 
286 aa  101  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  47 
 
 
292 aa  101  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  47 
 
 
292 aa  101  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0724  translation elongation factor Ts  46.23 
 
 
320 aa  100  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  32.87 
 
 
312 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1647  elongation factor Ts  34.03 
 
 
288 aa  99  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  32.99 
 
 
292 aa  99  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0649  translation elongation factor Ts  49.17 
 
 
278 aa  99  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.301511  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  52.08 
 
 
288 aa  99  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2009  elongation factor Ts  52.48 
 
 
288 aa  98.6  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf063  elongation factor Ts  50.49 
 
 
292 aa  98.2  6e-20  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  46.3 
 
 
293 aa  98.6  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>