More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0565 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0565  elongation factor Ts  100 
 
 
219 aa  442  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1920  elongation factor Ts  60.91 
 
 
216 aa  259  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3212  translation elongation factor Ts  59.9 
 
 
216 aa  257  8e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000140585  hitchhiker  0.0000000047581 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1251  elongation factor Ts  60.41 
 
 
216 aa  255  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345397  hitchhiker  0.0000644664 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1420  translation elongation factor Ts  60.51 
 
 
218 aa  254  8e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0106114  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1202  elongation factor Ts  60.91 
 
 
198 aa  251  7e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000235333  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3732  elongation factor Ts  58.38 
 
 
216 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000229011  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1033  elongation factor Ts  61.54 
 
 
203 aa  250  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000048083  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0579  translation elongation factor Ts  58.97 
 
 
202 aa  247  9e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0786  elongation factor Ts  60.51 
 
 
196 aa  241  6e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1815  elongation factor Ts  57.44 
 
 
204 aa  239  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299653  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1486  elongation factor Ts  52.75 
 
 
216 aa  238  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00196181 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2755  elongation factor Ts  55.84 
 
 
216 aa  238  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0741161  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0607  translation elongation factor Ts  54 
 
 
201 aa  238  4e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928696  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1428  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  56.41 
 
 
216 aa  238  5.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000020519  normal  0.0754659 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0443  elongation factor Ts  57.95 
 
 
215 aa  237  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000208997  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0743  translation elongation factor Ts  53.3 
 
 
197 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000548814  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0475  translation elongation factor Ts  54.59 
 
 
198 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000567359  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0199  elongation factor Ts  59.9 
 
 
197 aa  231  5e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000300429  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1660  elongation factor Ts  56.73 
 
 
204 aa  229  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000188674  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4960  translation elongation factor Ts  52.55 
 
 
198 aa  229  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0883  elongation factor Ts  60.51 
 
 
214 aa  229  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0283  elongation factor Ts  54.87 
 
 
219 aa  225  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.975706  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2923  translation elongation factor Ts  53.57 
 
 
200 aa  225  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.464491 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0294  elongation factor Ts  54.36 
 
 
219 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0272  elongation factor Ts  54.87 
 
 
219 aa  224  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1132  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  55.67 
 
 
198 aa  224  7e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1268  elongation factor Ts  55.84 
 
 
199 aa  224  8e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.890354  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1977  elongation factor Ts  59.49 
 
 
217 aa  223  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032588  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1187  elongation factor Ts  55.33 
 
 
199 aa  221  4e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000118419  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3708  elongation factor Ts  51.28 
 
 
217 aa  221  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0003434  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5314  translation elongation factor Ts  51.28 
 
 
218 aa  219  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4235  elongation factor Ts  56.12 
 
 
263 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023006 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1781  translation elongation factor Ts  54.74 
 
 
196 aa  215  5e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000010649  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0576  elongation factor Ts  57.36 
 
 
197 aa  214  5.9999999999999996e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000429292  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1779  translation elongation factor Ts  50 
 
 
210 aa  214  7e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1152  translation elongation factor Ts  54.08 
 
 
286 aa  214  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1005  elongation factor Ts  56.41 
 
 
215 aa  214  8e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000692768  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2579  elongation factor Ts  54.59 
 
 
249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3527  elongation factor Ts  54.59 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.84693  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1965  translation elongation factor Ts  52.63 
 
 
196 aa  209  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2531  elongation factor Ts  55.05 
 
 
221 aa  207  9e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.339571  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0294  elongation factor Ts  55.38 
 
 
219 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0828484  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1246  elongation factor Ts  48.98 
 
 
219 aa  204  7e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.794499  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08141  elongation factor Ts  49.75 
 
 
218 aa  202  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.119849  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0762  elongation factor Ts  48.73 
 
 
218 aa  202  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.670282  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08151  elongation factor Ts  49.24 
 
 
218 aa  201  6e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08301  elongation factor Ts  49.24 
 
 
218 aa  200  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10091  elongation factor Ts  48.76 
 
 
218 aa  200  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.136802 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16651  elongation factor Ts  48.22 
 
 
218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.521218 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1223  elongation factor Ts  48.98 
 
 
220 aa  198  6e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1160  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  50.51 
 
 
219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000237926 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1720  translation elongation factor Ts  51.27 
 
 
197 aa  194  7e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0158  elongation factor Ts  49.49 
 
 
218 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.496244  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07901  elongation factor Ts  49.49 
 
 
218 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.987366 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1399  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  48.68 
 
 
207 aa  191  9e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253635  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0956  translation elongation factor Ts  48.53 
 
 
221 aa  190  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4502  translation elongation factor Ts  51.32 
 
 
189 aa  188  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.231763  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49408  predicted protein  45.92 
 
 
440 aa  185  5e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3516  translation elongation factor Ts  49.49 
 
 
200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1162  translation elongation factor Ts  44.22 
 
 
259 aa  172  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0358  elongation factor Ts  46.94 
 
 
167 aa  169  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000023974  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3580  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  44.95 
 
 
204 aa  169  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0376  elongation factor Ts  46.43 
 
 
167 aa  168  6e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0834304  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_320  translation elongation factor Ts  46.43 
 
 
167 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00206685  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0526  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerisation  41.8 
 
 
177 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00005849  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  49.64 
 
 
311 aa  149  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2018  translation elongation factor Ts  41.75 
 
 
176 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.666479  hitchhiker  0.00383006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3926  translation elongation factor Ts  40.82 
 
 
176 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0719169 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  42.56 
 
 
313 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  43.36 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  39.27 
 
 
314 aa  129  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  46.62 
 
 
292 aa  129  3e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_7588  predicted protein  42.93 
 
 
202 aa  129  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.673567  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  38.01 
 
 
299 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1519  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerization  36.04 
 
 
152 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  41.26 
 
 
312 aa  123  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  42.45 
 
 
286 aa  122  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  42.55 
 
 
303 aa  121  7e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12260  translation elongation factor Ts  39.16 
 
 
288 aa  120  9.999999999999999e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000728312  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  38.75 
 
 
303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  38.75 
 
 
303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0673  translation elongation factor Ts  38.56 
 
 
292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  41.89 
 
 
294 aa  118  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  43.97 
 
 
288 aa  118  7.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  37.59 
 
 
303 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  31.27 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  30.91 
 
 
293 aa  115  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  47.58 
 
 
294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  30.18 
 
 
293 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  30.18 
 
 
293 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  30.18 
 
 
293 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  30.55 
 
 
293 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  30.55 
 
 
293 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  30.55 
 
 
293 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  30.55 
 
 
293 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  30.55 
 
 
293 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  30.18 
 
 
293 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  30.55 
 
 
294 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  30.55 
 
 
293 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>