More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4960 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4960  translation elongation factor Ts  100 
 
 
198 aa  397  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0579  translation elongation factor Ts  59.28 
 
 
202 aa  255  3e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0743  translation elongation factor Ts  58.97 
 
 
197 aa  251  7e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000548814  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1815  elongation factor Ts  58.25 
 
 
204 aa  250  8.000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299653  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1202  elongation factor Ts  57.65 
 
 
198 aa  249  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000235333  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1420  translation elongation factor Ts  59.79 
 
 
218 aa  246  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0106114  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0607  translation elongation factor Ts  56.06 
 
 
201 aa  244  6e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928696  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3212  translation elongation factor Ts  55.61 
 
 
216 aa  241  6e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000140585  hitchhiker  0.0000000047581 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1920  elongation factor Ts  55.61 
 
 
216 aa  240  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3708  elongation factor Ts  58.25 
 
 
217 aa  240  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0003434  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1660  elongation factor Ts  60.31 
 
 
204 aa  240  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000188674  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1428  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  55.79 
 
 
216 aa  238  4e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000020519  normal  0.0754659 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0443  elongation factor Ts  55.15 
 
 
215 aa  233  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000208997  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1033  elongation factor Ts  56.7 
 
 
203 aa  233  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000048083  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2755  elongation factor Ts  54.59 
 
 
216 aa  231  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0741161  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1486  elongation factor Ts  54.59 
 
 
216 aa  231  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00196181 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0883  elongation factor Ts  57.73 
 
 
214 aa  230  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1251  elongation factor Ts  54.59 
 
 
216 aa  229  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345397  hitchhiker  0.0000644664 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0565  elongation factor Ts  52.55 
 
 
219 aa  229  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0475  translation elongation factor Ts  53.33 
 
 
198 aa  228  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000567359  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3732  elongation factor Ts  54.59 
 
 
216 aa  225  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000229011  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1187  elongation factor Ts  56.12 
 
 
199 aa  224  9e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000118419  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1268  elongation factor Ts  56.63 
 
 
199 aa  224  9e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.890354  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1965  translation elongation factor Ts  55.73 
 
 
196 aa  223  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0199  elongation factor Ts  57.14 
 
 
197 aa  221  4.9999999999999996e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000300429  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0294  elongation factor Ts  52.55 
 
 
219 aa  218  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0283  elongation factor Ts  52.04 
 
 
219 aa  218  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.975706  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0786  elongation factor Ts  52.06 
 
 
196 aa  217  8.999999999999998e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0272  elongation factor Ts  52.04 
 
 
219 aa  217  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1977  elongation factor Ts  57.14 
 
 
217 aa  214  8e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1005  elongation factor Ts  56.19 
 
 
215 aa  214  8e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000692768  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1781  translation elongation factor Ts  53.09 
 
 
196 aa  212  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000010649  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2923  translation elongation factor Ts  50.25 
 
 
200 aa  211  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.464491 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5314  translation elongation factor Ts  51.28 
 
 
218 aa  208  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1779  translation elongation factor Ts  47.72 
 
 
210 aa  207  6e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1132  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  50.51 
 
 
198 aa  202  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1399  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  47.69 
 
 
207 aa  201  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253635  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0576  elongation factor Ts  52.55 
 
 
197 aa  200  9.999999999999999e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000429292  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0762  elongation factor Ts  51.02 
 
 
218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.670282  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08141  elongation factor Ts  50.51 
 
 
218 aa  198  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.119849  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2579  elongation factor Ts  49.23 
 
 
249 aa  198  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3527  elongation factor Ts  49.23 
 
 
250 aa  198  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.84693  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08151  elongation factor Ts  50.51 
 
 
218 aa  198  5e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2531  elongation factor Ts  50.77 
 
 
221 aa  197  9e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.339571  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4235  elongation factor Ts  47.69 
 
 
263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023006 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08301  elongation factor Ts  50.51 
 
 
218 aa  196  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1246  elongation factor Ts  48.47 
 
 
219 aa  194  8.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.794499  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1223  elongation factor Ts  49.49 
 
 
220 aa  193  1e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4502  translation elongation factor Ts  53.16 
 
 
189 aa  193  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.231763  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1152  translation elongation factor Ts  47.69 
 
 
286 aa  191  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0294  elongation factor Ts  52.55 
 
 
219 aa  189  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0828484  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16651  elongation factor Ts  49.23 
 
 
218 aa  189  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.521218 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0158  elongation factor Ts  48.47 
 
 
218 aa  185  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.496244  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07901  elongation factor Ts  48.47 
 
 
218 aa  185  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.987366 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0526  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerisation  48.22 
 
 
177 aa  184  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00005849  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3926  translation elongation factor Ts  50.77 
 
 
176 aa  184  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0719169 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2018  translation elongation factor Ts  49.23 
 
 
176 aa  182  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.666479  hitchhiker  0.00383006 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0956  translation elongation factor Ts  45.81 
 
 
221 aa  180  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3516  translation elongation factor Ts  47.47 
 
 
200 aa  180  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1720  translation elongation factor Ts  45.92 
 
 
197 aa  178  4.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1160  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  45.64 
 
 
219 aa  177  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000237926 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3580  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  47.47 
 
 
204 aa  176  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49408  predicted protein  46.84 
 
 
440 aa  174  8e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10091  elongation factor Ts  42.56 
 
 
218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.136802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1162  translation elongation factor Ts  44.95 
 
 
259 aa  171  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0358  elongation factor Ts  43.94 
 
 
167 aa  167  8e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000023974  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_320  translation elongation factor Ts  44.44 
 
 
167 aa  166  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00206685  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0376  elongation factor Ts  43.43 
 
 
167 aa  164  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0834304  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1519  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerization  41.33 
 
 
152 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  38.22 
 
 
313 aa  131  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  43.97 
 
 
288 aa  124  6e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_7588  predicted protein  47.15 
 
 
202 aa  124  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.673567  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  38.89 
 
 
311 aa  122  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  36.13 
 
 
314 aa  121  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  40.28 
 
 
303 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  39.38 
 
 
293 aa  119  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  43.57 
 
 
312 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  41.84 
 
 
288 aa  117  9e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  38.46 
 
 
287 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0407  translation elongation factor Ts  37.76 
 
 
355 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1441  elongation factor Ts  39.47 
 
 
354 aa  116  3e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  53.64 
 
 
294 aa  114  7.999999999999999e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  39.16 
 
 
286 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  38.46 
 
 
299 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  42.86 
 
 
294 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2009  elongation factor Ts  42.96 
 
 
288 aa  112  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  36.41 
 
 
277 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  49.54 
 
 
294 aa  112  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  37.86 
 
 
303 aa  111  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  35.35 
 
 
293 aa  111  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  41.01 
 
 
288 aa  111  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  46.51 
 
 
289 aa  111  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0548  elongation factor Ts  34.69 
 
 
357 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1315  elongation factor Ts  34.18 
 
 
357 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1093  elongation factor Ts  34.69 
 
 
358 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.569286  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1196  elongation factor Ts  34.18 
 
 
357 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1048  elongation factor Ts  46.53 
 
 
269 aa  109  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0760308  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  41.48 
 
 
294 aa  108  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  36.27 
 
 
292 aa  108  7.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  37.11 
 
 
296 aa  107  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>