More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2018 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2018  translation elongation factor Ts  100 
 
 		 176 aa  355  9.999999999999999e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.666479  hitchhiker  0.00383006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3926  translation elongation factor Ts  93.75 
 
 		 176 aa  337  4e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0719169 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0526  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerisation  63.53 
 
 		 177 aa  219  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00005849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5314  translation elongation factor Ts  47.98 
 
 		 218 aa  185  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4960  translation elongation factor Ts  49.23 
 
 		 198 aa  182  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0883  elongation factor Ts  54.12 
 
 		 214 aa  181  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3708  elongation factor Ts  48.73 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0003434  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1033  elongation factor Ts  48.97 
 
 		 203 aa  177  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000048083  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1202  elongation factor Ts  49.23 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000235333  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0294  elongation factor Ts  46.46 
 
 		 219 aa  174  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0199  elongation factor Ts  52.31 
 
 		 197 aa  174  6e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000300429  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0579  translation elongation factor Ts  50.25 
 
 		 202 aa  174  8e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0283  elongation factor Ts  45.96 
 
 		 219 aa  173  9e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.975706  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0272  elongation factor Ts  45.96 
 
 		 219 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1420  translation elongation factor Ts  47.21 
 
 		 218 aa  173  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0106114  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1660  elongation factor Ts  45.88 
 
 		 204 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000188674  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0786  elongation factor Ts  47.42 
 
 		 196 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08301  elongation factor Ts  47.47 
 
 		 218 aa  170  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1428  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  44.33 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000020519  normal  0.0754659 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1815  elongation factor Ts  47.94 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299653  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0607  translation elongation factor Ts  43.59 
 
 		 201 aa  168  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0443  elongation factor Ts  47.42 
 
 		 215 aa  167  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000208997  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0762  elongation factor Ts  46.46 
 
 		 218 aa  167  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.670282  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3212  translation elongation factor Ts  45.36 
 
 		 216 aa  167  8e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000140585  hitchhiker  0.0000000047581 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1977  elongation factor Ts  50.76 
 
 		 217 aa  167  9e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032588  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08151  elongation factor Ts  46.46 
 
 		 218 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08141  elongation factor Ts  46.46 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.119849  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1920  elongation factor Ts  44.85 
 
 		 216 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1268  elongation factor Ts  44.56 
 
 		 199 aa  164  4e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.890354  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0475  translation elongation factor Ts  41.12 
 
 		 198 aa  164  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000567359  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0576  elongation factor Ts  50 
 
 		 197 aa  164  5.9999999999999996e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000429292  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1779  translation elongation factor Ts  40 
 
 		 210 aa  164  6.9999999999999995e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1965  translation elongation factor Ts  48.19 
 
 		 196 aa  163  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1246  elongation factor Ts  44.95 
 
 		 219 aa  163  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.794499  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3527  elongation factor Ts  43.94 
 
 		 250 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.84693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2579  elongation factor Ts  43.94 
 
 		 249 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1251  elongation factor Ts  45.88 
 
 		 216 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345397  hitchhiker  0.0000644664 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4235  elongation factor Ts  45.73 
 
 		 263 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023006 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0743  translation elongation factor Ts  44.56 
 
 		 197 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000548814  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0376  elongation factor Ts  50 
 
 		 167 aa  160  7e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0834304  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1152  translation elongation factor Ts  46.97 
 
 		 286 aa  160  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0358  elongation factor Ts  50 
 
 		 167 aa  160  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000023974  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1187  elongation factor Ts  43.52 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000118419  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_320  translation elongation factor Ts  49.43 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00206685  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0158  elongation factor Ts  45.96 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.496244  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07901  elongation factor Ts  45.96 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.987366 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16651  elongation factor Ts  44.44 
 
 		 218 aa  157  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.521218 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1781  translation elongation factor Ts  47.15 
 
 		 196 aa  155  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000010649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3732  elongation factor Ts  41.75 
 
 		 216 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000229011  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2755  elongation factor Ts  41.75 
 
 		 216 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0741161  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2531  elongation factor Ts  43.72 
 
 		 221 aa  154  7e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.339571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1486  elongation factor Ts  41.75 
 
 		 216 aa  154  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00196181 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0294  elongation factor Ts  45.69 
 
 		 219 aa  153  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0828484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1223  elongation factor Ts  43.15 
 
 		 220 aa  153  1e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2923  translation elongation factor Ts  42.35 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.464491 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10091  elongation factor Ts  41.92 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.136802 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1132  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  40.5 
 
 		 198 aa  149  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1005  elongation factor Ts  47.94 
 
 		 215 aa  148  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000692768  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1160  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  40.2 
 
 		 219 aa  147  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000237926 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1519  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerization  47.67 
 
 		 152 aa  147  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0565  elongation factor Ts  41.75 
 
 		 219 aa  147  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1399  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  40.96 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253635  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4502  translation elongation factor Ts  41.8 
 
 		 189 aa  142  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.231763  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3516  translation elongation factor Ts  42.86 
 
 		 200 aa  140  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1720  translation elongation factor Ts  40 
 
 		 197 aa  137  6e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49408  predicted protein  38.78 
 
 		 440 aa  135  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0956  translation elongation factor Ts  37.81 
 
 		 221 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  39.66 
 
 		 313 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  40.12 
 
 		 314 aa  130  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  42.05 
 
 		 292 aa  125  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  42.94 
 
 		 294 aa  122  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1162  translation elongation factor Ts  38.61 
 
 		 259 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  44.12 
 
 		 293 aa  117  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1093  elongation factor Ts  41.71 
 
 		 358 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.569286  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  41.04 
 
 		 294 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3580  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  36.32 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  35.84 
 
 		 311 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1315  elongation factor Ts  38.64 
 
 		 357 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1196  elongation factor Ts  38.64 
 
 		 357 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0548  elongation factor Ts  40.91 
 
 		 357 aa  112  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  42.6 
 
 		 293 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  38.42 
 
 		 302 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  52 
 
 		 286 aa  108  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0407  translation elongation factor Ts  38.86 
 
 		 355 aa  107  6e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  43.27 
 
 		 292 aa  107  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  38.51 
 
 		 310 aa  106  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  40.57 
 
 		 289 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  41.38 
 
 		 308 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  40.23 
 
 		 308 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  39.31 
 
 		 290 aa  106  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  42.44 
 
 		 283 aa  106  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1441  elongation factor Ts  39.52 
 
 		 354 aa  106  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  39.66 
 
 		 293 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  39.66 
 
 		 293 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  39.66 
 
 		 293 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  39.66 
 
 		 293 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  39.66 
 
 		 293 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  39.66 
 
 		 293 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  39.66 
 
 		 293 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  39.66 
 
 		 294 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>