More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0407 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0407  translation elongation factor Ts  100 
 
 
355 aa  719    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1441  elongation factor Ts  67.61 
 
 
354 aa  509  1e-143  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1093  elongation factor Ts  66.95 
 
 
358 aa  491  1e-137  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.569286  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1261  elongation factor Ts  69.6 
 
 
354 aa  486  1e-136  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00427037  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0550  elongation factor Ts  68.88 
 
 
348 aa  474  1e-133  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00242368  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1196  elongation factor Ts  66.11 
 
 
357 aa  474  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1315  elongation factor Ts  65.55 
 
 
357 aa  471  1e-132  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0548  elongation factor Ts  65.55 
 
 
357 aa  474  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0839  elongation factor Ts  59.94 
 
 
352 aa  427  1e-118  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0656173  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1801  elongation factor Ts  53.26 
 
 
350 aa  363  2e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.450992  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1831  elongation factor Ts  48.7 
 
 
346 aa  293  2e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0135802  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0106  elongation factor Ts  48.17 
 
 
346 aa  291  1e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0802  elongation factor Ts  47.35 
 
 
341 aa  275  7e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000434061  hitchhiker  0.00000000000000232724 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2454  elongation factor Ts  45.43 
 
 
342 aa  267  2e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000114512  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04070  elongation factor Ts  42.86 
 
 
321 aa  259  5.0000000000000005e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1609  translation elongation factor Ts  42.26 
 
 
320 aa  251  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00132099  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0724  translation elongation factor Ts  44.86 
 
 
320 aa  248  1e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  40.97 
 
 
303 aa  219  6e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  40.69 
 
 
303 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  40.4 
 
 
310 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  37.07 
 
 
311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  39.39 
 
 
312 aa  213  4.9999999999999996e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  38.64 
 
 
303 aa  213  4.9999999999999996e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  37.43 
 
 
308 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  41.44 
 
 
307 aa  209  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  39.89 
 
 
312 aa  207  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  36.36 
 
 
313 aa  206  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  39.67 
 
 
309 aa  206  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl560  elongation factor Ts  38.92 
 
 
297 aa  204  2e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  39.09 
 
 
291 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  35.64 
 
 
314 aa  204  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  36.03 
 
 
308 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  36.03 
 
 
308 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  40.28 
 
 
303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  36.86 
 
 
300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  36.18 
 
 
294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  37.29 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  37.64 
 
 
310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  34.94 
 
 
293 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  35.34 
 
 
312 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  35.04 
 
 
307 aa  193  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  35.91 
 
 
308 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  34.76 
 
 
307 aa  192  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  37.12 
 
 
291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  35.9 
 
 
307 aa  189  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  36.46 
 
 
308 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  35.71 
 
 
307 aa  189  9e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  35.92 
 
 
305 aa  188  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  35.92 
 
 
305 aa  188  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  35.29 
 
 
292 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  35.57 
 
 
292 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1959  elongation factor Ts  39.66 
 
 
308 aa  187  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  36.86 
 
 
292 aa  188  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  35.75 
 
 
308 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  36.83 
 
 
310 aa  186  6e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  37.25 
 
 
301 aa  186  7e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  36.03 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  36.03 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  36.03 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  36.03 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  36.03 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  36.03 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  36.31 
 
 
283 aa  185  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  36.03 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  36.19 
 
 
308 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  36.03 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  38.27 
 
 
293 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  36.03 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  38.27 
 
 
293 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  34.28 
 
 
290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2074  elongation factor Ts  38.33 
 
 
306 aa  184  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0812187  normal  0.288352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2348  elongation factor Ts  38.33 
 
 
306 aa  184  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.474929 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  35.47 
 
 
285 aa  183  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  36.72 
 
 
292 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  35.75 
 
 
283 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  35.75 
 
 
283 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  35.75 
 
 
283 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  35.75 
 
 
283 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  34.47 
 
 
307 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  37.11 
 
 
294 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  35.47 
 
 
285 aa  182  8.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  34.56 
 
 
289 aa  182  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1370  elongation factor Ts  40.8 
 
 
308 aa  182  9.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  33.62 
 
 
291 aa  182  9.000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446628  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  36.83 
 
 
292 aa  181  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  35.21 
 
 
285 aa  181  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  35.21 
 
 
285 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  35.21 
 
 
285 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  35.47 
 
 
283 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  37.85 
 
 
291 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  34.37 
 
 
292 aa  181  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  36.44 
 
 
290 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  36.34 
 
 
294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1265  elongation factor Ts  36.16 
 
 
291 aa  179  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2034  elongation factor Ts  38.33 
 
 
306 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0653103 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  35.75 
 
 
283 aa  179  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  37.01 
 
 
292 aa  179  9e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  37.09 
 
 
286 aa  178  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  38.24 
 
 
295 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2065  elongation factor Ts  36.72 
 
 
292 aa  178  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>