More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1284 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  100 
 
 		 294 aa  580  1e-164  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  58.08 
 
 		 294 aa  340  2e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  58.42 
 
 		 293 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  57.89 
 
 		 292 aa  328  4e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  56.75 
 
 		 289 aa  324  8.000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  59.59 
 
 		 293 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  55.86 
 
 		 292 aa  321  9.999999999999999e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  51.92 
 
 		 291 aa  301  7.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  50.53 
 
 		 292 aa  295  4e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  50.18 
 
 		 292 aa  293  2e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  54.27 
 
 		 290 aa  291  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  50.35 
 
 		 302 aa  290  3e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  51.92 
 
 		 296 aa  288  9e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  51.92 
 
 		 296 aa  288  9e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  51.93 
 
 		 285 aa  285  7e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  50.88 
 
 		 285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  51.57 
 
 		 285 aa  281  7.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  51.57 
 
 		 285 aa  281  7.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  51.57 
 
 		 285 aa  281  7.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  51.71 
 
 		 292 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  51.71 
 
 		 292 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  51.86 
 
 		 291 aa  278  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  52.2 
 
 		 291 aa  273  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0942  elongation factor Ts  51.23 
 
 		 283 aa  272  5.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00345216  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  51.23 
 
 		 283 aa  271  7e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  51.23 
 
 		 283 aa  271  7e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  51.23 
 
 		 283 aa  271  7e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  51.23 
 
 		 283 aa  271  7e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  51.23 
 
 		 283 aa  271  7e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  51.23 
 
 		 283 aa  271  7e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  51.23 
 
 		 283 aa  271  7e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  51.23 
 
 		 283 aa  271  7e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  51.23 
 
 		 283 aa  271  7e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  50.53 
 
 		 283 aa  271  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3359  elongation factor Ts  50.88 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461306  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  51.41 
 
 		 283 aa  269  4e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  50.87 
 
 		 292 aa  268  5.9999999999999995e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  50.18 
 
 		 290 aa  268  7e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1554  elongation factor Ts  51.88 
 
 		 282 aa  268  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  50.53 
 
 		 283 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  50.53 
 
 		 283 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  50.53 
 
 		 283 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  50.53 
 
 		 283 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  50.18 
 
 		 283 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  49.64 
 
 		 293 aa  265  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  49.64 
 
 		 293 aa  264  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  49.29 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  49.29 
 
 		 294 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  49.29 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  49.82 
 
 		 290 aa  264  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  49.29 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  49.29 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  49.29 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  49.29 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  49.46 
 
 		 291 aa  263  3e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  49.13 
 
 		 292 aa  262  4.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  50.52 
 
 		 292 aa  262  6e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  49.67 
 
 		 307 aa  261  8.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  48.57 
 
 		 293 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2065  elongation factor Ts  50.17 
 
 		 292 aa  260  2e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  48.95 
 
 		 289 aa  260  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  48.77 
 
 		 283 aa  260  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  48.39 
 
 		 292 aa  258  7e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  51.03 
 
 		 291 aa  258  8e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  49.33 
 
 		 310 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  49.51 
 
 		 308 aa  255  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  50.16 
 
 		 308 aa  255  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  50.18 
 
 		 292 aa  255  6e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  48.21 
 
 		 293 aa  255  7e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  48.21 
 
 		 293 aa  255  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  47.14 
 
 		 293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  48.21 
 
 		 293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  48.21 
 
 		 293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  48.21 
 
 		 293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  49.84 
 
 		 308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  47.5 
 
 		 293 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  46.43 
 
 		 293 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0390  elongation factor Ts  50 
 
 		 294 aa  253  4.0000000000000004e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.432291  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  49.47 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  46.1 
 
 		 294 aa  251  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  49.82 
 
 		 290 aa  251  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0508  elongation factor Ts  47.33 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0459419  normal  0.717587 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  47.81 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  47.33 
 
 		 305 aa  249  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0351  elongation factor Ts  49.31 
 
 		 294 aa  249  3e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.556574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  47.33 
 
 		 305 aa  249  3e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  47.5 
 
 		 294 aa  249  3e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  47.84 
 
 		 303 aa  247  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  47.51 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2547  elongation factor Ts  51.25 
 
 		 306 aa  246  4e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  51.01 
 
 		 303 aa  246  4e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  49.31 
 
 		 293 aa  245  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  49.31 
 
 		 293 aa  245  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  51.01 
 
 		 303 aa  245  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1273  elongation factor Ts  47.74 
 
 		 286 aa  245  6.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00309579  normal  0.676189 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  47.5 
 
 		 292 aa  245  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  46 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  49.13 
 
 		 294 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1344  elongation factor Ts  47.44 
 
 		 287 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2177  elongation factor Ts  50 
 
 		 298 aa  243  3e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00688857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>