More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1693 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  100 
 
 
310 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2224  elongation factor Ts  74.76 
 
 
310 aa  425  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  65.27 
 
 
308 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  64.31 
 
 
308 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  64.31 
 
 
308 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  62.67 
 
 
307 aa  365  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  64.12 
 
 
300 aa  360  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  63.99 
 
 
308 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  61.67 
 
 
307 aa  356  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4828  elongation factor Ts  64.84 
 
 
307 aa  353  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0383674  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1697  elongation factor Ts  64.1 
 
 
307 aa  345  5e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2034  elongation factor Ts  63.4 
 
 
306 aa  339  4e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0653103 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2348  elongation factor Ts  61.76 
 
 
306 aa  330  3e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.474929 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2074  elongation factor Ts  61.76 
 
 
306 aa  330  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0812187  normal  0.288352 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3449  elongation factor Ts  61.36 
 
 
308 aa  329  4e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.190771  normal  0.488523 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  55.85 
 
 
307 aa  329  4e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  57.83 
 
 
307 aa  320  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  53.85 
 
 
307 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  53.38 
 
 
308 aa  317  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  55.31 
 
 
308 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  55.31 
 
 
308 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  56.19 
 
 
312 aa  313  2.9999999999999996e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4438  elongation factor Ts  59.87 
 
 
307 aa  311  6.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000816473 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  54.33 
 
 
310 aa  306  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  52.49 
 
 
307 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  54 
 
 
305 aa  301  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  54 
 
 
305 aa  301  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  56.31 
 
 
309 aa  297  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1959  elongation factor Ts  55 
 
 
308 aa  295  8e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  52.27 
 
 
301 aa  293  2e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  50.95 
 
 
312 aa  290  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  52.92 
 
 
296 aa  289  5.0000000000000004e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  49.03 
 
 
303 aa  288  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3195  translation elongation factor Ts  54.3 
 
 
308 aa  286  4e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1370  elongation factor Ts  56.42 
 
 
308 aa  281  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1695  elongation factor Ts  55.48 
 
 
301 aa  280  3e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  53.57 
 
 
291 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  52.6 
 
 
291 aa  267  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  49.68 
 
 
291 aa  263  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  48.85 
 
 
303 aa  244  9e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1511  elongation factor Ts  51.43 
 
 
298 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501204  normal  0.0222785 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  43.87 
 
 
292 aa  231  9e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1432  elongation factor Ts  50.63 
 
 
298 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  hitchhiker  0.00915816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2861  elongation factor Ts  50.63 
 
 
298 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  41.23 
 
 
311 aa  227  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  43.27 
 
 
294 aa  226  3e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  45.11 
 
 
313 aa  225  9e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  44.41 
 
 
303 aa  221  8e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  44.41 
 
 
303 aa  221  9e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  42.99 
 
 
294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  40.71 
 
 
310 aa  218  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0515  elongation factor Ts  40.99 
 
 
288 aa  217  2e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  44.26 
 
 
292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  44.88 
 
 
292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  43.1 
 
 
287 aa  216  5e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  43.09 
 
 
293 aa  215  8e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  44.84 
 
 
294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  41.82 
 
 
314 aa  213  3.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  41.48 
 
 
292 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  41.48 
 
 
292 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  42.81 
 
 
283 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  42.81 
 
 
283 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  42.81 
 
 
283 aa  212  7.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  42.81 
 
 
283 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  42.81 
 
 
283 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  42.81 
 
 
283 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  42.81 
 
 
283 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  42.81 
 
 
283 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  43.69 
 
 
285 aa  212  7.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  42.81 
 
 
283 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  44.01 
 
 
285 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  45.3 
 
 
286 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  44.63 
 
 
292 aa  211  1e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  39.61 
 
 
289 aa  210  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  42.17 
 
 
292 aa  209  5e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  39.66 
 
 
288 aa  208  9e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0531  elongation factor Ts  40.28 
 
 
286 aa  208  1e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0516  elongation factor Ts  39.58 
 
 
288 aa  207  2e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.203151  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  42.35 
 
 
293 aa  206  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2065  elongation factor Ts  43.97 
 
 
292 aa  207  3e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  44.26 
 
 
293 aa  206  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  44.26 
 
 
293 aa  206  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  41.5 
 
 
283 aa  205  7e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  42.35 
 
 
283 aa  205  9e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0390  elongation factor Ts  43.89 
 
 
294 aa  205  9e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.432291  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  43.23 
 
 
292 aa  204  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  43.69 
 
 
295 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  44.01 
 
 
295 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  43.69 
 
 
295 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  41.5 
 
 
283 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1315  elongation factor Ts  37.4 
 
 
357 aa  204  2e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0351  elongation factor Ts  43.56 
 
 
294 aa  204  2e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.556574  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  41.5 
 
 
283 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  41.5 
 
 
283 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  41.5 
 
 
283 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  41.5 
 
 
283 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1196  elongation factor Ts  37.4 
 
 
357 aa  204  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  44.01 
 
 
295 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  38.64 
 
 
292 aa  203  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  40.07 
 
 
312 aa  202  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>