More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1965 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1965  translation elongation factor Ts  100 
 
 		 196 aa  394  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1781  translation elongation factor Ts  89.29 
 
 		 196 aa  356  9.999999999999999e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000010649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1815  elongation factor Ts  64.1 
 
 		 204 aa  258  5.0000000000000005e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299653  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1202  elongation factor Ts  62.83 
 
 		 198 aa  243  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000235333  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1420  translation elongation factor Ts  59.26 
 
 		 218 aa  230  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0106114  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0743  translation elongation factor Ts  55.5 
 
 		 197 aa  227  7e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000548814  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4960  translation elongation factor Ts  55.73 
 
 		 198 aa  223  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0579  translation elongation factor Ts  57.14 
 
 		 202 aa  221  4.9999999999999996e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0786  elongation factor Ts  55.9 
 
 		 196 aa  221  4.9999999999999996e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1132  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  55.79 
 
 		 198 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0607  translation elongation factor Ts  54.5 
 
 		 201 aa  218  3.9999999999999997e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0443  elongation factor Ts  55.38 
 
 		 215 aa  217  7.999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000208997  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1428  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  50.77 
 
 		 216 aa  213  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000020519  normal  0.0754659 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3708  elongation factor Ts  55.79 
 
 		 217 aa  212  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0003434  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1660  elongation factor Ts  54.36 
 
 		 204 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000188674  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2923  translation elongation factor Ts  51.56 
 
 		 200 aa  209  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.464491 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0565  elongation factor Ts  52.63 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3732  elongation factor Ts  53.16 
 
 		 216 aa  209  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000229011  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1005  elongation factor Ts  57.44 
 
 		 215 aa  207  6e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000692768  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3212  translation elongation factor Ts  52.91 
 
 		 216 aa  207  7e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000140585  hitchhiker  0.0000000047581 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1033  elongation factor Ts  52.82 
 
 		 203 aa  206  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000048083  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1920  elongation factor Ts  53.16 
 
 		 216 aa  206  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2755  elongation factor Ts  51.58 
 
 		 216 aa  204  6e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0741161  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1187  elongation factor Ts  53.44 
 
 		 199 aa  204  7e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000118419  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1251  elongation factor Ts  52.63 
 
 		 216 aa  203  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345397  hitchhiker  0.0000644664 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1486  elongation factor Ts  51.05 
 
 		 216 aa  203  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00196181 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0199  elongation factor Ts  53.93 
 
 		 197 aa  202  2e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000300429  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0475  translation elongation factor Ts  48.15 
 
 		 198 aa  202  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000567359  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1268  elongation factor Ts  53.44 
 
 		 199 aa  202  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.890354  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1399  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  51.81 
 
 		 207 aa  202  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253635  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1977  elongation factor Ts  57.67 
 
 		 217 aa  201  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032588  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0283  elongation factor Ts  55.03 
 
 		 219 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.975706  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1779  translation elongation factor Ts  49.47 
 
 		 210 aa  201  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0294  elongation factor Ts  54.5 
 
 		 219 aa  201  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0272  elongation factor Ts  55.03 
 
 		 219 aa  201  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5314  translation elongation factor Ts  52.38 
 
 		 218 aa  201  8e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0576  elongation factor Ts  56.08 
 
 		 197 aa  197  6e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000429292  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08301  elongation factor Ts  52.63 
 
 		 218 aa  194  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0883  elongation factor Ts  53.33 
 
 		 214 aa  194  7e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4235  elongation factor Ts  50 
 
 		 263 aa  194  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023006 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1223  elongation factor Ts  51.58 
 
 		 220 aa  192  2e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1246  elongation factor Ts  50.53 
 
 		 219 aa  192  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.794499  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08141  elongation factor Ts  52.63 
 
 		 218 aa  191  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.119849  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0762  elongation factor Ts  52.11 
 
 		 218 aa  191  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.670282  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08151  elongation factor Ts  52.11 
 
 		 218 aa  190  9e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0294  elongation factor Ts  55.56 
 
 		 219 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0828484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16651  elongation factor Ts  51.58 
 
 		 218 aa  190  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.521218 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1720  translation elongation factor Ts  50.52 
 
 		 197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2531  elongation factor Ts  50.53 
 
 		 221 aa  188  5e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.339571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1152  translation elongation factor Ts  51.58 
 
 		 286 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10091  elongation factor Ts  48.95 
 
 		 218 aa  181  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.136802 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3580  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  50.26 
 
 		 204 aa  181  8.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2579  elongation factor Ts  47.12 
 
 		 249 aa  177  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3527  elongation factor Ts  47.12 
 
 		 250 aa  177  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.84693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4502  translation elongation factor Ts  50.53 
 
 		 189 aa  176  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.231763  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0956  translation elongation factor Ts  45.41 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0526  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerisation  49.22 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00005849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1160  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  46.6 
 
 		 219 aa  173  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000237926 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0158  elongation factor Ts  48.69 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.496244  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07901  elongation factor Ts  48.69 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.987366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1162  translation elongation factor Ts  47.67 
 
 		 259 aa  171  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3516  translation elongation factor Ts  47.94 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49408  predicted protein  46.6 
 
 		 440 aa  166  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3926  translation elongation factor Ts  47.4 
 
 		 176 aa  163  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0719169 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2018  translation elongation factor Ts  48.19 
 
 		 176 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.666479  hitchhiker  0.00383006 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0358  elongation factor Ts  45.31 
 
 		 167 aa  157  1e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000023974  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0376  elongation factor Ts  44.56 
 
 		 167 aa  155  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0834304  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_320  translation elongation factor Ts  44.27 
 
 		 167 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00206685  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  42.96 
 
 		 286 aa  138  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  43.97 
 
 		 287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  47.14 
 
 		 267 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_7588  predicted protein  43.52 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.673567  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  43.88 
 
 		 314 aa  121  7e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1519  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerization  38.74 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  44.53 
 
 		 294 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  36.7 
 
 		 311 aa  117  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  38.83 
 
 		 292 aa  118  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1048  elongation factor Ts  42.93 
 
 		 269 aa  117  7.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0760308  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  41.73 
 
 		 288 aa  117  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  36.56 
 
 		 313 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  42.03 
 
 		 299 aa  115  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  44.6 
 
 		 292 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  43.17 
 
 		 312 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  46.15 
 
 		 292 aa  115  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  47.18 
 
 		 294 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  41.73 
 
 		 294 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  43.15 
 
 		 294 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  40.58 
 
 		 303 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  40.58 
 
 		 303 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0548  elongation factor Ts  37.37 
 
 		 357 aa  112  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0550  elongation factor Ts  38.8 
 
 		 348 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00242368  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1093  elongation factor Ts  36.98 
 
 		 358 aa  111  7.000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.569286  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  35.42 
 
 		 286 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1315  elongation factor Ts  36.84 
 
 		 357 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  44.12 
 
 		 291 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  41.79 
 
 		 273 aa  110  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  44.2 
 
 		 292 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1196  elongation factor Ts  36.84 
 
 		 357 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  38.82 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  42.65 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>