More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1251 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1251  elongation factor Ts  100 
 
 
216 aa  434  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345397  hitchhiker  0.0000644664 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1920  elongation factor Ts  87.5 
 
 
216 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3732  elongation factor Ts  87.5 
 
 
216 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000229011  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2755  elongation factor Ts  84.65 
 
 
216 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0741161  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1486  elongation factor Ts  84.65 
 
 
216 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00196181 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1420  translation elongation factor Ts  65.42 
 
 
218 aa  297  8e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0106114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3212  translation elongation factor Ts  65.4 
 
 
216 aa  296  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000140585  hitchhiker  0.0000000047581 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0283  elongation factor Ts  66.36 
 
 
219 aa  290  1e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.975706  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0294  elongation factor Ts  65.89 
 
 
219 aa  289  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0272  elongation factor Ts  66.36 
 
 
219 aa  289  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1977  elongation factor Ts  68.1 
 
 
217 aa  281  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032588  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0579  translation elongation factor Ts  65.48 
 
 
202 aa  274  6e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1428  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  59.52 
 
 
216 aa  273  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000020519  normal  0.0754659 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0443  elongation factor Ts  63.46 
 
 
215 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000208997  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3708  elongation factor Ts  59.13 
 
 
217 aa  267  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0003434  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2923  translation elongation factor Ts  62.76 
 
 
200 aa  264  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.464491 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5314  translation elongation factor Ts  57.21 
 
 
218 aa  263  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1005  elongation factor Ts  65.87 
 
 
215 aa  263  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000692768  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1033  elongation factor Ts  61.19 
 
 
203 aa  262  3e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000048083  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0883  elongation factor Ts  63.81 
 
 
214 aa  262  3e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1815  elongation factor Ts  61.31 
 
 
204 aa  261  4e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299653  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0607  translation elongation factor Ts  60.1 
 
 
201 aa  260  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928696  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0565  elongation factor Ts  60.41 
 
 
219 aa  256  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1779  translation elongation factor Ts  60.71 
 
 
210 aa  256  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1660  elongation factor Ts  62.94 
 
 
204 aa  255  4e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000188674  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0743  translation elongation factor Ts  61.42 
 
 
197 aa  254  7e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000548814  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0475  translation elongation factor Ts  57.65 
 
 
198 aa  252  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000567359  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0294  elongation factor Ts  63.08 
 
 
219 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0828484  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4235  elongation factor Ts  56.4 
 
 
263 aa  248  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023006 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1152  translation elongation factor Ts  55.14 
 
 
286 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08301  elongation factor Ts  55.19 
 
 
218 aa  244  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0762  elongation factor Ts  53.77 
 
 
218 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.670282  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08151  elongation factor Ts  54.25 
 
 
218 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3527  elongation factor Ts  53.74 
 
 
250 aa  241  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.84693  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2579  elongation factor Ts  53.74 
 
 
249 aa  242  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1132  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  56.41 
 
 
198 aa  241  6e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08141  elongation factor Ts  53.77 
 
 
218 aa  240  9e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.119849  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1160  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  53.49 
 
 
219 aa  240  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000237926 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1202  elongation factor Ts  55.33 
 
 
198 aa  238  2.9999999999999997e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000235333  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0786  elongation factor Ts  56.41 
 
 
196 aa  237  8e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1223  elongation factor Ts  51.89 
 
 
220 aa  233  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16651  elongation factor Ts  51.18 
 
 
218 aa  232  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.521218 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2531  elongation factor Ts  53.66 
 
 
221 aa  232  3e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.339571  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10091  elongation factor Ts  50.71 
 
 
218 aa  231  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.136802 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1246  elongation factor Ts  50 
 
 
219 aa  231  7.000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.794499  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1187  elongation factor Ts  54.04 
 
 
199 aa  230  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000118419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4960  translation elongation factor Ts  54.59 
 
 
198 aa  230  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1268  elongation factor Ts  54.04 
 
 
199 aa  228  6e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.890354  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0199  elongation factor Ts  58.38 
 
 
197 aa  224  9e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000300429  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07901  elongation factor Ts  50.24 
 
 
218 aa  224  9e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.987366 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0158  elongation factor Ts  50.24 
 
 
218 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.496244  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  68.94 
 
 
311 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0576  elongation factor Ts  56.85 
 
 
197 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000429292  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49408  predicted protein  48.15 
 
 
440 aa  210  1e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0956  translation elongation factor Ts  47.95 
 
 
221 aa  207  7e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  66.67 
 
 
312 aa  204  9e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4502  translation elongation factor Ts  55.56 
 
 
189 aa  203  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.231763  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1965  translation elongation factor Ts  52.63 
 
 
196 aa  204  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1781  translation elongation factor Ts  53.16 
 
 
196 aa  201  5e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000010649  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1720  translation elongation factor Ts  47.21 
 
 
197 aa  190  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1399  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  47.62 
 
 
207 aa  189  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253635  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3516  translation elongation factor Ts  49.75 
 
 
200 aa  188  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3580  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  47.45 
 
 
204 aa  185  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1162  translation elongation factor Ts  45.92 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  53.21 
 
 
303 aa  167  8e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  45.08 
 
 
313 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2018  translation elongation factor Ts  45.88 
 
 
176 aa  162  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.666479  hitchhiker  0.00383006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3926  translation elongation factor Ts  45.36 
 
 
176 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0719169 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  50.32 
 
 
303 aa  159  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0526  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerisation  41.27 
 
 
177 aa  155  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00005849  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_320  translation elongation factor Ts  42.35 
 
 
167 aa  155  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00206685  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  41.41 
 
 
314 aa  154  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0358  elongation factor Ts  41.62 
 
 
167 aa  153  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000023974  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0376  elongation factor Ts  41.62 
 
 
167 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0834304  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  48.95 
 
 
287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  44.59 
 
 
303 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  44.59 
 
 
303 aa  145  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1519  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerization  41.12 
 
 
152 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  50 
 
 
292 aa  143  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  45.12 
 
 
300 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_7588  predicted protein  45.67 
 
 
202 aa  143  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.673567  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  45.07 
 
 
286 aa  139  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  38.59 
 
 
299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  46.84 
 
 
294 aa  138  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  43.98 
 
 
310 aa  137  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  44.3 
 
 
294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  44.37 
 
 
295 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  44.37 
 
 
295 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  43.64 
 
 
308 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  43.64 
 
 
308 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  43.05 
 
 
294 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  45.03 
 
 
295 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  45.03 
 
 
295 aa  132  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  45.03 
 
 
295 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  45.03 
 
 
295 aa  132  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  45.03 
 
 
295 aa  132  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  44.44 
 
 
308 aa  132  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  45.03 
 
 
295 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  45.03 
 
 
295 aa  132  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  45.03 
 
 
295 aa  132  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>