More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0568 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  100 
 
 
293 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  65.65 
 
 
293 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  64.51 
 
 
289 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  64.85 
 
 
292 aa  374  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  63.14 
 
 
291 aa  367  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  61.3 
 
 
292 aa  357  9.999999999999999e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  62.33 
 
 
294 aa  355  6.999999999999999e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  56.55 
 
 
292 aa  334  1e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  56.21 
 
 
292 aa  331  8e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  56.01 
 
 
302 aa  322  3e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  60.14 
 
 
294 aa  317  1e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  55.89 
 
 
292 aa  312  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  55.89 
 
 
292 aa  312  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  53.24 
 
 
290 aa  294  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  55.48 
 
 
285 aa  292  4e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  55.14 
 
 
285 aa  291  9e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  53.61 
 
 
292 aa  290  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  54.95 
 
 
285 aa  290  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  54.95 
 
 
285 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  54.95 
 
 
285 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  52.38 
 
 
296 aa  286  2e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  52.38 
 
 
296 aa  286  2e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  53 
 
 
290 aa  281  6.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  50.51 
 
 
289 aa  280  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  53.61 
 
 
292 aa  279  3e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  52.11 
 
 
292 aa  275  8e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1554  elongation factor Ts  54.08 
 
 
282 aa  274  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  53.61 
 
 
283 aa  273  3e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  53.61 
 
 
283 aa  273  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  53.61 
 
 
283 aa  273  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  53.61 
 
 
283 aa  273  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  53.61 
 
 
283 aa  273  3e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  53.61 
 
 
283 aa  273  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  55.07 
 
 
303 aa  273  3e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  55.07 
 
 
303 aa  273  3e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  53.61 
 
 
283 aa  273  3e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  53.61 
 
 
283 aa  273  3e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  53.61 
 
 
283 aa  273  3e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  51.42 
 
 
290 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38980  elongation factor Ts  52.48 
 
 
289 aa  272  5.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  53.08 
 
 
283 aa  272  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  53.08 
 
 
283 aa  272  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  53.08 
 
 
283 aa  272  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  53.08 
 
 
283 aa  272  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0942  elongation factor Ts  52.58 
 
 
283 aa  271  7e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00345216  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2065  elongation factor Ts  53.26 
 
 
292 aa  271  7e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  52.23 
 
 
283 aa  271  9e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  52.74 
 
 
283 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  49.64 
 
 
292 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3359  elongation factor Ts  52.23 
 
 
283 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461306  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  50.53 
 
 
293 aa  269  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  52.4 
 
 
283 aa  267  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  51.3 
 
 
310 aa  265  5e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  50.36 
 
 
291 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  50.71 
 
 
290 aa  265  7e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  49.47 
 
 
293 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  49.47 
 
 
293 aa  264  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1273  elongation factor Ts  48.8 
 
 
286 aa  263  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00309579  normal  0.676189 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  52.04 
 
 
294 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  49.11 
 
 
293 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1535  translation elongation factor Ts  50.51 
 
 
287 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  49.11 
 
 
293 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1344  elongation factor Ts  50.17 
 
 
287 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  49.11 
 
 
293 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  49.11 
 
 
293 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  49.11 
 
 
293 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  49.11 
 
 
293 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  49.11 
 
 
293 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  52.04 
 
 
294 aa  258  7e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  48.75 
 
 
293 aa  258  9e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  48.75 
 
 
293 aa  258  9e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  48.75 
 
 
293 aa  258  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  48.75 
 
 
293 aa  258  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  48.75 
 
 
293 aa  258  9e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  48.75 
 
 
293 aa  258  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1102  elongation factor Ts  49.66 
 
 
287 aa  257  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.433956  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  48.75 
 
 
294 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  52.11 
 
 
283 aa  258  1e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1140  elongation factor Ts  52.22 
 
 
283 aa  258  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000133846  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1484  elongation factor Ts  52.1 
 
 
289 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113842  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  48.4 
 
 
293 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0390  elongation factor Ts  48.61 
 
 
294 aa  257  2e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.432291  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17070  elongation factor Ts  52.1 
 
 
289 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0351  elongation factor Ts  49.31 
 
 
294 aa  256  3e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.556574  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  52.03 
 
 
295 aa  256  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  48.33 
 
 
307 aa  256  4e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1850  elongation factor Ts  54.7 
 
 
280 aa  254  8e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000427669  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  51.69 
 
 
295 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3052  elongation factor Ts  50.88 
 
 
287 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.204992  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2547  elongation factor Ts  52.13 
 
 
306 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  51.69 
 
 
295 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  51.35 
 
 
295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  51.35 
 
 
295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  51.35 
 
 
295 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  51.35 
 
 
295 aa  253  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  51.35 
 
 
295 aa  253  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  51.35 
 
 
295 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  50.18 
 
 
292 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  51.35 
 
 
295 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  51.01 
 
 
295 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>