More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4502 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4502  translation elongation factor Ts  100 
 
 		 189 aa  385  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.231763  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1428  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  58.73 
 
 		 216 aa  246  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000020519  normal  0.0754659 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1420  translation elongation factor Ts  55.79 
 
 		 218 aa  234  4e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0106114  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1920  elongation factor Ts  56.61 
 
 		 216 aa  231  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0579  translation elongation factor Ts  55.79 
 
 		 202 aa  229  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1033  elongation factor Ts  55.56 
 
 		 203 aa  229  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000048083  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1660  elongation factor Ts  58.2 
 
 		 204 aa  229  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000188674  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1815  elongation factor Ts  53.16 
 
 		 204 aa  228  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299653  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3212  translation elongation factor Ts  52.63 
 
 		 216 aa  227  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000140585  hitchhiker  0.0000000047581 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0283  elongation factor Ts  55.26 
 
 		 219 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.975706  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1202  elongation factor Ts  54.21 
 
 		 198 aa  225  3e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000235333  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0294  elongation factor Ts  54.74 
 
 		 219 aa  225  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0272  elongation factor Ts  55.26 
 
 		 219 aa  225  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3732  elongation factor Ts  55.03 
 
 		 216 aa  224  6e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000229011  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1251  elongation factor Ts  55.56 
 
 		 216 aa  222  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345397  hitchhiker  0.0000644664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2755  elongation factor Ts  53.44 
 
 		 216 aa  221  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0741161  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1486  elongation factor Ts  53.44 
 
 		 216 aa  221  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00196181 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3708  elongation factor Ts  53.97 
 
 		 217 aa  221  7e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0003434  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1005  elongation factor Ts  55.79 
 
 		 215 aa  219  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000692768  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0607  translation elongation factor Ts  51.05 
 
 		 201 aa  218  5e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928696  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1187  elongation factor Ts  53.19 
 
 		 199 aa  216  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000118419  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0443  elongation factor Ts  51.58 
 
 		 215 aa  216  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000208997  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1268  elongation factor Ts  53.19 
 
 		 199 aa  215  4e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.890354  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5314  translation elongation factor Ts  52.63 
 
 		 218 aa  214  7e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0294  elongation factor Ts  58.95 
 
 		 219 aa  213  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0828484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4960  translation elongation factor Ts  53.16 
 
 		 198 aa  211  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0475  translation elongation factor Ts  51.05 
 
 		 198 aa  211  3.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000567359  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0565  elongation factor Ts  51.32 
 
 		 219 aa  209  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1977  elongation factor Ts  52.63 
 
 		 217 aa  209  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032588  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0743  translation elongation factor Ts  51.6 
 
 		 197 aa  206  1e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000548814  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0576  elongation factor Ts  57.37 
 
 		 197 aa  205  3e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000429292  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1399  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  51.6 
 
 		 207 aa  203  9e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253635  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0883  elongation factor Ts  51.58 
 
 		 214 aa  203  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4235  elongation factor Ts  49.74 
 
 		 263 aa  201  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023006 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1132  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  49.74 
 
 		 198 aa  201  8e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3527  elongation factor Ts  51.05 
 
 		 250 aa  200  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.84693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2579  elongation factor Ts  51.05 
 
 		 249 aa  199  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0786  elongation factor Ts  47.89 
 
 		 196 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2923  translation elongation factor Ts  49.21 
 
 		 200 aa  199  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.464491 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1965  translation elongation factor Ts  50.53 
 
 		 196 aa  197  7.999999999999999e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1779  translation elongation factor Ts  47.64 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08301  elongation factor Ts  50.26 
 
 		 218 aa  194  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0762  elongation factor Ts  49.74 
 
 		 218 aa  193  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.670282  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0199  elongation factor Ts  53.16 
 
 		 197 aa  192  3e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000300429  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08141  elongation factor Ts  49.21 
 
 		 218 aa  191  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.119849  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08151  elongation factor Ts  49.21 
 
 		 218 aa  191  6e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1781  translation elongation factor Ts  48.95 
 
 		 196 aa  191  8e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000010649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1152  translation elongation factor Ts  49.21 
 
 		 286 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3516  translation elongation factor Ts  47.37 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1160  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  45.55 
 
 		 219 aa  184  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000237926 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16651  elongation factor Ts  47.12 
 
 		 218 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.521218 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1246  elongation factor Ts  46.6 
 
 		 219 aa  181  4.0000000000000006e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.794499  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0956  translation elongation factor Ts  43.65 
 
 		 221 aa  181  5.0000000000000004e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0158  elongation factor Ts  47.64 
 
 		 218 aa  181  6e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.496244  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07901  elongation factor Ts  47.64 
 
 		 218 aa  181  6e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.987366 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2531  elongation factor Ts  46.6 
 
 		 221 aa  181  7e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.339571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1223  elongation factor Ts  45.55 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1720  translation elongation factor Ts  49.21 
 
 		 197 aa  174  6e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3580  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  46.11 
 
 		 204 aa  173  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10091  elongation factor Ts  43.98 
 
 		 218 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.136802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1162  translation elongation factor Ts  45.6 
 
 		 259 aa  171  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49408  predicted protein  45.03 
 
 		 440 aa  167  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0358  elongation factor Ts  44.68 
 
 		 167 aa  164  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000023974  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_320  translation elongation factor Ts  43.32 
 
 		 167 aa  164  9e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00206685  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0376  elongation factor Ts  43.62 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0834304  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2018  translation elongation factor Ts  42.02 
 
 		 176 aa  154  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.666479  hitchhiker  0.00383006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3926  translation elongation factor Ts  42.02 
 
 		 176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0719169 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0526  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerisation  39.15 
 
 		 177 aa  145  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00005849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  41.18 
 
 		 313 aa  142  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  37.84 
 
 		 314 aa  129  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1519  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerization  38.38 
 
 		 152 aa  127  9.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  35.87 
 
 		 311 aa  124  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  38.51 
 
 		 303 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  38.51 
 
 		 303 aa  121  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  39.86 
 
 		 286 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0673  translation elongation factor Ts  37.44 
 
 		 292 aa  115  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  35.95 
 
 		 299 aa  115  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  42.25 
 
 		 288 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  41.3 
 
 		 312 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  38.57 
 
 		 287 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  34.41 
 
 		 293 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  34.97 
 
 		 294 aa  105  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  36.26 
 
 		 276 aa  105  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  35.29 
 
 		 302 aa  104  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  34.41 
 
 		 292 aa  104  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0407  translation elongation factor Ts  34.92 
 
 		 355 aa  102  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0706  translation elongation factor Ts  34.41 
 
 		 290 aa  103  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000134038  unclonable  0.0000000259641 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  33.87 
 
 		 293 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  33.87 
 
 		 293 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  33.87 
 
 		 293 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  33.87 
 
 		 293 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  33.87 
 
 		 294 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  33.87 
 
 		 293 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  35.91 
 
 		 279 aa  102  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  33.87 
 
 		 293 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  33.87 
 
 		 293 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  34.76 
 
 		 277 aa  102  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  35.16 
 
 		 294 aa  102  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  37.32 
 
 		 267 aa  102  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  34.78 
 
 		 310 aa  102  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>